EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR013-39716 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Intestine 
Coordinate
chr4:887470-888647 
TF binding sites/motifs
Number: 54             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HOXA10MA0899.1chr4:888206-888217AGTAATAAAAA+6.14
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RFX1MA0509.2chr4:887982-887998AGTTGCTATGGCAACA-6.78
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RFX2MA0600.2chr4:888180-888196GGTTGCTATGGTAACA-7.23
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RFX3MA0798.1chr4:887823-887839AGTTGCTATGGTAACA-6.48
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RFX3MA0798.1chr4:888180-888196GGTTGCTATGGTAACA-7.28
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RFX5MA0510.2chr4:887771-887787AGTTACTATAGCAACA-6.7
RFX5MA0510.2chr4:887823-887839AGTTGCTATGGTAACA-7.13
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RFX5MA0510.2chr4:887982-887998AGTTGCTATGGCAACA-7.42
RFX5MA0510.2chr4:888180-888196GGTTGCTATGGTAACA+7.54
RFX5MA0510.2chr4:888180-888196GGTTGCTATGGTAACA-7.54
SOX15MA1152.1chr4:887841-887851AAAACAATAG-6.02
Enhancer Sequence
CACACACATA CACGCATACA CACACGCACA CACACGCACA CACACGCACA CACAATCTTT 60
TCAGCTTCTA CAGTGTATGT TGTACAGTGT GTTTTATTTT TGCTCACTGA GTTTCTCTAC 120
TTCTCCAACT ATCAGCGAGT GTGTTTTACT TCAACCCATA TGAAAACACA CCGCAGTTGT 180
TTATTATAAA CTCTGCAATG TTCTTAAACC ATATAGCAAT TTACTTAATC TACTGCGGTG 240
ATTCTACAGT TGCTATGGTT ACACAACAGC AATAGTAATT GTTCTGCAGA GGTGATTCTA 300
CAGTTACTAT AGCAACACAA CAACCATAGT AATTTCTGTT GTGGAGATTC TACAGTTGCT 360
ATGGTAACAC AAAAACAATA GTAATTGATC TGCTGTGGTG ATTCTACAGT TGCTATGGAA 420
ACACAACAAC AATAGTATCT GATCTGCTGT CGTGATTCTA CAGTTGCTAG AGCAACACAA 480
CAATAGAAAT TAATCTGCTG TGGTTATTCT ACAGTTGCTA TGGCAACACA ACAGCAGTAA 540
ATGATCTGCT AGTGTGATTC TACAGTTGCT GTAGCAACAC AACAATAGTG CTGTGGTGAT 600
TCTACAGTTC CTATGGCAAC ACAACAATAG TAATTGATAT GCTAGGATGA TTTTACAGTT 660
GCTACGGTAA CATAACAACA ATAGTTATTG ATCTCCAGTA GCAATTCTAC GGTTGCTATG 720
GTAACACAAC AACTATAGTA ATAAAAAAGG ACCCAATACT GAAGTTTTCT ACAACCACAG 780
AGTATATTAC AACCCACCAC AGTTTACTGT AGTAAAAACT AAAGTGTATT ACTTTATCAG 840
TTCACCAGAG TTAATGCTAT AGGAATTGTA AATTCTATGA TAAATACAGT ATATTACACT 900
TAAATATGAT TCAAAACAGA GTATTTACTT TAGTTTACCA TCCTGTTTTT GCTGTGGGAG 960
GATCAGCAGT GTCTCTGAAG CGCCTCCTGC TGGAGAAACA ACACATTACA TTATTATACA 1020
CACCTACTGT TTGTATAGAA GTCGGTCAGT AAGTCAGAAA TATCAAAATA TTAGCTGAGA 1080
GCTCTGGTTT ATTGGTGCTA GCATGTTCAT TTTTTATACT AAAAAATTGT CTGCATGCAA 1140
ATTTCAGATG CAGAAGCCTC TATGAGCCAT CTGAAAT 1177