EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR013-43382 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Intestine 
Coordinate
chr5:30504703-30505564 
TF binding sites/motifs
Number: 17             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx4MA0853.1chr5:30505083-30505100CGTATTAATTAAGAATT+6.36
Foxj3MA0851.1chr5:30505252-30505269GGAAGATAAACAAATGC+6.36
HNF1AMA0046.2chr5:30505096-30505111AATTAATAATTAATT-6.07
HNF1AMA0046.2chr5:30505096-30505111AATTAATAATTAATT+6.26
LMX1BMA0703.2chr5:30505160-30505171ATTTTAATTAA+6.62
Lhx3MA0135.1chr5:30505099-30505112TAATAATTAATTA-6.18
Lhx3MA0135.1chr5:30505102-30505115TAATTAATTATTT+6.71
Lhx3MA0135.1chr5:30505164-30505177TAATTAATTATTT+6.71
Lhx3MA0135.1chr5:30505173-30505186ATTTAATTAATTA-6
MEF2CMA0497.1chr5:30505112-30505127TTTTTAAAAATAGCA+6.19
POU4F1MA0790.1chr5:30505165-30505179AATTAATTATTTAA-6.01
POU4F1MA0790.1chr5:30505097-30505111ATTAATAATTAATT+6.36
POU4F2MA0683.1chr5:30505097-30505113ATTAATAATTAATTAT+6.01
POU4F2MA0683.1chr5:30505163-30505179TTAATTAATTATTTAA-6.25
POU4F3MA0791.1chr5:30505163-30505179TTAATTAATTATTTAA-6.3
POU4F3MA0791.1chr5:30505097-30505113ATTAATAATTAATTAT+6.54
ZNF24MA1124.1chr5:30504791-30504804GAATGAATGAGTG-6.92
Enhancer Sequence
TTCCTCCGGG TGCTCCGGTT TCCAATGTCC AAAGACATGT GGTACAGGTG AATTGGGTAT 60
ACTAAAGTTA ACCGTAGTGT ATGAGTGTGA ATGAATGAGT GTCTATGGAT GTGTCCCAGT 120
GATGGGTTGC GACTGGAAGG TCATTTGAAA AACCATATGC CTCATAAGTT GGCGGTTCAA 180
TCCGCTGTGG CGATCCCAGA TTAATAATGG GACCAAGCCG AAAATAAAAT AAATGAATAA 240
ATGTATGATT AAAGCCAAGT GGTCAAAAGA TTTAATTGGA CAATTAACTA GTATTAAATG 300
CTGACATAAA TTCATAAATA ATTATTTCTG TAATAAGTGT AAATATAGTC TTCCCTTTTA 360
AATAAATGTT GGCTGGTGAA CGTATTAATT AAGAATTAAT AATTAATTAT TTTTAAAAAT 420
AGCATGAATA CCAAAGGGTT TATTGCTCTT TTAATGAATT TTAATTAATT ATTTAATTAA 480
TTAGCACATG TAATTTATTA ATGGTATTTG TCATCCATAA CTATCACAGC ATGATATGAT 540
GTATAGGAAG GAAGATAAAC AAATGCAATA TAAGAGCTAT ACATATGAAG ACATTTGAAC 600
ACAGACTAAG GCTCCCATGT TCGAATTATT ACATACATAG TAAAATAAAC TGAAGGCACC 660
AAGGGTTTTC ACTGGTATTA GTTCTCAGCT TAAAGTGTGA TGTGGCAAAG CCCAGTGCAT 720
TCATAACCTT GTGTCATAAA GCTGGTAATT CACAGGAAGC ACAGGAAACC ACAGCACAAT 780
GTAAAGGTGA ATGTTTGTTA AACATCTAAG TGATGGGGAA CTGAATCAAA TGTCCCACCA 840
TATGCTGATG ATGAATCATA A 861