EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR014-13607 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Melanoma 
Coordinate
chr24:4364936-4366090 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXA1MA0148.4chr24:4365342-4365358CATTGTTTACACAACA-6.1
HNF1BMA0153.2chr24:4365169-4365182ATTAATTATTTAC-6.42
Lhx3MA0135.1chr24:4365143-4365156TAATTAATTAAAC+6.19
Lhx3MA0135.1chr24:4365140-4365153AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr24:4365139-4365152AAATTAATTAATT+6.92
POU4F1MA0790.1chr24:4365168-4365182CATTAATTATTTAC-6.6
POU4F2MA0683.1chr24:4365166-4365182ATCATTAATTATTTAC-6.31
POU4F3MA0791.1chr24:4365166-4365182ATCATTAATTATTTAC-6.64
POU6F1MA0628.1chr24:4365141-4365151ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr24:4365141-4365151ATTAATTAAT-6.02
ZNF384MA1125.1chr24:4365919-4365931TTAAAAAAAAAA+6.44
ZNF384MA1125.1chr24:4365918-4365930ATTAAAAAAAAA+6.74
Enhancer Sequence
GCTCATTGAG CAGTATAGAG TCCCCATCAA CATAGTGGAG CGTTAGGACC CACACAGAGC 60
GCAGGCTGAG CGCCTCCTGC AGGCCTCCAC TTCCAGCAGC AACCTAGCTT TCCTATGTGG 120
TCTCTCATCC AGTTACTGAC CGAGCGCAGC CCTGCTTAGC TTCAGTAGGC AACCATGTGA 180
GAGTTGCAAA GAGCTAGCTT TTTAAATTAA TTAATTAAAC AATTATATTT ATCATTAATT 240
ATTTACTTTT ATTAAATCCC TCTTTCCATC TTAAGGACTA AAATAAACCT TTTCTTCTTC 300
TTTTTTTCAT CACCCAGTCT GTTGTATCTC CTTCCTTCAA TGTAAGACTT CCCAAATCAG 360
CCCATGTTCC CACAATTGAG CCTTGTTGTC TTTTCATGCA AATCACCATT GTTTACACAA 420
CAGCCCTAAG CGGCGGCTGA GACATGGTGT CCAGAGAGAG AGGATATGAT GTTGTCAGCT 480
GACAGGAAGT GTGATTGGGC CACAGATGGT TCATTCACAG CAGAGAATGA CTCAAACACA 540
ATCACTGAAG AAATCACACA CACATTTTTA GTTATGATAT TTGATTTATT GACGCTTTCA 600
GTTCTGACAG ACGTGAACTG AAAGGGCCTT TTGTGTTCTA GGATTACATT GAGGAAACAT 660
GACATCACTT CCTGTCATCT GAGGATGTTG TTTGCTCTAT GACCACCAAG TGTGTCCATT 720
TGAAGGGCAG TATTGATGCT AATTATTCAT CTAGGCAATT TCAGTGGAAT AATTGTTTTT 780
CAATGTTTTT CAATGTTTTT TTTTACTGTT ATTATATAGA ATGCCTATAA TTATATTGTA 840
AACGCAACAG TGGCACACAC ATCTCATTTG TGGATACATT TCAGCTCAGA CATATTTAAA 900
GTTCCCCTTA AATCAATTAA ATTCAAGGGA GAAGAAATGT AGTCAGTCCC TCCAGGATTT 960
TTACAGTCCA GTGGATCTTG AGATTAAAAA AAAAACATTT GACAAGATTC ATGTACTGAA 1020
GCAAATAATT TCATGCATTT TGAGAAAAGC TGTCACAGAA TGATCCATTT TAGGTTGCAA 1080
CTTCAAAAAA ATAAAAAATG CCCCACAACA TCCTGTGTTA TGACCAATAT TTATACTTAT 1140
ATCTGGATAT GACA 1154