EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR014-15664 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Melanoma 
Coordinate
chr3:50959060-50960468 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CDX1MA0878.2chr3:50959350-50959361GTTTTATTGCC-6.32
CDX4MA1473.1chr3:50959350-50959361GTTTTATTGCC-6.62
HOXD9MA0913.2chr3:50959350-50959360GTTTTATTGC-6.02
Enhancer Sequence
AATGTAAATT AAACTTGCAA AAAGTCACAG TTATACACAA TTTATTTTTA ACCCTGATTA 60
AACTGATTGA GTCCTTCCGG CTTGTTTGAA ACCTACAGGT ATGTTAAAGC AAGGTTGGAA 120
ATAAACTCTG TGGCCCTCCA GGAACTGCAT TTAATGTGCA TCTGGATTCA GTCCACTTGA 180
TGGTCATGGA CACACAGAGA TACAGTGTAC CAGGATACAA ATGTTCATCT AAAGGAGAGT 240
GCCCAGACTC TGTCCTGGAG GGCTGGTGTC CTTCAAAGTT TAGTTCCAGA GTTTTATTGC 300
CAACCTGACA ATACATTTAC AGTATGCTAG TTAGAGCTTA AGTAGTTGTT TCATGTGTGC 360
CTAATTGGGG TTTGAGCTAT ACTCTGCAGG ACAAAACTGC TTTGAGGTTA CAGTGAATGT 420
GAATCATTGG TAAATAGGTG CATTCAATCG GTACCCCACA GGAACAAACA ATACACCATT 480
TATGGCTAGT TTTTGATGAA ATATTACTTA TCTTGTTTTC ACACTAAAAG TTTTTCTAAT 540
GTATTTATTG TTTGTTTGTA TACTCATTTC ACATAAAATA TTATACAGAA AACCTTGGTG 600
TTTTAGTGCC GTAATAGCTG TTTTTGCTCT GAGGCAACAA ACCAAAATCA GTTGGGCAAG 660
GCTAGGGGGG CACATTTTAT GATTGATTTA TTATAAGTAA CCCCCAAGCA CCCAAAAATT 720
AGGGTGACAA TTTTTTTTTT CCCCTAAAAC TAAAATTAAT GCCATAGAGA GTTTAGGAAC 780
TCTGTGAAAT CCTGCATTGT ATACAGTGTT GACATTGGCT GATTACTTAT TTGCATTAAC 840
AGAAAGTTAA GTGGGAACCT ATTGAAGTGG CTGGTGAGTG TATGCATTTC ATAACTAAAC 900
AAGAACACAA CAGCAATGAC ACTATTTCAC TTCAACAGCC TGAGAGTGAG CGAGTGTGAA 960
TGAGTACATC CATATGAGTA AATCTGAAGG GTAATGAGAG CATTAGTTGC TAAGGTTAAT 1020
GCCCGCCATC AAACTTTAAT TAGCTAAATT ACAGGAAATG ATAACCGAAT TAAAAAAACG 1080
CCAAACTCTT ACACACATCA CTTCAAGATG GGAAGGAGGG TCTAATGAGA CCACACCAAA 1140
TAAAACCTTT AAAAACCCAC AAAGCAACTG ATTGGATTTG TGCCACCGGA GCTGCCCTGC 1200
GGCTTGGCAT TAAACTGTGA GGTTATAGAC TCCACCAGCA ATGAGTGAAC TTGAACAGGA 1260
TGTTAGCTCA GATTGACGTC AATAAATGCC GCATGTTCTG TTGGCTTTGC AACTGTAAAA 1320
TCTTTTTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTATGCA TGTATATATA TATATATATA 1380
TATATATATA TATATATATA TATATATA 1408