EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR013-39784 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Intestine 
Coordinate
chr4:2131510-2132489 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXC2MA0846.1chr4:2132216-2132228TAAATAAACAAA+6.18
FOXD2MA0847.2chr4:2132214-2132227ATTAAATAAACAA+6.06
FOXE1MA1487.1chr4:2132213-2132228TATTAAATAAACAAA+6.98
Hmx1MA0896.1chr4:2132180-2132197AAAAGCAATTAATTAAA+6.15
Hmx2MA0897.1chr4:2132180-2132197AAAAGCAATTAATTAAA+6.25
Hmx3MA0898.1chr4:2132180-2132197AAAAGCAATTAATTAAA+6.47
NFYAMA0060.3chr4:2131529-2131540TCTGATTGGTT-6.62
ZNF384MA1125.1chr4:2132317-2132329AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr4:2132318-2132330AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr4:2132316-2132328TAAAAAAAAAAA+6.37
ZNF384MA1125.1chr4:2132315-2132327TTAAAAAAAAAA+6.44
ZNF384MA1125.1chr4:2132314-2132326ATTAAAAAAAAA+6.74
Enhancer Sequence
CTGTGATTGA TTTACAACTT CTGATTGGTT TACCTATGAG AGAAATCACC AGGAACAATA 60
AACAGAGTAA TGGTCAAACT ACTACTGTAC AAACAAGTGT TCACGATCAT GCAAATACTG 120
TCATAGGATA ATATGTGAAT GAGAGCAAAA GTTACACAGT TCAGTAGCTG AAGGACAGAA 180
GCAGAAGTGA AAGACAAACT ATAACTTAAG CAAACTGAGA AACACTGGAG AAGTGCAAAA 240
TGAGAAGCTC TGAAATAAAC TACTTACCTC TGACTGACTG AACACACACA CACACACACA 300
CACCCACACA CACTTTTGTT TCTCTCTCAC ACACACACTT TTTCTTTCTA GCACACTTTA 360
ATCACTCTCT TTTTCGATCT CTCTCTCACA CACACACTCT TATTTACTCC CACAAACTTT 420
GTCTCATACA CACAGACACA CTTACAGACA CACACCAACA ATCTCCCTCT CTCTCTCTCA 480
AACATACACA TGATTTTCTT TTTTGTTTTT TAATTTGTTT ATTAAACTTT TACAGATATA 540
ACAAAGTATT TTTACAAAGA AATTTAAACA AATATTTTTC CCACCTTACC CAAGCTGAAA 600
TTACATTTAT CATTTCAAGA AAGAAAAAAA ATGCTCATGA TAATAACAAT AAATCAACAA 660
ATAAATAAAT AAAAGCAATT AATTAAAGAA AATGAATAAA TTATATTAAA TAAACAAATT 720
AATAGAATAA AAAATAAATA AATTAAATAA AATAGAAACA TAAAACATCC GTACAGAATA 780
TGTATACGTT GATAACCCAA TATTATTAAA AAAAAAAAAA GAGTCCTCAG GTATTTATAA 840
AGTACCCACA CACATGCTTT TCACACACAA ACACACTTTT CTCACACTAC ACTATAGTCA 900
TTGTATTACT GCAATTTTGG CTGATTCTAT TTTTCAGACA CACACTGACA CACACTCTCT 960
CAAACACATA CATGCACAC 979