EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR014-05965 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Melanoma 
Coordinate
chr16:40395405-40397244 
TF binding sites/motifs
Number: 16             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr16:40396059-40396078TGTTGCCACCTGCTGGCGA-7.01
EHFMA0598.2chr16:40396454-40396466AACCCGGAAGTC+6.14
ELF1MA0473.2chr16:40396454-40396466AACCCGGAAGTC+6.74
ELF2MA1483.1chr16:40396454-40396466AACCCGGAAGTC+6.52
ELF4MA0641.1chr16:40396454-40396466AACCCGGAAGTC+6.18
LHX2MA0700.1chr16:40396881-40396891GTTAATTAGT-6.02
RFX1MA0509.2chr16:40396584-40396600CGTTTCCATGGTAACG-7.52
RFX1MA0509.2chr16:40396584-40396600CGTTTCCATGGTAACG+7.53
RFX2MA0600.2chr16:40396584-40396600CGTTTCCATGGTAACG+7.63
RFX2MA0600.2chr16:40396584-40396600CGTTTCCATGGTAACG-7.66
RFX3MA0798.1chr16:40396584-40396600CGTTTCCATGGTAACG+7.64
RFX3MA0798.1chr16:40396584-40396600CGTTTCCATGGTAACG-7.81
RFX4MA0799.1chr16:40396584-40396600CGTTTCCATGGTAACG-7.36
RFX4MA0799.1chr16:40396584-40396600CGTTTCCATGGTAACG+7.74
RFX5MA0510.2chr16:40396584-40396600CGTTTCCATGGTAACG-7.37
RFX5MA0510.2chr16:40396584-40396600CGTTTCCATGGTAACG+7.41
Enhancer Sequence
CTTATATTCA CCCCTGCAGT AATATTTACT TTATTGCTTC AAGCCACGTC TGTTAGCAAA 60
CATCCTCGCC TTTTACGGTG GCAGAGTATG GATGTCTTCA CGGGTCTTTT AACTAGTAGC 120
GTGTTCTTGA AGTGCGCACT ATTGAGTTCA TACGCAGTAT GCATACTTGT ATATCGGTCT 180
GCAAGTAGAG TACTCACAGT CCCTGGTGGT CTAGTGGTTA GGATTCGGCG CTCTCACCGC 240
CGCGGCCCGG GTTCGATTCC CGGTCAGGGA ACACATTGTT TTTTTCACTT GTTAGATCGT 300
TCACGGAGGA CTTTCAATAA TACGTCTCAC GAACAACTAA GCAAAATGAA TTTATCAGAT 360
GTCACTTTAT CATGGTAAGC ACGAAGCATG CGTATCTGAT GTTTCTCAAC TGGTAACCCG 420
CGAGTTAGCA AAAATAAAAC ATTTGGAGCT TATTGCAGAA CAATTTTTGA CCATTAAATA 480
CTTCAAAGTC TTATATGTGT TAATGCTTTC ATGTCTGCAC TGAAACAATG TGGAATTTTA 540
CTTATCTCGT CAGCTTAAAG GTTTACGTTT TTGTCTGGAG TGGACCTGAA AGCTCGTCGA 600
GCGAGCTTTT GACGTACGTT AGCACAGTTC ACGCGCATTT TTAATGTGAT CATTTGTTGC 660
CACCTGCTGG CGAGAATTTG TCAGTGAATC TTATTTTCTC AGTTTAGTCA GTGTGAAAAA 720
ATATCCCAGT CGATTGCATT TTCTTTTGTG TCATTGTTTT AAATGAACAA AACGTGCGTT 780
TTCATAACTT AACGTTAAGT TAACGTTAGA CGTTATAAAA ATCAGAAGTT ATAAGAGAAA 840
ATGCGCCTGA ATTGCAATCT ATATGCCTCG GTCGCCTTAT CCTCAGACGC TATGTTGGTG 900
TTTAAAAACT GTAGACGGTC TGTGTAAATC ATCAGTTGTC GTGGCCGAGT GGTTAAGGCG 960
ATGGACTAGA AATCCATTGG GGTCTCCCCG CGCAGGTTCG AATCCTGCCG ACAACGAATC 1020
GTTTTCCTTC TAGAACTTAC ACCCACAACA ACCCGGAAGT CTCGTGTCCT TTGAGAGAAC 1080
ACGATTATGT GTTTACCGGG ACACTATTTT GAATTCTGAT CGAGTATGTC ATTAATTTTA 1140
TGATGCCTTT CTGAACCGAT AACAAAAATA AAATCCACAC GTTTCCATGG TAACGGACGT 1200
GGCGTTCTCC ATCGGACAAT CATGGCGGAT GATTTGGACG ATTTACTTGA TGAAGTCGAA 1260
TCAAAGTTTT GTTGCAACAC TTCGGAGTCT AAACAGACAA GCCGTGTTAT GAAACATACG 1320
GATCAAAAGT GTGACAATCT CGAAGAAAGG AAACTGCCAA GGTAGTAGGC TAGCAAGATT 1380
AGCAACCAGA GCTAACGTGG CTAATTATGT CAGACTAACG TTAGTGCAAT AAAGAAGCAC 1440
GTTTGATACA ATGTAAACGC AGCTTTAAGG CTCAGTGTTA ATTAGTATTA GTGTAACTAA 1500
GATGCCAAAT TATGTTATTA CCTCAAATAT AAGAATTAGA CAGTGCATAG TGGCTAACAT 1560
CTGATAACAC GAGCCTGATT CATACATCTT TAATGCTGGT CCCTAGGGAA GATCAAGACA 1620
CAATATTAAC ATATCGAATT TTATTTCCAC TGTTACCAGA AAACAAGGAC GTAAAAGAGT 1680
TGAAAATGAG ATAGATATTG ACGCTATGCT GCATGAAATA CTGGATGATG ATGTTGATAC 1740
ACCAACCAGC ACACATGTAA GCCAAATGAC CAGACAAAAC CTTGTCATTA ATACTGAATA 1800
AAATACTTTT CAAATAACAT TGATTTAATA AACCAATTG 1839