EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR014-08494 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Melanoma 
Coordinate
chr19:25206663-25207481 
TF binding sites/motifs
Number: 14             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ALX3MA0634.1chr19:25206919-25206929TCTAATTAAA+6.02
ARGFXMA1463.1chr19:25206919-25206929TCTAATTAAA+6.02
GFI1MA0038.2chr19:25206896-25206908CAAATCACAGCA+6.52
GSX1MA0892.1chr19:25207233-25207243TTTAATTAGG-6.02
Gfi1bMA0483.1chr19:25206897-25206908AAATCACAGCA+6.62
HSF1MA0486.2chr19:25207105-25207118GAACATTCCAGAA-6.59
HSF2MA0770.1chr19:25207105-25207118GAACATTCCAGAA-6.57
HSF4MA0771.1chr19:25207105-25207118GAACATTCCAGAA-6.59
Hmx1MA0896.1chr19:25206901-25206918CACAGCAATTAATCAGC+6.09
Lhx3MA0135.1chr19:25207316-25207329AAATTAATTAATA+6.37
POU6F1MA0628.1chr19:25207318-25207328ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr19:25207318-25207328ATTAATTAAT-6.02
RORBMA1150.1chr19:25206864-25206875ATGACCTAAAT-6.02
SOX4MA0867.2chr19:25207075-25207085GAACAAAGGG+6.02
Enhancer Sequence
ACTTTACCAT ATTTCAAAGA GAATGTAATT ATTAAGTTAC ATATACTTTC TACTTGCATA 60
TCAAGTCCTC TTTTTAAAGT CTTTTTCACA AGGGAAACTG ATTATGCATT AATATGCTAT 120
AGTAAACTGG GCACAATATA ACCAACAGGT ACATAAATGG TAACTGTAAA TATGTTCAAA 180
TTGATTTCAT GTTAACTTTC CATGACCTAA ATCTTTATCA GTGTTCATTT CAACAAATCA 240
CAGCAATTAA TCAGCTTCTA ATTAAATAAG ATGAGAACAG CTCATTTACA GAGGGAAGAA 300
AATACCTCCT CGTGTTGTCA CATGATGAGC CAGGGTCAGG ACACGCTGGA CAAACATGAT 360
ATTGTTCGTT TATCTGAGGA ATCCTCAGGC AGTGGCAAAA GAGTAGGTGT CCGAACAAAG 420
GGGAAAAAAC TGCTCCGCAA ATGAACATTC CAGAACGAGA AGGCAGGGGG GAGATAAATA 480
GATGTAAACG GTAAACAGAT TACAGAGAAC AATGATGACA GGGCAAGAAA ACAGAAGAAG 540
AGCAACAACA ATTGTGTAAC AGTCGATGAC TTTAATTAGG ATACCATTAT CACGTTATCA 600
AGAAAGTTAA AAATCCAATT AAATAAACTC AATTCAAACA ACAAACAAAT AAAAAATTAA 660
TTAATAAACA AAAAATGTGA AACATTTTTG AAAAAAATCC TCAAATAGTT AGCAGTTGCC 720
TGTTTGTGAT TTTCATTTGA TTTCCAATTG CTTTCGAGTT GCATTACATG ACCATGATTG 780
CTTTTCCAAT AACGTATAAT TTAATAATGT AACTTTAA 818