EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR013-39801 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Intestine 
Coordinate
chr4:2369938-2371397 
TF binding sites/motifs
Number: 39             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Arid3bMA0601.1chr4:2370814-2370825TTAATTAATAT-6.62
FOXC2MA0846.1chr4:2370877-2370889TAAATAAACAAA+6.18
LMX1BMA0703.2chr4:2370841-2370852TTAATTAAAAC-6.14
Lhx3MA0135.1chr4:2370811-2370824AAATTAATTAATA+6.37
Lhx3MA0135.1chr4:2370831-2370844AAATAATTAATTA-6.71
Lhx3MA0135.1chr4:2370834-2370847TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr4:2370835-2370848AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr4:2371148-2371161AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr4:2371147-2371160AAATTAATTAATT+6.92
Lhx3MA0135.1chr4:2371151-2371164TAATTAATTAATC+7.34
POU1F1MA0784.1chr4:2370586-2370600AATATGCAAATAAA+6.34
POU1F1MA0784.1chr4:2370820-2370834AATATGCAAATAAA+6.34
POU1F1MA0784.1chr4:2371012-2371026AATATGCAAATAAA+6.34
POU2F1MA0785.1chr4:2370586-2370598AATATGCAAATA+6.37
POU2F1MA0785.1chr4:2370820-2370832AATATGCAAATA+6.37
POU2F1MA0785.1chr4:2371012-2371024AATATGCAAATA+6.37
POU2F2MA0507.1chr4:2370587-2370600ATATGCAAATAAA-6.98
POU2F2MA0507.1chr4:2370821-2370834ATATGCAAATAAA-6.98
POU2F2MA0507.1chr4:2371013-2371026ATATGCAAATAAA-6.98
POU3F3MA0788.1chr4:2370586-2370599AATATGCAAATAA+6.04
POU3F3MA0788.1chr4:2370820-2370833AATATGCAAATAA+6.04
POU3F3MA0788.1chr4:2371012-2371025AATATGCAAATAA+6.04
POU4F1MA0790.1chr4:2370829-2370843ATAAATAATTAATT+6.63
POU4F2MA0683.1chr4:2370829-2370845ATAAATAATTAATTAA+6.65
POU4F3MA0791.1chr4:2370829-2370845ATAAATAATTAATTAA+6.78
POU5F1MA1115.1chr4:2370587-2370598ATATGCAAATA+6.02
POU5F1MA1115.1chr4:2370821-2370832ATATGCAAATA+6.02
POU5F1MA1115.1chr4:2371013-2371024ATATGCAAATA+6.02
POU6F1MA0628.1chr4:2370813-2370823ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr4:2370836-2370846ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr4:2371149-2371159ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr4:2371153-2371163ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr4:2371165-2371175ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr4:2370813-2370823ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr4:2370836-2370846ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr4:2371149-2371159ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr4:2371153-2371163ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr4:2371165-2371175ATTAATTAAT-6.02
Rhox11MA0629.1chr4:2371363-2371380AATATGCTGTTAATGAA+6.13
Enhancer Sequence
GAAATAAAAT GAACAGCAAA TAATAAATAA ACAGTAATGA TAGCAGACAG ATTAATAATA 60
AACGGAGGAA TACTAATAAT AGAGTAACGA TAATAAACAG AGTGACAATG ATAATTAACA 120
GAGTAATAAT AATAACAAGC AGAGTAATAA TAAGCAAAGT AATGTTAACC AGAGCAATAA 180
TAATAATAGA TGTATAAAAA TCAGAGTTAT TTAAACAGCA GCTCCACACC TGCTCTCCGG 240
TTGCTCCGCG GCTCGTACGG TTGATTGTCT CTGCTGCCGC CGCCGAACAG CCTCGGGAAC 300
AGCACGAACA CCAGCAGCAC CGCGGTGAAC GCCATGACGA GCTGCTGCGA GGAGGACAAA 360
ACCATCTCGA CCGGAAAAAC ACACAAAAAC TAAACTAATG CTGACCACCC ACACGTCCCA 420
CGAACATTCC CCCAATGTTG ACAAAAATCT TCTTCGGTTC GTGCCTAAAA CCGAGAACTG 480
CGACATCAGA GACCCCTGCA GGACTGGCGT GGAGTTACAG AGTCACTTTC CAAAACCTCG 540
AGTCAATTGA ACCGATTCAT TGTTTCGAAG TTAATGATGT TTTTTAGTTT TATTTTACAA 600
CAAAATCACT TCACATATAG ATTACGAAAC CCGCAAAAGC TACAAATAAA TATGCAAATA 660
AATAAATAAA TATATTAAGT AATAAACACA CAAATTCCTG CATAAATAAA GCAAAAAATA 720
AATAAATACG CAAATAAATA AATGAATAAA TACGCAAAAA AATAATATAA AAAACACAAA 780
TTCCTGCATA AATAAAACAA TATATAAATA CGCAAATAAA TAAATAAATG AATAAAAACA 840
AATTCCTGCC AAAAATAAAA CAATAAATGA ATAAAATTAA TTAATATGCA AATAAATAAT 900
TAATTAATTA AAACACAAAT TCCTGCCTAA ATAAAACAAT AAATAAACAA ATACACAAAA 960
ATAAATAAAT AAATTAATCA AAACACAAAT TCCTGCATAA ATAAGACAAT AAATAAATAA 1020
ATACGCAAAT AAAAAATAAA TGAATAAAAA CTAATTCCTG CATAAAAAAT AATAAATATG 1080
CAAATAAATA TATAAACAAA TGAATTAATA AAAACACAAA TTCCTGCATG AATAAAACAA 1140
TAAATAAATA AATAAAAACA AATACCTGCA TAAATAAAAT AATAAATAAA TTAATATACA 1200
AATAAATAAA AATTAATTAA TTAATCAATT AATTAATAAA AACACAAATT TCTGCATAAA 1260
TAAATAAATA AATGAATGTG AGGCTGTTTT TCAATGACAC AGACATGCAT TTACACAACT 1320
ACCCCCCTCA GTTTACCTTT ATCTTTATTA TATTACATCA AATGTGTAGC ACTTTTGTCT 1380
TTTCACTACA TCTAAACCAG TGCATTCACT ATAAAAAAAT TAAAAAATAT GCTGTTAATG 1440
AAAAGAGCTT GTTTTATCA 1459