EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR014-08617 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Melanoma 
Coordinate
chr19:29195779-29196332 
TF binding sites/motifs
Number: 17             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr19:29196311-29196328TCAATTAATTAATTAAT+6.13
ArxMA0874.1chr19:29196310-29196327ATCAATTAATTAATTAA+6.2
ArxMA0874.1chr19:29196311-29196328TCAATTAATTAATTAAT-6.73
KLF13MA0657.1chr19:29196210-29196228TGACCACGCCCCTTTCAC+6.25
KLF14MA0740.1chr19:29196211-29196225GACCACGCCCCTTT+6.73
Klf12MA0742.1chr19:29196211-29196226GACCACGCCCCTTTC+6.38
Lhx3MA0135.1chr19:29196316-29196329TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr19:29196313-29196326AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr19:29196317-29196330AATTAATTAATTA-6.78
POU6F1MA0628.1chr19:29196314-29196324ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr19:29196318-29196328ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr19:29196322-29196332ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr19:29196314-29196324ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr19:29196318-29196328ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr19:29196322-29196332ATTAATTAAT-6.02
SP1MA0079.4chr19:29196209-29196224CTGACCACGCCCCTT+6.24
SP4MA0685.1chr19:29196209-29196226CTGACCACGCCCCTTTC+6.62
Enhancer Sequence
TTGTTGATTT ATTCCACTTG TAAATTGTGC TGAGCAGATA AAATCCCACA AACTGTTTCC 60
AACCAGGTCA AGTTTATGAA AAGTCATCCA ATGTTAAGAT TCCATTCAGT AATCGAGTTA 120
CATCCCAATG TCTCGTGTCC AAGTGAAGTT TACAAGCAGT CAGTTCATTA CATGATGAAC 180
AAAGGAATAC TCCACTCCCC CTTTGTGCTC AACTTTGAGA GCAGGCGCAC TAAAACTACC 240
GCTGAAATAT CCCAAAACCA TTTACCTACG TCAGGATGTC ATCTTCGGAG AGTTTTGTCA 300
AACACGTGTG GAGGTCCACT GAGAGGCAAT CCCGTTTTGT CGTTATAATC CATAAGCGCA 360
AAACTTTCCG CGTTCGGATG TTTGGTTGTA TTGATGATGC GCTTTGTCTA CACGTGCTTA 420
GACGGCTCGT CTGACCACGC CCCTTTCACG CATGACCCCA CCCCTTGTCC GATATCATGC 480
ACTTTGCAGA ATAGACTTTT GTGAAGAAAC TTATTTAATG TAAGTCAATA AATCAATTAA 540
TTAATTAATT AAT 553