EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR013-39218 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Intestine 
Coordinate
chr3:54676878-54678515 
TF binding sites/motifs
Number: 16             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOSMA0476.1chr3:54676916-54676927AATGAGTCAGA-6.32
KLF14MA0740.1chr3:54678131-54678145AACCACGCCCCCTC+6.29
KLF16MA0741.1chr3:54678132-54678143ACCACGCCCCC+6.14
LMX1BMA0703.2chr3:54678267-54678278AATTTAATTAA+6.32
MEF2CMA0497.1chr3:54677851-54677866GGCTATTTTTGGCAA-6.51
Nkx3-2MA0122.3chr3:54678215-54678228GAAACCACTTAAT+6.24
PHOX2AMA0713.1chr3:54678266-54678277TAATTTAATTA+6.62
PROP1MA0715.1chr3:54678266-54678277TAATTTAATTA-6.32
PROP1MA0715.1chr3:54678266-54678277TAATTTAATTA+6.62
Phox2bMA0681.1chr3:54678266-54678277TAATTTAATTA+6.62
SOX10MA0442.2chr3:54677107-54677118GTCTTTGTTTT-6.14
SOX15MA1152.1chr3:54677076-54677086AAAACAATAG-6.02
SP1MA0079.4chr3:54678129-54678144TCAACCACGCCCCCT+6.14
SP3MA0746.2chr3:54678131-54678144AACCACGCCCCCT+6.09
SP4MA0685.1chr3:54678129-54678146TCAACCACGCCCCCTCG+6.04
SP8MA0747.1chr3:54678132-54678144ACCACGCCCCCT+6.52
Enhancer Sequence
AGAGGCACAT TGCCTCATAC AGAAAACATT CAGTCAGAAA TGAGTCAGAT ATTAATTCAA 60
TAACTGCTCT GGTGGATTTA CCAAGTAATT CATGAGAAGA ACTGAATCAT TGAAATGCTT 120
GTCAGTGTGT GGGACTTTTA TAATTAGTAA TGACTCAGTT GTGCTTGAAT GCAGCTGCAT 180
TTTGCAGATG CCAAAGACAA AACAATAGAA ATAAGGTGGA TTGTTTATGG TCTTTGTTTT 240
ATTTCATAAT AGCCAGTCTT TATACTTCAT CAGATTCAGT TTAGACCAAA AACCAATTGC 300
AAACTTATTA TTATTCCTTT AGTTCTGGTT AGGGGAGTTT TGTATATGCA CAGACATATA 360
CTTCTGGTAT ATATATATAC ACATTCAACC TTCGAAAAGC CCTCCAAATG TGTTCCTGGT 420
TATACATAAC AAAACAGATT TATCGCAGCA CACCACACTC TTTAAAAGCC CCTATGATTG 480
AGTGATGATA AAAGCCACTG TGAAAAATAT AAACTGCAGA GACACGAACT CCCACAGATG 540
TTCATAAATC TTGAATAGCA GACGATGAGT GAAAGTTTAA ACTCTGAACT CCTCATAATA 600
GTTACTTATC AGCAGGCCTC AGGCCAAAAT AAAAAAGCGG CTCCTTGTCT CACAACGAAA 660
AGCTCTACAC TTTCCTCATC CATGAGAAAA GCTGAAACAT GCTGACCGCT TAGAGAGGAA 720
TGTGGCCTGA TATGATCACT GCTCTTTCAG CATGTGTGCA ATGTGATGAC TGTCAGATTA 780
AAGAGCAGAC AGGAGCGAAA GCCCAAGCTC TGAGGACAAC CGTCAGCCCA TGCCAGTGCT 840
TTCCCGCTAC AGCTCAGCTC AGTCTCTTGA CATTTATCTG TGCTCTGAAA TGCATTCGTT 900
AAAATTTCGC TTTGGTTTTT ATGTGGTTAG ATGAATTACT CTGGACTACA AAACCTTAAG 960
ACGTAAGTTG TGAGGCTATT TTTGGCAATA GACATACATA CATACACATA TCATGGAAGA 1020
CATTAACTGA TGACCTTTGT CTGTTTGTTG TAATTGATGA CTGTATAAAA TATGGACAAC 1080
GTGACAACGC CATTTCCTAT TGAACGATTT GAAGGAAAAA TACCTTATGA CAGGCACAAA 1140
CTGTCGCAAA ACTGCTGAAA TTGGAGCCTG GGCATATGCA GAAAGACTGC CTGATGAAGC 1200
CAGAGGCGGA GCTGCGGAAT CAAGCTTCCA ACCAAACGCT TGTACATCAA ATCAACCACG 1260
CCCCCTCGAA CTTCTCATCT GACCGCCCGT ATATGCACTC GCAAAGGCTC TCTAATAAAA 1320
ATAGAAGCAC ATAAAATGAA ACCACTTAAT AATATATGAT TTTAAAAACT CTGTGATGTA 1380
AGCTGTTATA ATTTAATTAA AGCAATACAT GTTGGACTGC AGAAATAAAT CTTTCATACA 1440
CTCTAGCCTG AGTTAGACTA ATGAGCACAA GATATATTAC TCTTACAACA GGGTTGTTGG 1500
TATTTATTAT CTTCACAGGG AAGAACTAAC ACTTGTAAAA TATGAACAAT AACATATAAA 1560
CAACACACAT TTTAGAAAGG TTTTTACTTT TGATTAGCAA TCAACAGGAC CCAAAATATA 1620
GCCTACACAC CATCGAT 1637