EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR013-39709 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Intestine 
Coordinate
chr4:849749-851201 
TF binding sites/motifs
Number: 17             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr4:850143-850162CTGTCAGCAGGTGGCGCCA+6.42
Foxq1MA0040.1chr4:850050-850061TATTGTTTATT+6.62
GBX1MA0889.1chr4:850096-850106GCTAATTAGT-6.02
HNF4GMA0484.1chr4:850854-850869TGACCTTTGACCTCC-6.53
HOXB3MA0903.1chr4:850096-850106GCTAATTAGT-6.02
LHX6MA0658.1chr4:850096-850106GCTAATTAGT-6.02
Lhx3MA0135.1chr4:850025-850038TATTAATTAATTA-6.25
Lhx3MA0135.1chr4:850028-850041TAATTAATTAAAT+6
NR2C2MA0504.1chr4:850854-850869TGACCTTTGACCTCC-7.95
NR2F2MA1111.1chr4:850852-850863TCTGACCTTTG-6.14
Nr2f6MA0677.1chr4:850854-850868TGACCTTTGACCTC-8.42
POU6F1MA0628.1chr4:850026-850036ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr4:850026-850036ATTAATTAAT-6.02
RUNX1MA0002.2chr4:850415-850426AAACCACAGAA-6.32
RXRBMA0855.1chr4:850854-850868TGACCTTTGACCTC-7.95
RXRGMA0856.1chr4:850854-850868TGACCTTTGACCTC-8.12
RxraMA0512.2chr4:850854-850868TGACCTTTGACCTC-8.12
Enhancer Sequence
TATTATAGCT ATTTTTATAA GGACAATGAT GCATATTTAA TCCAATCTAT TAGCATCAAG 60
TTAATGGCCT ATTATTTATA TATTTATTAA GTATTTTTGG TACAAAAATT AGTTACTGTG 120
GGTAATTATA ATTTTAATAA TATATAATAT TAATAATAAT AATAATAATA ATAATAATAT 180
GCAAAAAATT TCATGCAGAT TTTCAAGCAA AAATTACATA AATGTTACGC TAAAATAAAG 240
ATACTTTTTT TATAATAATA ATTTTTAATA ATGCTTTATT AATTAATTAA ATGTTTTATT 300
TTATTGTTTA TTGTTTAGTT ATTATGTTTT GTTTTATTTA AAGTATAGCT AATTAGTGAG 360
TGCGCATAGT TTGTATGTGT GTGTGTGTGT TAGTCTGTCA GCAGGTGGCG CCACACACCC 420
ATTCGTTTCT CTGTACTTGT GCAATCATCT TCAGCTGCCA GCTAAACACA CACACTCACA 480
CACACACACA CACACACTCC CGACTGCAGT GTAAATCATC TGCGTTTATG ACAACTATAT 540
TAACAGTAAT GATTTCCCGC AGACTCCAGC AGGCATTTAA GGAAGCAGTC CATGTCATAA 600
ATTACGCCGT TTCTACAAGA CTCAAGGAAT AAAGGAATGC TGCGGGTTAA CAGCTCAAAC 660
CTGACTAAAC CACAGAAAAC CAGCTCTGAA AAACAAAGAT GTTTACAGCT CGCATTGTGC 720
ATTATGGGAT GCTGATCTCG GCTCTTTTGA TGTAAATTCA ACTCTACAGT TTAACAAAGT 780
GACTTTTATT GATATATTTG AACCAATATA ATGTGTAACA AATGCCATAT CTAGAGAAAT 840
AAGTCTGTAC AATAACAGAA ATGTGCTTGC AGCTTACTTC AATGCTGTTG TAGCGTAATA 900
TACAACACCA AGCCAGACAA TATAGCACTA CACACTATTG CAAATGAGCA GAAAAGTCGT 960
TATCAGAAGA AAGATCAAGA TCCCACAAGC ATGAAAATAT CAACCACAAA ATACGGAAAA 1020
CTGCTAATTT AGATCGTCTT AACAGTGTGT GTGTGTATTT CAGAGGGCTT AAATGCATCT 1080
GTTAGTGTGT GTCAGTGAAT CGCTCTGACC TTTGACCTCC AGCACGTGTT GAGGTGAGCT 1140
GTTGTTGCGG ATGAAGCCGT CGCTCGTGAT GTTCCAGAGC TGCTGCGGCC GAGAGACGTC 1200
TGAAGACAAA ACCACTCGAC ATCCAGACAG AAGAACAGCA GAGGCCGAGT CCACTACACA 1260
ATCCAGCACG CACTGACACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA 1320
CACACACACA CACACACACA CAGATGGCGT GATCAGAGCT CCTTATCAAA GTGTTGTGTG 1380
TAATCTGATT GTGAGGGTCA TCAGTCATCA TCTAATATAT AGATGTGCTT GTCTACCTTG 1440
CACTGCAGGT GT 1452