EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR014-06372 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Melanoma 
Coordinate
chr17:13447107-13448152 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Nr5a2MA0505.1chr17:13447604-13447619GCTGACCTTCAACTC-6.1
RARA(var.2)MA0730.1chr17:13447595-13447612TCACCTTTAGCTGACCT-6.57
Rarb(var.2)MA0858.1chr17:13447595-13447612TCACCTTTAGCTGACCT-6.31
SOX10MA0442.2chr17:13447885-13447896TTCTTTGTTTT-6.62
Enhancer Sequence
CAAAACGCAT TTCACTATAG CTGAAACACA GAATAAGTTA TGGCCAAAAT AAGACTCGAA 60
ATCACCAGAG TGGATGAAAA CATCCAGAAT AGCACAAAAC GGTTAAATGA ACTTGTTAAA 120
GGCTTGCCTT ACACTGCTAT TTTTGTGATT CGCCAAAAAT CAACCAGCTG TATAAAATGT 180
TGTTTTTGTT TTCGTAAAAT CAGACAACAT TGGATTCATG GATACATTTT GTTCCAGTAA 240
ACTGAACAGA CTCATTCTTT TGTGCATCTG ACATTTGCTG TGTGACTTTG CAATATATGA 300
ATCACCAATG ACAGCAGTAA AATAAATGTT TCCCAGCATC TGTGTGAGAA ATAAATCTCT 360
GAACGATCAC GAGTGTCCAG TGACTCGCTC ATCTGCTTGG AGCTTCAAGC AATTATAATC 420
AAAGACATCA TTAGGGGCTG ATTTGACACG GTATGAAATC AGAAACTGAA CACAGAATGG 480
CATGTAATTC ACCTTTAGCT GACCTTCAAC TCGTTACTTT TTCATTTACA GGCATAATTT 540
GACTTAATCA TTTAGGGTCA ATGCTTGATC GCATGCTATC ATGATCAAAT GGGACGTGCT 600
GCGTTGTCTA AGAGGCTCAA AATATGGCTT GTTAACCAGA GCTTCGTGTT TTTTTGGATG 660
ACAGTGCGCC AGGTATACAG CAGGAACAAG TTGCACACAA GTAATCACAA ATCAAGCTGG 720
AAATGCTGAG TAATGTGACG TTGATGTATT TCCCCCGAGG TGTAATTACC CTTGATCCTT 780
CTTTGTTTTC AGCCTGTGTC TGTAATTGAA AGCAATTCAA GCAGTCAGCA GCCATTATTA 840
TACCGCGACA TCAGCCAGCA TCGGATGATT GCTCATTTCT TTGCCTCTTC TTGGTTGAGA 900
GTTCTGTTTT GAAAGTTGAA AAGGACTCAT CAATGTTTTG GCTCACTGCT GCCCTAATAA 960
TATCTGGCAT GGATTCAGCG GAGAACTGTG ATGAAAACAA TCACTGACAG GAAGGAGCAG 1020
GGCTAGCACC TCTCTCTCGG ACAAA 1045