EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR013-46188 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Intestine 
Coordinate
chr6:28740132-28741532 
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ArMA0007.3chr6:28740840-28740857GGGTACAGCTTGTACTT+6.06
Arid5aMA0602.1chr6:28740165-28740179TCTATCAATATTAA-6.01
RFX1MA0509.2chr6:28741486-28741502TGTTGCCATGGAAACA+6.89
RFX1MA0509.2chr6:28741486-28741502TGTTGCCATGGAAACA-6.91
RFX2MA0600.2chr6:28741486-28741502TGTTGCCATGGAAACA-7.11
RFX2MA0600.2chr6:28741486-28741502TGTTGCCATGGAAACA+7.17
RFX3MA0798.1chr6:28741486-28741502TGTTGCCATGGAAACA-7.2
RFX3MA0798.1chr6:28741486-28741502TGTTGCCATGGAAACA+7.37
RFX4MA0799.1chr6:28741486-28741502TGTTGCCATGGAAACA+6.67
RFX4MA0799.1chr6:28741486-28741502TGTTGCCATGGAAACA-6.91
RFX5MA0510.2chr6:28741486-28741502TGTTGCCATGGAAACA-7.05
RFX5MA0510.2chr6:28741486-28741502TGTTGCCATGGAAACA+7.06
SOX21MA0866.1chr6:28740954-28740969AACAATGACATTTTT-6.1
Enhancer Sequence
TTAAAGCACA TCTTGTTGTA TATATACATA AGATCTATCA ATATTAACGC TTTAGAGGTA 60
CATACTTGTG TACATGCATA AATGTGTGTA CTGTCTAGGA GCAGAGGTTT GCTATTTAAA 120
CTCACAATTA CTATGAGAGA ATTTAAAGAT AAATGGCTTT AGTTTTCTCT TTATATACAT 180
CTTATGGAAG GGTGTTGCAG AAATGCCTCT TGAATGATTG GTTGTATTTT TTGGTCGAAG 240
TTGCATTTTG TCCAACAGGA TGAGAAAAGC GCTTCAGGCT CAAAGCCCGG GGGAGGATTT 300
AAGGAAGGGG TGTTTTCCAA AACACATGCT GACACACACG TTTGTGTGTA TGTGCCCTGG 360
CATTGGGCTC ACATCTTCAT TTTTGGCCTT CAGCATTCAG CCATCTGCAC AAACTTATTC 420
AAGTTTGTCA GGGAGTTAAA GAAAGAGAAA AACTGTTGCT GTTGTGGACA AGGAATGAGT 480
TGTTGAGTAA CAGTCTAAAG GTTAAAGCAA TAAAGAAAGA AGAAATCGAA TGGGCTCATT 540
TTTGTTTATG AGCTGTCAAA CATTCTCTAA GCCAGTTCCT TTGCCAATGC GTGGTCCTGC 600
TTCATGTACG TTTTGTCAGT GAGTTTATAC CTGTTGTTAT CGTCTACTTG CTAATTCCTC 660
CCATTTGTCC CTTTTCATGT TCTTGTGCTC AGTTCTGGCC CTGCTCCAGG GTACAGCTTG 720
TACTTGGACT GAAACGATGA TGGCTAAACT ATGACATCTA TAAAGCACAT ACAAACCACC 780
CGACCAAAAA GAAATGAAAA CAGTTAAAAG AATAGCTCAT CCAACAATGA CATTTTTTGT 840
CATTAATAAA TCTATTCGAT TCATATCTTC TGTAAGTGTG AGACTTTTTT TTATTTTTTC 900
AAACATTATG TATCACATGA AATACTTTAA TAGCCAAACT TGAATATCGG ATGCAGATTT 960
CCACTCAGTA TTACAACAGA AGCCAGCTAA TGTCAAAAAT ATTGTCAGGG AGGATTATTG 1020
TTTCATCAAG TTCTTTTGTT TTGTTTTCCA CGTGAAGCTT TTCAGTAATT CCTTCATTCT 1080
ATCATTTGAT TTTAAATCAG ATATGAGTTT TTTTTTCTAA TAAATGGAAG ACAGTCCTCT 1140
TTCCTGTTGA ATTCCTAGTC TATTTGCAGC AGACTTAATA CAATTATTCC CCTGCCGTGA 1200
CCTATTTAAG CCAGCGCTGC TGCCAGCCAT TAGTGTTGTG AGAATTCACT AAGTTGCCAC 1260
GTTGATGGGT TCTGAGAGGT TGTATTTTTC AAGTACACAC GTAGGTGGAG GTTCAGAGAC 1320
CTACTGTTTG TCATCATTTA AACTGTATTT TTTCTGTTGC CATGGAAACA TGCTTCCTTT 1380
TTTACCCTTT TATGAAATGG 1400