EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR013-39458 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Intestine 
Coordinate
chr3:58160793-58162243 
TF binding sites/motifs
Number: 16             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BHLHA15(var.2)MA1472.1chr3:58161782-58161792AACAGCTGTT+6.02
BHLHA15(var.2)MA1472.1chr3:58161782-58161792AACAGCTGTT-6.02
FOXF2MA0030.1chr3:58162185-58162199ATTGTTTACCATGG-6.23
IRF1MA0050.2chr3:58161663-58161684TACTGCTTTCGGTTTCAATAT+6.42
IRF3MA1418.1chr3:58161666-58161687TGCTTTCGGTTTCAATATCGA-6.97
IRF4MA1419.1chr3:58161666-58161681TGCTTTCGGTTTCAA-6.8
IRF8MA0652.1chr3:58161667-58161681GCTTTCGGTTTCAA-6.48
IRF9MA0653.1chr3:58161667-58161682GCTTTCGGTTTCAAT-6.41
MSCMA0665.1chr3:58161782-58161792AACAGCTGTT+6.02
MSCMA0665.1chr3:58161782-58161792AACAGCTGTT-6.02
MYF6MA0667.1chr3:58161782-58161792AACAGCTGTT+6.02
MYF6MA0667.1chr3:58161782-58161792AACAGCTGTT-6.02
Nkx3-2MA0122.3chr3:58161283-58161296TTAAACACTTAAA+6.37
Tcf21MA0832.1chr3:58161780-58161794AAAACAGCTGTTAT-6.39
Tcf21MA0832.1chr3:58161780-58161794AAAACAGCTGTTAT+6.64
YY1MA0095.2chr3:58161314-58161326CAACATGGCGGC+6.37
Enhancer Sequence
ACATAAACAG AGGGGCTAAA AATTCTGACT TAAACTATAA AACTCAAGTC AAGGTATACG 60
GTTGACGTTT TTATGGAGTT AAAGTTGGTT TTATATTCGC ACAGTCGTTC ATTTAGCAGT 120
CTCTACCATG TTATGATTAT TCGATAGAAA TTAGCATGCA AGTATGATTT CTAAACAACA 180
TTAACACTGT ACTTTGATAG TCATTTGCTG CCAGTATGAT TTCCCTAGTT AGAATTTGCA 240
AAGAATATTT ATCTGACATA ATATTATTAA GGAGAATGTC TGAATATCCG AATATAAAAC 300
CAACTTTAAG TTAGCTCTAA GACTTCGGCC TATACGCATA TCGACCTTAA GCTAACGGTA 360
ATTGTTTATG GACTAAAAAT GTTGCGTAGG GTCAGGCTAA TATCTGTAAA AAGTATTTAA 420
CATACCTCTT CATTGTGTCG GGTTTAGTTT GATAGTGATA ATCTTCTTGG CTCACGTTAA 480
TAACGCAGTT TTAAACACTT AAAGCGCTGA AACTTCGGGA ACAACATGGC GGCGGCTGGA 540
ATATTTTTAA AAGTAAGTTA TGTTCTCATT ATACGAAATG ACAACTATGA ATCACATCAA 600
ACATGATTAA ATACAGGCCT AGCTGTTAAA TACGTCCTTG TATGAAATGA AAAGCAATGT 660
AGGCTAATTT AAAGTTGCGG TGTCCCGACT CGCCCATGTT TTTTTTGGTC CTGTTTGTGT 720
GTGTGCCCCT AAAACTTCAT TTGCGAACCG TCAAGTGTTT GTTTACACGC TTAACTCAAT 780
CCCATATATT CATGTGAAAG TGTTTCAACA TACTTACCAC AACAAGCGAG GATTTGAAGA 840
CCTATTTCGA ATCATTTGTA GTGTCGACTG TACTGCTTTC GGTTTCAATA TCGACCAAAC 900
ACTCACTCTC AGGCAGCTGA GCTCAGGCTG AGCGGAGGAG TGGGGAAAGT GGACGCGGCT 960
GGAATGTTGA AGAATGACGT TGTGTACAAA ACAGCTGTTA TGTTGCCTGA TGCAAACAGT 1020
ACCTTGTATT ATATTAAATA GTTTTTTATT AAATGTACTG TCATAAACAC CCTGGTTTGT 1080
AGAGGAATTT GTTCACTCAT TTGTTACTAT TCTGGCAATC ACATACTAAC AAATACATGT 1140
ATCTAATGCA CAGTAAAACC TTTGTAATTC CAATGATAAA ATTACATAGA CTGTATAAAA 1200
AGACTGTATA CACATCAGTG CTCCCAGTCC CAAAAGGAAT TGAATGCAAT GATGTCTACA 1260
AAAATAAAAT AAAGTGCAAT GTAGTGAAAA TTAAATTAAG TAAACTGCCC CTAACAGCCA 1320
GATGAATATT GAGGTAAAGT TGGTTTTATA TTCACACATT TATTAAGTGA CCACCTGTGA 1380
CACACTCCCT ATATTGTTTA CCATGGTACT TTAAATATTT GGTTTTAAAT AGCATGCAAG 1440
TGTGACTTCA 1450