EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR013-45189 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Intestine 
Coordinate
chr6:279935-282048 
TF binding sites/motifs
Number: 19             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HNF4GMA0484.1chr6:280956-280971TGAACTTTGACCCCA-6.73
Hnf4aMA0114.3chr6:280954-280970TCTGAACTTTGACCCC-7.53
NR2C2MA0504.1chr6:280956-280971TGAACTTTGACCCCA-6.42
Nr2f6MA0677.1chr6:280956-280970TGAACTTTGACCCC-6.68
RFX1MA0509.2chr6:280939-280955TGTTACCATAGCAACT-6.54
RFX1MA0509.2chr6:280939-280955TGTTACCATAGCAACT+6.55
RFX2MA0600.2chr6:280939-280955TGTTACCATAGCAACT+6.82
RFX2MA0600.2chr6:280939-280955TGTTACCATAGCAACT-6.86
RFX3MA0798.1chr6:280939-280955TGTTACCATAGCAACT+6.48
RFX3MA0798.1chr6:280939-280955TGTTACCATAGCAACT-6.73
RFX4MA0799.1chr6:280939-280955TGTTACCATAGCAACT+6.28
RFX4MA0799.1chr6:280939-280955TGTTACCATAGCAACT-6.69
RFX5MA0510.2chr6:280939-280955TGTTACCATAGCAACT+7.13
RFX5MA0510.2chr6:280939-280955TGTTACCATAGCAACT-7.14
RREB1MA0073.1chr6:281077-281097TGGGTGTGTGTGTTGTGTGT-6.16
RREB1MA0073.1chr6:281075-281095TGTGGGTGTGTGTGTTGTGT-6.31
RXRBMA0855.1chr6:280956-280970TGAACTTTGACCCC-7.58
RXRGMA0856.1chr6:280956-280970TGAACTTTGACCCC-7.58
RxraMA0512.2chr6:280956-280970TGAACTTTGACCCC-7.52
Enhancer Sequence
TTGTGTGGTG TCTCCTCTCT CTCTCTCTCT GTTCTCTTCT TCTGTTTCTC CTGTAAGTGA 60
TCTAAAGTGC AGCATGTGCT GTGGACCCTA ATGGCTCATT CTCACTGGCT AATGGCCCAG 120
GGTTTCTCTG ACGGCTTTAA GACCAAGCAG ATGTGTGTGT GTGTGTGTGT ATGTGTGTGT 180
GTGTGTGTGT GAGAGAGAAT GCTCGCTCGG TCTCACTGGT GTAGCCCAAA AAAGGTATTG 240
ATCTGCTTGG AGAGTGTCTG GAAATGTGCC TGCAGCAGAG CTGGAGCTGG AGCGGGGGCA 300
GCAGAATCCA GCCTTCACAC ACACAGAAGA AATCAGGAGT TCAGATGCGA AACACAATCA 360
AATAACCAGC TCAAATCCTT CTCAAGCTGA GAATAGATCC ATTTCATGGC ATTTAGCGTG 420
CAGTAACAGC ACAGAAACGC TCGTCTGAGC AGAAGTTTTG CATCTGAACT CTTCAAATAT 480
TCAAGAAGTG AGTTTATTTG GAGCGCACGT GAACACACAG CTCCGCTTAA ACACACACTT 540
CAGTCATACG CTCACTGTAA AACACAGAAA GTGCTCTTGA ATGCTTGTGT TGTGCTCCTC 600
TAAGGTCAGA GATATTGAAA TGGCATCAGT TTTTGCGCAG CCCCTACACA CACACACACA 660
CACACACACA CACACACTCT GTGCGGCGTC AGAAGAGGAT TTGCTGTATC ACTGACAGTA 720
AAGAGGCTTT TTGTTGTGCT AAAGAGATCT GCACTTGTTT CAGAGTGGCA TTAGTCTCTG 780
ATCTCCCATT TATCCTGATG TGGGGGGGTT AATACACACA CACACACACA CACACACACA 840
CACACACACA CACACGCACG CGCAGAGATT GGAGATTTGC AGATAAGCCC AGGCGTTCCT 900
CATGTTGTAC AGTGTTCTCT GCTGTGTCGT GGCCGTCGGG TCGCTCTGGT GTGCTCTACT 960
TACCCCACGT CTCCAGTAAT TACCCTTATG GGATTGTGCA CATGTGTTAC CATAGCAACT 1020
CTGAACTTTG ACCCCACGAG CCGGGCAGTA AAATCGGGGT GTGGTGGTGA TGGTTATTGC 1080
CTCAGACAAT AGAACACACA CACATGGGTT TGATTTCCAC ACGCTCTTCA GCTTGACTTG 1140
TGTGGGTGTG TGTGTTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTATGTGTGT GTGTGTGTGT 1200
GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT TTATACTTCA CCTCCAGCAT 1260
CTTCTGAGTT GTGTAAGTTG TGCATGTTCT GTCAGTGGGG CAGATGATTA GTACTGGTTT 1320
TGCTCTTGAT ATAAGCTGAT TCTGCTTCCC CCATTGGCCG GCTATTCTGC TTGTTTTAAT 1380
GAAAAACTCT TCATTTTGAC TCTTCATTTT GAGTCCATAT TTCAGGCCTG CAGTAAGGGT 1440
GATTCTTTGT CTCCAAAAGT GGACCTTTTG CAGTTCTACG CCTCATTTTG CATGTAATTA 1500
TGAGATGTAA ACACTGCATT TTAATGACAT TATAAGCAGT TTTTAGCTGG ATGAGCTTGT 1560
CAGATGGTCA TTATAGCCAC ACTTTTTGAT GTACTAAAAT ATTTCCCAAA ACATAAACAA 1620
TAAAAAATAT TAACTTATAT TTTTAAAATA AATTATTACA TCAAACAATA ATAATCTGTT 1680
CCATAAAAAA AAAACTGTGA AAAATTCAAA ACTGTGTCCT ATTGCTATTT ATCAGGCAAA 1740
TAACAAACTG GCCGACACAT TTCAGTCCTC AGTCAGAATT TGGACATTTA AAACAATATA 1800
AAATATAAAA TTTGAGCCAA CTGGCCATTT AATATTTCAA AAATAAATAT ATTAATGAAA 1860
ATAATAATAA TAATAATGTT AATAATAATA ATGATGATGA TGATGATAAT AATAATAATA 1920
ATAATGATGA TGATGATGAT GATGATGATG TTAAGAATAA TAATAATAAT GATGGTGATG 1980
ATAATAATAA TAATGATGAT GATGATAATA ATAATAATAA TAATAATGAT GATGATGATG 2040
ATGATGATGA TGTTAAGAAT AATAATAATA ATGATGGTGA TGATAATAAT AATAATGATG 2100
ATAATAATAA TAA 2113