EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR014-09093 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Melanoma 
Coordinate
chr2:528174-529024 
TF binding sites/motifs
Number: 51             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
GBX1MA0889.1chr2:528247-528257ACTAATTAGC+6.02
HOXB3MA0903.1chr2:528247-528257ACTAATTAGC+6.02
LHX6MA0658.1chr2:528247-528257ACTAATTAGC+6.02
RFX1MA0509.2chr2:528797-528813TGTTGCTATAGTAACA+6.21
RFX1MA0509.2chr2:528797-528813TGTTGCTATAGTAACA-6.21
RFX1MA0509.2chr2:528905-528921AGTTACTATGGTAACA+6.35
RFX1MA0509.2chr2:528905-528921AGTTACTATGGTAACA-6.35
RFX1MA0509.2chr2:528694-528710AGTTGCTATGGTAACA+6.54
RFX1MA0509.2chr2:528743-528759AGTTGCTATGGTAACA+6.54
RFX1MA0509.2chr2:528851-528867AGTTGCTATGGTAACA+6.54
RFX1MA0509.2chr2:528694-528710AGTTGCTATGGTAACA-6.55
RFX1MA0509.2chr2:528743-528759AGTTGCTATGGTAACA-6.55
RFX1MA0509.2chr2:528851-528867AGTTGCTATGGTAACA-6.55
RFX2MA0600.2chr2:528797-528813TGTTGCTATAGTAACA-6.52
RFX2MA0600.2chr2:528797-528813TGTTGCTATAGTAACA+6.54
RFX2MA0600.2chr2:528905-528921AGTTACTATGGTAACA-6.56
RFX2MA0600.2chr2:528905-528921AGTTACTATGGTAACA+6.58
RFX2MA0600.2chr2:528694-528710AGTTGCTATGGTAACA-6.82
RFX2MA0600.2chr2:528743-528759AGTTGCTATGGTAACA-6.82
RFX2MA0600.2chr2:528851-528867AGTTGCTATGGTAACA-6.82
RFX2MA0600.2chr2:528694-528710AGTTGCTATGGTAACA+6.86
RFX2MA0600.2chr2:528743-528759AGTTGCTATGGTAACA+6.86
RFX2MA0600.2chr2:528851-528867AGTTGCTATGGTAACA+6.86
RFX3MA0798.1chr2:528905-528921AGTTACTATGGTAACA-6.24
RFX3MA0798.1chr2:528797-528813TGTTGCTATAGTAACA-6.35
RFX3MA0798.1chr2:528797-528813TGTTGCTATAGTAACA+6.38
RFX3MA0798.1chr2:528905-528921AGTTACTATGGTAACA+6.44
RFX3MA0798.1chr2:528694-528710AGTTGCTATGGTAACA-6.48
RFX3MA0798.1chr2:528743-528759AGTTGCTATGGTAACA-6.48
RFX3MA0798.1chr2:528851-528867AGTTGCTATGGTAACA-6.48
RFX3MA0798.1chr2:528694-528710AGTTGCTATGGTAACA+6.73
RFX3MA0798.1chr2:528743-528759AGTTGCTATGGTAACA+6.73
RFX3MA0798.1chr2:528851-528867AGTTGCTATGGTAACA+6.73
RFX4MA0799.1chr2:528905-528921AGTTACTATGGTAACA-6.08
RFX4MA0799.1chr2:528694-528710AGTTGCTATGGTAACA-6.28
RFX4MA0799.1chr2:528743-528759AGTTGCTATGGTAACA-6.28
RFX4MA0799.1chr2:528851-528867AGTTGCTATGGTAACA-6.28
RFX4MA0799.1chr2:528905-528921AGTTACTATGGTAACA+6.43
RFX4MA0799.1chr2:528694-528710AGTTGCTATGGTAACA+6.69
RFX4MA0799.1chr2:528743-528759AGTTGCTATGGTAACA+6.69
RFX4MA0799.1chr2:528851-528867AGTTGCTATGGTAACA+6.69
RFX5MA0510.2chr2:528905-528921AGTTACTATGGTAACA+6.82
RFX5MA0510.2chr2:528797-528813TGTTGCTATAGTAACA-6.86
RFX5MA0510.2chr2:528905-528921AGTTACTATGGTAACA-6.86
RFX5MA0510.2chr2:528797-528813TGTTGCTATAGTAACA+6.92
RFX5MA0510.2chr2:528694-528710AGTTGCTATGGTAACA-7.13
RFX5MA0510.2chr2:528743-528759AGTTGCTATGGTAACA-7.13
RFX5MA0510.2chr2:528851-528867AGTTGCTATGGTAACA-7.13
RFX5MA0510.2chr2:528694-528710AGTTGCTATGGTAACA+7.14
RFX5MA0510.2chr2:528743-528759AGTTGCTATGGTAACA+7.14
RFX5MA0510.2chr2:528851-528867AGTTGCTATGGTAACA+7.14
Enhancer Sequence
TTTTATTTCC TGTCATGTAA ATATACCCTA ACTATTGATA AACCATTAAC TAAGGCATTT 60
AGCTCAATCA ACTACTAATT AGCTGCTTAA TATTTGTCAA TAAGGTCAGA ATTGGGTTTA 120
GTTATTGGGC AGGATTAGGC ATGCAGAGTA AGATCATGCC TTATAAGTGC TAATAAACTG 180
TGAATATCTT AACAATAGGC AGGTATTAAG GCAGCAGTAA CGGTGTGAGT TGCTTAAACT 240
AAAGTTTTAC CATGGTTTAT TTAGCTCTGG TGTGAGTGTT AGAGATGATC TGTGTGAACA 300
GAGTCTCTCT CAGACAGACA CCCGCTCTGA TCGATTCGTT CCAGCAGCCG AATGAACAGA 360
GGGGGATTAC ATTTCATTAG TGCTGATCCT CATTCGACAT CAGAGGACAC TCTCTGTCTG 420
AACACCACTC TCAAAATACT GTGGTACTAT ACAGTGAATT CTGTAGAGTT TAACCATACT 480
GTAGTAAAGA AATTGAATTA ATCAAGTGTG GTGACTCTAC AGTTGCTATG GTAACAACTA 540
TAGTGATTGA TCTGTTTTGG TAATTCTACA GTTGCTATGG TAACACAACT ACTACAGTAA 600
TCAATCTGCT GTGGTGATTC TACTGTTGCT ATAGTAACAC AACAACTACA GTAATCGATC 660
TGTTGCGATG ATTCTACAGT TGCTATGGTA ACACAACAAC TATAGGAATT GATCTGTTGT 720
GGTGATTCTA CAGTTACTAT GGTAACAACA ATAGTAATTG ATCTGTTGTG GTGATTCAAT 780
AGTTGCTACG GTAACAACAG CTATAGCAAT TGATCTGTTG CAGTGATTCT ACAGGTGCTA 840
TGGTAACAAC 850