EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR014-08068 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Melanoma 
Coordinate
chr19:4135000-4136901 
TF binding sites/motifs
Number: 15             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Dlx1MA0879.1chr19:4136233-4136243GATAATTAGG-6.02
IRF1MA0050.2chr19:4135592-4135613TCAGAGAAAGTGAAACTTACC-6.1
LEF1MA0768.1chr19:4135348-4135363TTTCCTTTGATGTCT-6.44
NFYAMA0060.3chr19:4135533-4135544AGCCAATCAGA+6.32
NFYBMA0502.1chr19:4135528-4135543ACATCAGCCAATCAG+7.12
POU1F1MA0784.1chr19:4136290-4136304AATATGTAAATTAA+6.5
POU2F1MA0785.1chr19:4136290-4136302AATATGTAAATT+6.02
POU3F1MA0786.1chr19:4136291-4136303ATATGTAAATTA+6.02
POU3F2MA0787.1chr19:4136291-4136303ATATGTAAATTA+6.02
POU3F3MA0788.1chr19:4136290-4136303AATATGTAAATTA+6.22
RORA(var.2)MA0072.1chr19:4136233-4136247GATAATTAGGTCAA+6.98
RORCMA1151.1chr19:4136234-4136246ATAATTAGGTCA+6.74
TCF7L2MA0523.1chr19:4135349-4135363TTCCTTTGATGTCT-7.34
Tcf7MA0769.1chr19:4135351-4135363CCTTTGATGTCT-6.07
ZNF24MA1124.1chr19:4136418-4136431AAATGAATGAATG-7.34
Enhancer Sequence
TAATCATTAT TAATAATTTA AAATTACATA TATTTCAAGA GTACACACAG ATATTGCTTG 60
ATGCTATTAG CATGTTTGGC ATGTTGTCTC GTCTGTTTGG TGAAATGTCT TTCAGCATAA 120
CAGATTCATT TATTTCTGAA TAAAACACTT ATTTCATAAA CACAGTTCAT TATAATCTGG 180
GGGCTTTACG TTAGTCTTAA ATGAATCTTG TGCTAAATAT TTCTAACAGG ATTGTTTTTT 240
AAGTTACACT GTTAAACTGA AGGCCATTTT CACAGGCGTC TTCTGTAAAT GACAGTAAAA 300
ACAATGCAGG CTGTGTTAGT CAGTTTTTAC TGCTCATTAT TTCAGTGTTT TCCTTTGATG 360
TCTTTATATA TTGATTATTG CTGCTTGTGT TTATTTTAGT GTTATTTTCT GTAAATATTG 420
TCATTAGTCG TGTAATAGTC TAAAGTTTAT GCTGTATAAT ATTCAGTCAA ATGATAAACA 480
CTTATACTCC ATTGAAGAAG AGGCTCAGAG GGAGGGAGGA GCCACTGAAC ATCAGCCAAT 540
CAGAGAACTG AAAAATACAG AGAGAAACCG GAGAGTGACG TCACTGCAGG ATTCAGAGAA 600
AGTGAAACTT ACCCGATCAA AAACAACGTG CACTCCTGAA ATAATCAAGC TTTAAACTAA 660
TGTATATTTA TTGAGCCGTT CAGAAATCAC TGTGGAAACA TTTAATACTC ACAGGTAAGA 720
GACAGAAACA TAAGAGAGAC TGAACTGAAC AGTTTATTGA TTGAAGTGCT TTTGGTTCTT 780
CAGGTTTTCT GTCAGTTGAA CAGAAGCAGG TTTAATCGTG TCAAATACTC AACTACTTTG 840
GTTTCTTACT CCACTGAAAT GCTGTATTTG TATCAACAGT ATGTTTACTT GATTGTGAAG 900
CAAAGTTTTG AGTTTTGTCA GGTGAAATAA AGGCTAGAGA ATCAGGAAGT GAAAGAGCTG 960
CAGACAAACT GAACACAGAC CTGCTGCACT GCAGATGATT TATAACATTA TATAAACTTC 1020
AATAACATTA AAAATCTTAT TCTAATTATA CAATTCTTTG TATTTTTGTA TATTTTGTTT 1080
ATTGTATGTT ATAATTTTAG CCTTTTCTGT GCTTGAATCT AAACAGCAGG TCATAGTTCA 1140
GATTGTTCAC TGAGTCTTAA ATGTATTTTG AAGGCAGCAA TTGTGTAAAT ACTTACTTGT 1200
ATTACTGTTT GTACATTTTA GCTAAATATC TTTGATAATT AGGTCAATAA TAATAATAAA 1260
ATTAGCTCTT GTCGCTCTTA AATGAATAGT AATATGTAAA TTAAATATGT AATAGTTTTG 1320
CAGCGGTTTT TCCAGTACTG GGTTGTGGCT GGAAGGGCAT CCGTTGGTGG TTCATTCCGT 1380
TGTGGTGACC CTTGATAAAA AAGGGACTAA GCTGAAGCAA ATGAATGAAT GTTGCAGAAC 1440
TCATGTTGTT TGGTTTACTG TTTGTCTAGT TATGAGTTTG TGAACAGTAA TTCATAAGAT 1500
AATTTAAAAT AAATAAATAA AACTGTTCAT TCTGTTCAAA AAATTGGTTC ATTCTGCTGT 1560
GGTGACCTCT GAAACAGAGA CTAAACCGGA GGAAAATAAA TGCATGAATA AAAAACAGCT 1620
CAAACAGCTT CTTGTTTTTG CTGTATTTCT GTTGTTGGCC CTTGTTGAGG AAGTATATTG 1680
GTTTCAAAGT GATTAGTAAA TCAGAAACCT CATCATAATT TACCACTTTT TAATGTTTTA 1740
AAGTCACTAA AACCAGCTTC ATGCTGTGCA ACATTGAAGT CTTCATAAAT TAATATTAAG 1800
GAGGTTCACA GGCATCCTGA TCCTAAATGA TCAAACTGAT GAATCTAATT ATATCAGACC 1860
AGAACCTTCA CTATGATTCA AGTGTATGAT TTTTTTCCCC A 1901