EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR014-06895 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Melanoma 
Coordinate
chr17:43540986-43541882 
TF binding sites/motifs
Number: 7             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxj3MA0851.1chr17:43541541-43541558GTCTTTGTTTACTATAC-6.41
Lhx3MA0135.1chr17:43541827-43541840TAATTAATTATTT+6.71
POU4F1MA0790.1chr17:43541828-43541842AATTAATTATTTAT-6.63
POU4F2MA0683.1chr17:43541826-43541842ATAATTAATTATTTAT-6.29
POU4F3MA0791.1chr17:43541826-43541842ATAATTAATTATTTAT-6.54
RARA(var.2)MA0730.1chr17:43541500-43541517AGGTCATAAAAAAGTCA+6.25
Rarb(var.2)MA0858.1chr17:43541500-43541517AGGTCATAAAAAAGTCA+6.5
Enhancer Sequence
CTAAAAATAT CCAAAGCTTT TCAACAAATT TCTACAGAAA GCAGTTACTA CGGTATGAGA 60
TCTCTTGTCC ATTTTATCTC AACACTCAAC TTCTACGTGG ACTATAATAA CATCAGATGA 120
ACTATGCTCA CATTTCTTAG TCCGTGTGTT TGTTTTATCG TCTGCTAGTG TGTAATGTAA 180
ATGGCAAAGC ATGGATGTTA ACCATCACCA GAAAGGCAAA CAGAGTCTTT ATTGTGAATG 240
TAATCACATT AGCCATGAGG CCGATCACCC TCAGCGCCAC AAGCGCACAC TGGAAAAATA 300
AAATTATTCA GAGGGCACAG TCATATGACT TGATTTCTCT CCAGAAACAC TAGGAACAAA 360
CGAAGGGTCA AGAAACCGTT TCTGTTTGTT CTCTTCTGGG CTTTTTTCTC CTAATGAGAA 420
ACTAATGAGG TTTACAGTGC TTTTTAACAC TGTCTTTGAA TACACAGTAT TGTATAAGTT 480
TGATGAATCA CATGTTTTTT GTTAAATTAA TAAGAGGTCA TAAAAAAGTC ACTGCAGGTC 540
AATAACCACA GTACAGTCTT TGTTTACTAT ACTGCAGAGC TGCTTCTGTT AGTGATTTTG 600
AATACTTGCA AGATTTGTTG GATTCAGACC TGTCAGTAAT CAGTTGTCAG GAAGAATGCT 660
GTTGGAAAAG CCCTAAAATA TAAACTGATG GCATCTCTGT GTTGAAAACT GCTGGCACAC 720
ATCTGACACT AAATAATAAA CCAAAAGTCT GTAATGTTTG TAATTTGAGT TTGGCTACAA 780
TTTCCTTCAC CAATGGACTA AGTAAACTGC AGGAACAAAA AAAGTTAAAG TGTTATAACT 840
ATAATTAATT ATTTATAATA CAAGTCAACA CAAAAACCCA ACCCCTTTAC ATGAGT 896