EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR014-08943 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Melanoma 
Coordinate
chr19:42416820-42417925 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Ascl2MA0816.1chr19:42417421-42417431AGCAGCTGCT+6.02
Ascl2MA0816.1chr19:42417421-42417431AGCAGCTGCT-6.02
MEF2AMA0052.3chr19:42417136-42417148TCTATTTATAGA-6.74
MEF2DMA0773.1chr19:42417136-42417148TCTATTTATAGA-6.44
Nkx3-2MA0122.3chr19:42417688-42417701TTAAACACTTAAA+6.37
Enhancer Sequence
AAAAAATATT CAATAATTAT CAATATCGAA TGATATGAAA CATGAAATCT TGATAATTAT 60
TTTGCAATAT CACCCAGCCC TAGATAATCA CTAGCTAGGC TTCAAAATGA GTTTGTTTTG 120
GCGAATGTTG TGGAGACCGA GGCCTGTATT CAGACTCTGT AATGCTCCAA TCCAGGCCTA 180
TCTTGTTTGG ACAGTGATCT CCTGTGACTG TGATGTCAGA AGAGCCTCTG AGAGCACATG 240
TTTGTGTTTC TGCTGGTCAT GCGCTCAGTG GGTACTGAGA GGGCCAAAAG AGTCTTTGAT 300
GGGGTGGGTC ACGACGTCTA TTTATAGAAA GCACAGCTGC AGGACCCGAG CAACTTTTCT 360
GAGTCAGGAT GTTTGTGAGA GAATGTGTAG CCCGCATTAT TCCATAAATA CTCCATTTAT 420
AACATTCAAA CGGCTCAGCT GATATGGGTT TTGTGTGGCA GAAGCGCCGC AAGTGAATCA 480
ATTTCTCAAC GGAAGCCAGT TTGGATGAAA TATTTAGTAA TTATATGGCA CAAATGCTTC 540
CTGCAGGGAG CTCGTGTTCA GAAACTGGTT GACATGGAGA GGTGAGAATT TGAAAGATTA 600
CAGCAGCTGC TTCATGCAAT AATCAAACAG ACAGGCGCTC CATCAGCCAA TCGGCAGCAA 660
GCACAGCTCA GCAGCAGCCA ATCAGCAAAC ATGGATCCTT CAGATAATTC AAAACCTTGT 720
GTACAAGAGT GTAAACAATT AGGAAGTTCT TCATTCCAAC AGAGCAGCTG ATATGTTGGC 780
CCACAAATCT CTTACACACA ATGGACCATG TTCACAATAG CGCCCTATCA TATTACTGTG 840
TCTACTGCAT GTCGATTTTT GGTATGCATT AAACACTTAA ATGACCGTGA CGGGGTACAA 900
TGTGCAAAGA ACAAAAGATT AACATTTGCA GCACAATGGT TTGAACATTT TTAACACTGG 960
ATTAATGCTC AAAAGGACTA TTTATCACCC AAGACAACTG CTTGAAACCC ATTCTAGAAT 1020
GCGTCATGTG ACACCAATGT ACAGTAGCAT AGTAACCATA CTGAGATATT TGTCATTGCA 1080
TAGCTTAAAC GCTTTTACAT AACCT 1105