EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR013-39933 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Intestine 
Coordinate
chr4:4697595-4699122 
TF binding sites/motifs
Number: 27             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXC2MA0846.1chr4:4698824-4698836TAAATAAACAAA+6.18
Foxj3MA0851.1chr4:4698774-4698791TACAGGTAAACAAATAA+6.22
HNF1AMA0046.2chr4:4699014-4699029AATTAATTATTAAAT+6.39
KLF14MA0740.1chr4:4698626-4698640GGCCACGCCCCCTA+7.31
KLF16MA0741.1chr4:4698627-4698638GCCACGCCCCC+6.62
Lhx3MA0135.1chr4:4699013-4699026TAATTAATTATTA+6.18
Lhx3MA0135.1chr4:4699010-4699023GATTAATTAATTA-7.34
POU1F1MA0784.1chr4:4699066-4699080AATATGCAAATAAA+6.34
POU2F1MA0785.1chr4:4699066-4699078AATATGCAAATA+6.37
POU2F2MA0507.1chr4:4699067-4699080ATATGCAAATAAA-6.98
POU3F3MA0788.1chr4:4699066-4699079AATATGCAAATAA+6.04
POU4F1MA0790.1chr4:4698803-4698817ATGCATAATTAAAG+6.34
POU4F3MA0791.1chr4:4698803-4698819ATGCATAATTAAAGCA+6.04
POU4F3MA0791.1chr4:4699012-4699028TTAATTAATTATTAAA-6.3
POU5F1MA1115.1chr4:4699067-4699078ATATGCAAATA+6.02
POU6F1MA0628.1chr4:4699011-4699021ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr4:4699011-4699021ATTAATTAAT-6.02
SOX21MA0866.1chr4:4697682-4697697AACAAATGCATTGTT+6.05
SP1MA0079.4chr4:4698624-4698639TTGGCCACGCCCCCT+7.53
SP3MA0746.2chr4:4698626-4698639GGCCACGCCCCCT+6.82
SP4MA0685.1chr4:4698624-4698641TTGGCCACGCCCCCTAA+7.45
SP8MA0747.1chr4:4698627-4698639GCCACGCCCCCT+6.92
Sox11MA0869.1chr4:4697682-4697697AACAAATGCATTGTT+6.8
Sox1MA0870.1chr4:4697682-4697697AACAAATGCATTGTT+6.05
TCFL5MA0632.2chr4:4698207-4698217TCACGCGCAC+6.02
ZNF384MA1125.1chr4:4698750-4698762AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr4:4698751-4698763AAAAAAAAAAAA+6.22
Enhancer Sequence
ATCCTTTCAC AAGGACTTCC CAAATACAAA CCTGGCATAT TTATTATCAT ATTCAGCTAT 60
TTGTTGACGG TGTGTGTTGA TTCACACAAC AAATGCATTG TTAAACACAC ACACAAACAC 120
AAGCAAATAA ACAGAAATGC CTTCTGTCAC ATTAAACCGC TCCATATGGC GGAGAATATT 180
TACCTATAGG AGATCTGCTT CCTGAACGCC AGACCTTTGA GTTTATCCTC CAGCGAGTCA 240
TCCATGTCGG CGAAGCTGCT CAAGCTGTCG CTGCCGCCCA TCGCCGCGTT TTTCCCGCAG 300
CCGCGCGTCT GATCTTCCGC CGATTCCCCA CCGGCGGCTC CTCTGCCGCT GCGCTCCGCC 360
CGAGACGCTC GCATGTCGGC TAGGGGGTCC ATCATGCTCC GGTCGGCACC GAGTGGACCC 420
CCTTCTCCCC TCTGGTGCTT AGAAGTCCTT CCAAATCCAG TGTCCTCCGA TGTCCCTCAT 480
GTGTCGAACA ATATCTATCT ATCTATCTAT CTATCTATCT ATCTATCTAT CTATCTATCT 540
ATCTATCTAT CTATCTATCT ATCTATCTAT CTAAACAGTC GACCGATCGA TTTATTCTCG 600
ATTTACGCGC AGTCACGCGC ACGCACGGTC GGCGCGGCTC TATCCATGCA GAGCTACAAC 660
AACAGCTGCA TGCATCGGCG GGGACAGTAT GGGATTTGCC TCCTCATCCT CCAGCATCAG 720
GCGGTGAAAG TAGGGCAGAG GGTCTCCGGT TGGACACACA CGCGTGCGGA TCTCTGACGT 780
GTCCGCGGTG ACCGGGACTG AAAGATGCCC CAGTGGAGAC GAGCCGCCGC CGGAGCACTG 840
CTGTTTACGC GAGCCTTTAA ACCGGACACG ATTGTCTTTT ACAATGCCTT CGTTCAGACA 900
GGACGCTCAC GAGACACTGA GAGCGTACAC ATAAATAAAT AAATATTTCT GAAATAATAA 960
ACATATTTTT GTTAGATTAT TTTGTGTTTG TAATTTGTTT TGTTGTCAGG AACCAGTAAT 1020
ATTATCAGGT TGGCCACGCC CCCTAACAAA AACCTACTGT TGTAATATTA TGATAAAGCC 1080
TATTTTAATA TTGTATTATA TGATATGGAA TTGTAGTATA TTAAATTATG TGATGGAATA 1140
CGAGGACGAA ACCTGAAAAA AAAAAAAACA ATAAATAAAT ACAGGTAAAC AAATAAATCC 1200
AAAAATGTAT GCATAATTAA AGCAATAAAT AAATAAACAA ATAAATCCAC ACATTTCTGC 1260
ATAATTAAAA CAATACATAA ATAAAGAAAT CCACAAATAC CTGCGTATAT AAAACAATAA 1320
ATAAATAAAT CCACAAATTC CTGCATAAAT AAATCAGTAA GTTGATTAAT TAGTTATTAA 1380
ATCCACAAAT TCCTGCATAA ATAAAAGAAT AAGTTGATTA ATTAATTATT AAATCCACAA 1440
ATTCCTGCAT AAATATAACA ATAAATAAAT AAATATGCAA ATAAATAAAT AAACACACAA 1500
ATTTCTGCAT GAATAAAACA ATAAATA 1527