EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR014-18534 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Melanoma 
Coordinate
chr6:50557327-50558246 
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HOXC11MA0651.1chr6:50557747-50557758GGTCGTAAAAA+6.32
HOXC12MA0906.1chr6:50557747-50557758GGTCGTAAAAA+6.62
HOXD10MA1506.1chr6:50557747-50557758GGTCGTAAAAA+6.14
HOXD11MA0908.1chr6:50557748-50557758GTCGTAAAAA+6.02
HOXD12MA0873.1chr6:50557747-50557758GGTCGTAAAAA+6.14
LMX1BMA0703.2chr6:50557373-50557384AATTTAATTAA+6.32
PHOX2AMA0713.1chr6:50557372-50557383TAATTTAATTA+6.62
PROP1MA0715.1chr6:50557372-50557383TAATTTAATTA-6.32
PROP1MA0715.1chr6:50557372-50557383TAATTTAATTA+6.62
Phox2bMA0681.1chr6:50557372-50557383TAATTTAATTA+6.62
Enhancer Sequence
TGAAATGCAA TTGGGTAAGA ACAATCGTAA CATTTGTCAA CCTCATAATT TAATTAAACC 60
CATTTTATGG TGATATTGTG TCACAACACA TGAAACGCAT CACTTTATCA GCCGTTATCG 120
CAATGTGAGG AATTGTTAAC GCAATTTTAG GAGGGTTGTA ATAAAACACA CACTCCATTG 180
ACAAACTGAC AAAACGCCTT CTTCATACTG GGATGAAGTC CAAAAGCAGT AAGTCATATG 240
ACACTGCTTA ACCATAATGC CTACAGGATA TTTAACCGAT CCACACTTCA AACACAACCC 300
TGGTGACTTA TTAACTCATT TATTGTACAG TAAGTATAAT AACAGTGGTG TCACGTCAAG 360
AGTTTGTGCT GAATAGGTCG GCAAACAGAA AGCGTGTGCG CGAGTTAATC TAACGGTTAG 420
GGTCGTAAAA ACATTTCCTC CCTGAAGGTG TGGATTGCAA CAGATGCTTC AAGGGGGGTT 480
AAACTCTCAT TCATAAACAC ATAACTCTCT GTTTATGACC AGCCTGCTTA TTATGAAGAC 540
TTAAAAGGAT TGACTACAAA GAAAGAAACT TCTGTCATTA TTTACTCACC CTCATGTCAC 600
CCCAGATCCG ATTAACTTTC TTTTTCTGTG AAAGACAAAG GAAACGATGA GAAAATAATA 660
ATCTTTTCCT GTAATTTTAA TCAATAAGTG ATTAAACTGT TAAGCTTTGA AAAACTGTGT 720
TCAATGGAAT CAGTTTATAT GACTCATCTG TTAAATTAAT AATTCTCTTG AAGACATACA 780
ATAGCATTGA ATAGGAAGCC GGTGTAATTT TAGTATCACT GAGAGAGTTT TATTGTGCAG 840
AATTTTCTGT TCATTTGAGG TAATAAAATT CAGGATATGA GTTTTTAGTT GTAGTTGTTC 900
AAATAAGATT AAACTAAAT 919