EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR013-39254 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Intestine 
Coordinate
chr3:54957461-54959112 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxj3MA0851.1chr3:54958363-54958380AAAGAATAAACAAACTC+6.21
POU2F2MA0507.1chr3:54958536-54958549ACATGCAAATGCA-6.37
TWIST1MA1123.1chr3:54958644-54958657GAACATCTGGAAG-6.07
ZBTB18MA0698.1chr3:54958644-54958657GAACATCTGGAAG-6.48
Enhancer Sequence
GAACTGTTAT ACCTTTATTT CTAAGCCCAA CCTGGGTTTA GCATGACCTT TCTTCTTTAA 60
TTCTGAAAGC CCCACTGTAT TATAAGGGTT TCCTAAAATA CCTCAGGAAA AACAATTGTT 120
GTCCAATACA GCAAGCTTTA AAGGCTTTAG AATGAACGGG AAAAGCAAAC ACTCGGAAAC 180
TCAGAGCATA TTTGTGTAAC TTCAACTCTT GGGGAGACAT GTGTGACTTT TTAACCACAT 240
GACATAAAAT TGAGAAGTAT CAATGCCATC AAAGAGAAAC ATTAAAGAGG TCCCATTTGG 300
GATTGTTCTT CCCAATGAAA GGCGCGGTCC TCAGAGGATC TCAGTCATTA AGTGACACGC 360
TGAGAAACAT CAACAATTAA AGGAAATTAA AAGAGCTCAG ACAGATTGAC AGTGGCTTAA 420
TTTCATTAGT CTTGCAAACA TCATTTAGAC GCCCAGCGTG TGGTCCACCG TACAAATGGG 480
GTTTATAACC GCGCATTCCT GATGAGGAAT TCCACATCTT CAGCCCGCGC GCCAAATGAC 540
GCGCGCCGCC GCATTCCAGC ACCGCGGCGC GCGCGTCGCA GGGTCTGTGC TCTCGTCACT 600
TCAGTCAGTT TAAACTCACA GGCGAGAATG ACTCAAAGTA ACCCTCAAAA CAAAAACAAC 660
AAGTGACGAC AACAAAATAA TAATAAAAAA CACAAATACA AGACATAAGA ACTCACTTAA 720
AGTGATAGTT CACCCCCAAA ATAAATTATG CTCATAGTTT CTCTCTCTCA AGTAGTTCCA 780
AACATTCCTG AGTGTCTTTT TTTTCAGTTG AACTCAAAAG ACGACAATTT GAAGAAGGCT 840
GGATAAATAT GAAGTCTAAT GGTTACATGT TTTCATCATT AATCGAAATA TCTTCGTGTT 900
CAAAAGAATA AACAAACTCA AACAAGATGC CTGACAGGTG AATGATGATA ACGACGACTG 960
AACTTTCAGT TTTGGATGAA CTATCCCCCT ACAAGTTTTC TTAAGTTTAT TATTCATTCA 1020
CCTCTTCTCT CCTCTCACGA TCTCAATCAC AAGAAAAGGT GTTTGACAAT CAATAACATG 1080
CAAATGCAAA GCAAACACTG AAGCGCACGT GTGAAACCCA ACAAGTTTTT GGCCAACCCA 1140
AAATCAAGGC CAGTGAATTG AACGCCACAG CAGTGGAGTG GAGGAACATC TGGAAGTAAT 1200
GAAGAGCTCC AGCAGCAGTC CCACCCTCTC CCCAGAGCCA CAGCAGTCAC GGGGCTTTTC 1260
TTTTCACCTC AAACCGCCAT CAGCACAAAA TCAACCGACA TCACCGACGA CGAGCATGCT 1320
TAAATGCGAG CACAAGAGCA ATATTCAGAT GTAACAACAC ACATACACAC ATTCTGCTTT 1380
AACCATTACA AAACGCGCGC GCACAAACGA ATAAACACTT CAATTAAAAA AAAGAAAGAA 1440
AGAATCTATT GATTCAGTTC ATGATATAGC TTTATGCCCT ATAAATTAAA TATAATTCTA 1500
CAGGCGCGCG CATGTGAACT ATAATAACAG TAGCCTACTA CTAAACGCAT TGTGCGCGCT 1560
TCCCCATGAA ATATGGCATT TTCACAACCC ATCCATTAAA ATAAATTTTA AAAAGGTGCA 1620
ATGCTTCTTA AAAAGATGAA ATATCACCTA T 1651