EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR013-39271 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Intestine 
Coordinate
chr3:55266100-55267926 
TF binding sites/motifs
Number: 25             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr3:55266369-55266381GAATATTTGTTT+6.18
Foxd3MA0041.1chr3:55266393-55266405GTTTGTTTGTTT+6.32
NFAT5MA0606.1chr3:55266309-55266319AATGGAAAAT-6.02
NFATC1MA0624.1chr3:55266309-55266319AATGGAAAAT-6.02
NFATC3MA0625.1chr3:55266309-55266319AATGGAAAAT-6.02
POU1F1MA0784.1chr3:55266836-55266850AATATGCAAATGAT+6.86
POU1F1MA0784.1chr3:55267313-55267327CTAATTTGCATAAT-8.12
POU2F1MA0785.1chr3:55266836-55266848AATATGCAAATG+6.74
POU2F1MA0785.1chr3:55267315-55267327AATTTGCATAAT-6.92
POU2F2MA0507.1chr3:55267313-55267326CTAATTTGCATAA+6.13
POU2F2MA0507.1chr3:55266837-55266850ATATGCAAATGAT-6.78
POU3F1MA0786.1chr3:55266837-55266849ATATGCAAATGA+6.18
POU3F1MA0786.1chr3:55267314-55267326TAATTTGCATAA-7.22
POU3F2MA0787.1chr3:55266837-55266849ATATGCAAATGA+6.37
POU3F2MA0787.1chr3:55267314-55267326TAATTTGCATAA-7.22
POU3F3MA0788.1chr3:55266836-55266849AATATGCAAATGA+6.02
POU3F3MA0788.1chr3:55267314-55267327TAATTTGCATAAT-7.22
POU5F1MA1115.1chr3:55267315-55267326AATTTGCATAA-6.14
POU5F1MA1115.1chr3:55266837-55266848ATATGCAAATG+6.32
POU6F2MA0793.1chr3:55266645-55266655ATAATGAGCT-6.02
Pou2f3MA0627.1chr3:55267312-55267328TCTAATTTGCATAATG-7.24
TBX19MA0804.1chr3:55267547-55267567CTTCACACCAAAATGCCAAA-6.18
TP63MA0525.2chr3:55266120-55266138GAAAAGTCACAACATGTC-6.33
ZNF384MA1125.1chr3:55266488-55266500TGTAAAAAAAAA+6.07
ZNF384MA1125.1chr3:55266490-55266502TAAAAAAAAAAA+6.37
Enhancer Sequence
GTGTCTTTTC ATCATGGAGT GAAAAGTCAC AACATGTCGG TTGTAAAGTA TTCTTGACCT 60
CCAGAAACAC AGTGCCATTG TGTGTCTGTA AGCAGCAGTC ATAATACGCC AACTGTGTCT 120
AGTTCTGAAA TGCAAAGTCG CTTCAGAGGA AGAGAATGTC ATTATATTCT GAATGATAAT 180
CTGATTAAAA AGGCCTTGTT TTCTTAATAA ATGGAAAATA AGACATGGGA TTTTTATTCA 240
AAAGCAAAAT AGTGCCAATA TTAATTTTAG AATATTTGTT TTATTTAAAT AATGTTTGTT 300
TGTTTCTTTC TAATTGGACA TCTCGTCTTT TATAAACATC CCACAATCAT ACATGATAAT 360
ACTGCTCAGC AGCATCACAC TCGTCTTTTG TAAAAAAAAA AACATACTGG GACTGCTAAA 420
CGAAAAGCAG GGAATGTGAC CTGAATAACA ATGAATATTT TTTTTAATTA TGTATTGAGG 480
ATGAGAAAAC GCTGTAACTA TGGATACCCT GAGTGAGATC AGTTTCCCCA CAGGCTCAGG 540
TCTATATAAT GAGCTCATTA AGTGTATATG TAAAGAGAGC TGATGAACCA CACAAGTCCA 600
TTGGTTAAGG AGAATTAACC ACAAAGTAAT CCCAAGCTAG TCTGTAATAT AATTAGTTTA 660
AATACTTCTT AACAGTTAGT TAAAAGTAGC CTGTAGATTT ATTTACTGCT ATATGAACAG 720
GTGAACATTA TATGAAAATA TGCAAATGAT TTTATAACAC CCTACCTTAG ACATTACACA 780
TTTTTATATG AGATTAATGT GATAAAATCA CTTACCAAAC ATTGGTTTGT CTAGGGTTAT 840
ATCCATATTT TGACTCATGT AATGAGCAGT TACAGCAAAA TGGTGGTTGG TTTTGCTCAC 900
TCATGTTCTG TTTTCCTATT AAAGTTTAAC CAGAAAATAC ATGTCATAAT TGCAGTATCC 960
ATAAAGCACT GTTTACACAA GGCAAACAGA AGGAGCTCCT TCACCAAGTT GTATTAGTTA 1020
AAGTGCCTCT ATTATGCTAT TTTGAATTTA ACCATTCATG CAATGTGTAA TGTAGCTGTT 1080
TTTGAATGTA AAACTGCGAA ACTAAATTTG TAAAAAGAAG CAAGCACAAC AAATAAACTT 1140
ACAATCCGAA TCTGAACTGC CAAAATCATC AGCGAATCCA GGTTTACTTT TGCAATAGTC 1200
TACACATCCA AATCTAATTT GCATAATGAA CAAACCACCA ACTATTCCAG CATGTTTTAC 1260
TCAGCGGATG CCCTTACAAC AGCAACCCAG TACTGGGAAA CACCCATACA CTTTCACATT 1320
CACACACACA CTTGCACACT ACAACCTATT TAGTTCATCC AATTTACCTA TAGCGCATTT 1380
CTTTGGACTG TGGGGGAAAC CGGAGCAACC GGAGGAAACC CACGCCAACA TGGGGAGAAC 1440
ATGCAAACTT CACACCAAAA TGCCAAATGG CCTAGTCAGT ACTCAGGAAC CAGTGACCTT 1500
CTTGCTGTGA GGCGACAGTG CTAACCACTG AGCCACTGTG CTGCCATATC AGATCATGTC 1560
CACAAAAAAA AATCTATATT TAAGTCACTT ATCTGCTCTG TTAGTCTGAG ACAAACAAAA 1620
ATAAACAGAA AGAAGAAAGA ATGAGCTTCT TTTTTTACAG ACAATAGCCA CAAACATTTG 1680
AACAGTAAAA TCAGTGTCCA TCATGTACGC TGGATTTAGA AAGAACTCTG AAAAGAGGGT 1740
GAGATATTTT TCCTTGCTCA GCTTTGTAGC CTTTAAGATG GATTTATACT TTTGACTAGC 1800
GCTGCATCGT GTACCTATGC GGACTA 1826