EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR013-39195 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Intestine 
Coordinate
chr3:54488936-54490444 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXC2MA0846.1chr3:54489850-54489862ATTGTTTACATT-6.32
IRF1MA0050.2chr3:54489482-54489503AATGTAAAACTGGAAGTGAAA-6.07
RFX1MA0509.2chr3:54490155-54490171TGTTGCCATGGTTACA-6.94
RFX1MA0509.2chr3:54490155-54490171TGTTGCCATGGTTACA+6.95
RFX2MA0600.2chr3:54490155-54490171TGTTGCCATGGTTACA+6.77
RFX2MA0600.2chr3:54490155-54490171TGTTGCCATGGTTACA-6.83
RFX3MA0798.1chr3:54490155-54490171TGTTGCCATGGTTACA+6.81
RFX3MA0798.1chr3:54490155-54490171TGTTGCCATGGTTACA-6.92
RFX4MA0799.1chr3:54490155-54490171TGTTGCCATGGTTACA+6.97
RFX4MA0799.1chr3:54490155-54490171TGTTGCCATGGTTACA-7
RFX5MA0510.2chr3:54490155-54490171TGTTGCCATGGTTACA-6.14
RFX5MA0510.2chr3:54490155-54490171TGTTGCCATGGTTACA+6.27
Enhancer Sequence
TACACGGATG TAATAATTAT GTTTTTGTTC GAAACTTCTA TTTGGGTTTC ACGATGGCTC 60
AGTGGTTGGC ACTGTTGCCT CACAGCAAGA AGGTCGCTGG TTCAACTCTC GGCTGGGCCA 120
GTTGGCGTTT CTGTATGGAG TTTGCATGTT GGCTTTGGTT TCTTCCAGGT GCTCCCGTTT 180
TCCTCACAGT CCAAAGGCAG TATAGGTGGA CTGCGATGTA GGTGAATTGA ATAAACTAAA 240
TTGGCAATTG TTTATGGGTG TTTGTGTGAA TGTGAGAATG GATGGGTGTT TCCCAGTAGG 300
TTGCAGCTGG AAGGGCATCT GGCTGTGTAA GACATGCTGG ATAAGTTGGC GATTCAATGA 360
CCAAATGTAA ACCATATCGT TTGAGTTTGC CCATATTTTA CCAAATTTGG AATTAAATAA 420
ACCAGCATTT TTAGTGTAAG TTATTCGTTG TGTAGTAGTG TAGTAATTAG TGAACTATCC 480
TCTTCATGAC AAATCATAAG CTTTGCTGAA TTTCTGGTGA TTTCCAGTGT GACGGTGGGT 540
CATGTGAATG TAAAACTGGA AGTGAAATAC CGTGAAATAA GAAGGAGCTA CGGAGTTTTA 600
GTTTAGTCAG TTGCTGCTCC CCTAAGAGTA CGGGACATTC CAGTAATCTT CATTACAGCT 660
CGTCTACACA AGGGAAGGGG CAGTTCCGCT GATTAAACCG CTGCTCACTC TCACTTTTAT 720
TCTCTCAGTG GTCGAAGTGT AACCAGATCT ACAACAGTGA CAGGACAATA CTAAAGCCCA 780
GGACTCGAGC TGAACCTAGT TTGAAAATGC AGAAAGGGTC GTTCTTTCTC GGCAAATCTT 840
CACGGATGTC CCATATAGGA CTACTCGGAA TTTGTTTTCT CTCACTAGTT GCAGGTAACG 900
TTAAGCGCTT TCTAATTGTT TACATTTGCT AGAGAATAAC TGCGCCACTT TGTTTTGCAT 960
GTTACCGGTT TAACCCGAAC AACTGTGGAT GAATTTGGAA TACAGAAATA ACGCTAGTAA 1020
TCCATAATGG CACTTCATTT GATAGCTTTC ACGTCTAACA AAGAGAAAGA GTCTATGTAA 1080
GTACCGGACC GAAAGAGAAA CTTGGCTGAA AGTCCCGTTA GCCGGTGATG GAGAGAATAG 1140
GCGATACATT TACTATCGTG GCTCAGATTT TATATATAGA TTAAGTTTAT TTACCTGTCT 1200
AATTGTGTAT TTTAAGCCAT GTTGCCATGG TTACACCATC AGGCGAACAT GTACACGTCA 1260
AGTGAAAATA CGATTATTGA AGTTTAAAGC TGGTGGTTTT AGACGCAAAG TTGTGTAGGC 1320
TAGGCTGATT TTAACTTTAC AGAAGCTGAA AACAAGGTAT GTAACGTCGT GTTTTCTCTC 1380
CCTCTCTTGT GTTTGGCACC GAACGACTCT GCTCAGTAAA TGTTGAAGTC TAAATATTGT 1440
CTTCAAATTC CAGAAGGGGG CGCGATACCA TTTCATTATA AAAAGTTTCC TTTAGATCCC 1500
TTTCGCTT 1508