EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR013-40186 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Intestine 
Coordinate
chr4:9927843-9929424 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXE1MA1487.1chr4:9927989-9928004TATGTTTATTTAATA-6.12
Lhx3MA0135.1chr4:9927972-9927985AAATTAATTAAAT+6.07
RUNX1MA0002.2chr4:9928953-9928964TTCTGTGGTTT+6.32
Enhancer Sequence
AAAACCTCAC ATATGGGGGC TCGTCTGGGA TTGAGCAATA CTTTATTGAA TCAAAATGAA 60
ACCAAATTGT GTTATAAAGC GATACTAACA TAAAATATGA AATTATATAA ACTTAAAGCA 120
AAACATTATA AATTAATTAA ATAAATTATG TTTATTTAAT ACAGTAAATA TTTACATGGA 180
TTGTTGGAAA ATGTATTATT TTTGCGCTAT ATATTGCAGC TATTTATGGG TTTAAGGACA 240
AAAATATGAT ACTTTTTGCT TTTAAAAGAT TGGTGTAACA AACTTTTGTA CTTAAAGTAA 300
AATAAATTTA TCAAAGCAAC TGAGAATGGC AGATTTACCC TCCAAAAAAA CATTTTTTTC 360
CTATTAGCAA TAATACAGAA ACCACTATTG TCATAACCAT GTATCAGTTT GCAATAATTT 420
AGATTTAAAT GTTCTGTCCT CTTTTAGTAT GGACGTTCAG TATTCTCTCT CCTTTTCAAA 480
CAGACTATCT GCCCATTTTA GGTCACGACC TGGCAGTTGA GAATTGCTGC TGTAGATGGT 540
GGTTGATAAC TTCCTGTGTC TACCCACCTA GCATGCGCTC TACTCCCTGA CACACTTAAC 600
CGTAGCCTCC CAGGTCCTCG CAGCCATGGC GACAAAGTGT TTTGACAACG TGAGGAGCAG 660
GCTGTACACG CTGACTGAGG TTTCGTGGTT TTGACACACC GCCAGATCTT TCTCGAGAAT 720
CCAGCTTGAA CTTTTAAAGA GCCCGGTTTT AAGCACATAC ACTTATTAAT TCCTGAAAAG 780
ATGGCGCATT CTTTGCGCGA TTCAGAGCTT TGCAATACCA CCCAGTCTTT TCACTTTGCA 840
GGCCAACATA CTTGTTTTCT GTCACCCCAC CCGCACGCGC TAACACACAC AGTCGCAACC 900
ATGTCTGTCT CTTACACAAG CATGACAGTG AATTCCTGTG GTGCGTAGAC AAAGTTGCTT 960
CAGAATGCGT TGTTTTGTAC TTTGTCAAGT CAGTCAGTGT TACTCATGGC ATGACCATGT 1020
TGTCATCTCT TGCGGTTGAT GCCACTTTGA TGGCATTTGC TTCCTCTTTG AATTATAGGA 1080
TGGATCCTGT GATCTCTGTC CTGCAGTGAC TTCTGTGGTT TTGTCACCTG CCTTCTGTTT 1140
CACTTCACCT GTTTCAGACT TACTAGCAGG TCGGTGCGAC TGTCTCGTGG CATCTCTCTC 1200
AGATCCTTTC ATGAAGGAGG TGGTGAAATT TCCCTTTTAA TAACCAGATG CTGTTGTGAG 1260
TCACGATTGA GCTGGCTGAA GCAGAAGTTG TGTGATCATT CAGGGTGTAT AGATGTCATA 1320
ATTAGGACAA ACGATATCCT TTCAGTGTGT AATGTAGGAC TACGCAGTAT ATTTAATTTC 1380
AGCATCGATA TTGCAATGCG TGCTAGGGTT AGGCGATGTT GACCAATTTT GTCGCCGAAG 1440
GCGGCTGTGA ATTTATTATT TATATTTGAT ATACTGTCCG ACGTGCACTG CCCAATGGAG 1500
TTTTGGGGCA TCGTCTATCG ACCCAACCCT AATGTACGCA TCCACAATAG TCATTAGAGT 1560
TATAGTTGAC CAGGAGCTAA A 1581