EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR013-42326 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Intestine 
Coordinate
chr5:2539350-2541394 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CDX1MA0878.2chr5:2540588-2540599GGCAATAAAAC+6.32
CDX4MA1473.1chr5:2540588-2540599GGCAATAAAAC+6.62
HNF4GMA0484.1chr5:2539806-2539821TGGCCTTTGCTCTCT-6.5
HOXD9MA0913.2chr5:2540589-2540599GCAATAAAAC+6.02
POU1F1MA0784.1chr5:2540497-2540511CAAATTAGCATAAT-6.42
POU2F1MA0785.1chr5:2540499-2540511AATTAGCATAAT-6.44
POU3F1MA0786.1chr5:2540498-2540510AAATTAGCATAA-6.37
POU3F2MA0787.1chr5:2540498-2540510AAATTAGCATAA-6.22
POU3F3MA0788.1chr5:2540498-2540511AAATTAGCATAAT-7.82
RREB1MA0073.1chr5:2539946-2539966ACACAAACCACACAAAAACC+6.06
SPIBMA0081.2chr5:2540126-2540138TACTTCCGCATT-6.62
SPICMA0687.1chr5:2540126-2540140TACTTCCGCATTCA-6.12
Enhancer Sequence
AAATACAGTT TATCAACACA CACTGAGCCA GAGAAAGACT TGTTGCCATA TCACAATTAT 60
GCAGCGTTTT AACCACCCAA TGCTTATTTT ATGTATTAGA CATGTAAACA CACACAAGTA 120
CTAGTAAAAC AATACATGTT GACAACATTG TGAAGGGAAC AAGAGTGAAC GTTCTAAAAT 180
AATGATCGCC TAAAAAACTG ACTCCTGGTT GCAGAATATT TTAAACCCAC CAGCAGAAGG 240
CTTAATAACA GAAGTAAAGC ATATGTAACA TTCAGTGAAA GCAAAAGCAC TTTATAACAC 300
ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACAGCCTG ATGAATGATA 360
GTAAAAGTGC ATGTAGGCTG ATAGAATCAC TATATAAATA CAGTTTATCA ACACACACTC 420
GTCATATGTG GATTTACAAC ACTTCACCAC AGCTTGTGGC CTTTGCTCTC TCTGTGTGTG 480
TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TTTAGTATGG 540
GTGGAGGGTT TAACAGCCTG AGAAAGCTCA ATGCTTCCAC ATAAGACACA TGGTGGACAC 600
AAACCACACA AAAACCCCGC TAAATCGTGC GCACTTAGTT CACACAGCAG CCTGGCGAAT 660
ATAATAGCGA ACACAAGCGC GAAAAGATCA AGTTAAATCA AGAGAAACTG TAAATATGAT 720
CAGGATACTC ACTGTGAAAG AATCAGCTGA CACAACGGTG ACTCAGTAGA GCGCACTACT 780
TCCGCATTCA CTGGCGATGA CCTATGCGTC AGCCAATCAC GAGGCGCTAT GCCTATGCGC 840
TCGACTAATC AGGAGGCGGG ATTCGGAGAG TACTCGAGTA CTAGCAGCCA ATGGGGAATT 900
ACGGTGGGTG AGCGGCTCAA ACAACAGGCC GCCTGAATCC ACAAACACAC CCACAGACGG 960
GCTAATCAGA GCGAGGGTGA AGTAAGGGGG CGGGTGAAGC GTGAGCCAAT AGAAAATCAC 1020
AGCGCGGCAC TAGGGGACCA CGTGGTGCTC ATGCACGACT TGTGTTAAAG CGACGGAGAC 1080
GCAAACAAAA CAGTTGAAGG AAAACTGAGC GGAGATCAGT TAAAGAGGGA GAAAATAGTC 1140
AATAAAACAA ATTAGCATAA TTACTATGTT AATACCGAGC AAAACCAGAG CACACATGTT 1200
AAAAACTGAG CGGAGATCAT TTATAGAGGT AGAAAATAGG CAATAAAACA AATTAGCATA 1260
CGTATTATGT TAATATCAAG CAAAACCAGA GCAGACGTGT TCAAAACTGA GCGGAGATCA 1320
GTTATAAAGG TAGTATAGTT AATAAAACAG CATATTTATT ATATTTATCG CAAACAAAAC 1380
CATAGCACAT TTGTTCAGAG CATAACATTA CACCGTATAC GGTGTTATTG TATATCGATG 1440
GTTTGTTCTG TAGACTATCA AAAAATATTG CTTAAAGGGG CTAATCATTT TGACCTTAAA 1500
ATGGCTTTTT AAAAAATTAA AAACTGCTTT TATTCTAGCC TAAATAAAAC AAATAAGACT 1560
TTCCCCAGAA GAAAAAAATA TTATCAGACA TACTGTAAAC ATTTCCTTTC TCTGTTAAAC 1620
ATCATTTGGG AAATGTAAAA AAATAAAATA AAATTAAAGG GGGCTAATAA TTCTGATTGC 1680
AACTGTGTAT ATATATTTGT TGATGAGAAA AAGTTTTCAA ATCATTGGTC ATGAGCATAT 1740
TAAAGAAGTC CCGCCTCCAT CAGTGTTATC AGTCGCTCCT GTAATCAGTA ATGTGTGTTT 1800
CAGTGATGAT GAAACTGCAG ATGAGGGTCA AGGTGTTTCA GTCTCTCTCT GTCCTCACAC 1860
ACAGGTCAAA AACTATACAG AGTTTCTCAT TCTGACTGTC TAAAAACTGT TTACATTATC 1920
ATATCACACG CACATCTACA GTTGAAGTCA GAATTATTCA CCCTTCACCC TTTCCCAAAT 1980
GATGTTTAAC AGAGCAAGAA TGTTTCACAA AAAGAAACAA AATGTGTTTG AAGATATCTG 2040
GAGA 2044