EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR013-47368 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Intestine 
Coordinate
chr6:56125716-56128299 
TF binding sites/motifs
Number: 16             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXA1MA0148.4chr6:56127822-56127838ATTTGTTTACTTATTG-6.4
FOXC2MA0846.1chr6:56127823-56127835TTTGTTTACTTA-7.22
FOXP2MA0593.1chr6:56127823-56127834TTTGTTTACTT-6.62
Foxj3MA0851.1chr6:56127820-56127837GTATTTGTTTACTTATT-6.66
GRHL2MA1105.1chr6:56127733-56127748CAGAACTGGTTTGAT-6.55
HNF1AMA0046.2chr6:56127118-56127133TGTTAATGTTTAACC-6.22
HNF1BMA0153.2chr6:56127119-56127132GTTAATGTTTAAC-6.15
IKZF1MA1508.1chr6:56126932-56126944AAAACAGGAAGG+6.18
Lhx3MA0135.1chr6:56126484-56126497AAATTAATTATTG+6.46
POU4F2MA0683.1chr6:56128004-56128020ATGCATAATTAAATAA+6.32
POU4F3MA0791.1chr6:56128004-56128020ATGCATAATTAAATAA+6.03
RARA(var.2)MA0730.1chr6:56127398-56127415TGACTTCCACATGACCT-6.1
Rarb(var.2)MA0858.1chr6:56127398-56127415TGACTTCCACATGACCT-6.04
ZNF263MA0528.1chr6:56127563-56127584AGAGGAGAGGAGAGAAGAGGA+6.63
ZNF384MA1125.1chr6:56126190-56126202TTAAAAAAAAAA+6.44
ZNF384MA1125.1chr6:56126189-56126201TTTAAAAAAAAA+7.22
Enhancer Sequence
AAGTTGCTTT GGACAAAAGT GTCTGCTAAA TGACTAAATG TGAAAGTAGG ACATTTTTCA 60
CAGTATTTCC TATTATATTT GTCTTTTGGA GTGTTATTTT TTATTTTTTT TCTTGGTTGG 120
AAAAAATATA TATATTAGAA TAAAAATAAA GCTTTAAAGT TTCCTGAAAG CCTTGGATAA 180
AAGTTTCACG GTATAACGTT ATTGTGATTA CCGCTCTAAA ATATGTTCTT TTTTTAAATG 240
TCTGGGTATA AAACAACTTT TTTTCCATTG AAAACAATGT TTTATTTTGG GAAACATTTC 300
TGCTCAAAAA ATAAAGGGAA CACAATGTAT CTCCAAGTAT TCTCTTAGTT TTTTTTTTGT 360
GCAGTATATT CTGGAACAGT AAACATGTCA GGCTAAATAA TTAAAATAAA TCATTGACCT 420
ATTTTCATTC AAAAGCACAA ATTTCTTCAT AACACATTGA AAAAACACCC ACATTTAAAA 480
AAAAAACTTT ATGTATACCC TAGGAACTTC ATAATAAATT ATTTTAGCAG TTTTAAAACC 540
TTGACTTTTT TTCAAACCAC ATTAAACCAT GAAACTGCTC ATTATGCCTA AATATTAGCC 600
CCCTATAAGT AATTATATTT GGTGCATCTT TGAAAAAGAA TACAAATCTC ACTGGAGGGC 660
TGATAATTTT GTCTTTAAAT GTATATAGAG AGCAAAACAA GTATTGACAT TTTACTTAAA 720
CTAATAAATC ATGTACATCC AGAGAAACTT TATTGTTAAC AAATATTTAA ATTAATTATT 780
GAAATTGATT TTTAAGCAGT ACATTAAAAG CTAACATGCT TTTAGAAAAG AGACAGTAAT 840
ATTATGTTTA AAAATGTTTA TGATGTGGCA TAAATCAACA GTGTCTATTA ATGATCGATT 900
ATTGATGTAT TTAAGCAAAT TGTTGACTAA CTTTGATATC AAGCTAAGCT TGAAGTAATC 960
ATCACAACAT GACATTATTA TCCTGTCACT TTGAATATAA AATAATCTCC CTGTGTCATA 1020
AAAGACACTT GATTCAGTCT CATAGGCTGT GAACTGTAGT ATAATCTATG CTCAATGTAA 1080
AAGATGGTGA AGCCTGTAAA ACTTCTGTGA AACTTAAAGC TTGAAGAGCA GCAGATTTGT 1140
ATTGTTTGAT TATTTGCCAA CATGAAGACT TTCAGCTTCA ACAGGTTTCC TATCAATATT 1200
TCTAGTAATA ATTTCTAAAA CAGGAAGGGC AAAGTCGGCC ACGAAAGTCT AAAAATATGT 1260
ATGATCAACC TAAATAAGAG CTTTTAGGCA CAAAACATCA CTGATCAAAA TAAAGAAATG 1320
CTTTTCTACT CCTCCTGTTT GATTCAAATT GTTAATACCA AGATTTAACC TGTTGGATTT 1380
GTACATTGAT TGTAATCTTC CATGTTAATG TTTAACCAGC TAAATTCTGC ATTATTATAA 1440
TATTTTTTAT TTTAAAAATC CTGATTTCAT TGACATTTTA TATTTCAGTA TTTCCCTTGT 1500
GTTTAAATGG CAAACTAATC CTCCGTACAG GCTTTCCACT ACACATGTTT TGGTATTCTG 1560
AAGTATAAAC ATTGAGCGCA GCCCAATAAA ATCAACGTGT TGCCTACCTT TCAGCTCGTG 1620
TCCGCTCCTG TAAATGGGAA ACCAGATTAA ACATTCACAA ACATGTGCGT CTCTCGGAGT 1680
CTTGACTTCC ACATGACCTC AGTCTATAAA GTGAGCCCAA ATCCAGCGTC AGTGCATCAG 1740
AGAAAGCCTC TGCTTTGTGT GTGAATTTCT TTTCTCTTTT TTTTTGTGCT GTTGTTGCTG 1800
TGATCTGCTC CTACGAGCGG CTGCTCAGTT ACACCTCCCT TGAGAGGAGA GGAGAGGAGA 1860
GAAGAGGAGG AGCTTGAAGA AGCACAAAGC ATTTACACCT CTTTTTTTGA CACTCCCGAG 1920
TCTCCTATCA AAAGAGAATA GCATTGTCAT GAAGTTTTGA GTTTCTGTTT TTTTTATGCT 1980
CAATCCTAAC CAGTCGCAGA ACCTGTATGG TGTTGAGCAG AACTGGTTTG ATGCCAGTTG 2040
AGGTGGTTTC AGGTTTAGAG TTATCCACTA GTGCAGATTA CCTTGAACTT TGGGGAATTA 2100
GAATGTATTT GTTTACTTAT TGAGACTATT AGTTAATCTC ATTCATGGAC TGAAATTTTG 2160
TCGGCTAGTC ATTTACAGTG CTCAACATAA ATTCATGAAT ATTTTTCTCC ATTTTTCAGT 2220
CAAAATACAG TTGATAATTA TTTAAATACT TAATTAAAGT ATTTAAATAA TAATAATTAT 2280
TAAAATACAT GCATAATTAA ATAAATAATT ATTAGCCCCC TTTTTATTTA TTTTTTATTT 2340
TTTTCCCAAA TGATGTTTAA CAGAGCAAGG AAATTTTTAC AGTATGTCTG ATAATATTTT 2400
TTCTTCTGGA GAAAGTCTTA ATTGTTTTAT TTCGGCTAGA ATAAAAGCAG TTTTTAATTT 2460
AAAAAAAATA ATAATTTTAA GGTCAAAATT ATGAGCCCCT TTAAGCTATA TTTTTTTCAA 2520
TAGACTACAG AACAAACCAC TGTTATACAA TAACTTGCCT AATTACCCTA ACCTGCCTAG 2580
TTA 2583