EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR013-39079 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Intestine 
Coordinate
chr3:52542440-52543093 
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HOXA10MA0899.1chr3:52542613-52542624AGTAATAAAAA+6.14
IRF1MA0050.2chr3:52542595-52542616AAATTGAAAATAAAAGAAAGT-6.25
LMX1BMA0703.2chr3:52542566-52542577TTAATTAAATT-6.32
LMX1BMA0703.2chr3:52542563-52542574ATTTTAATTAA+6.62
PHOX2AMA0713.1chr3:52542567-52542578TAATTAAATTA-6.62
PROP1MA0715.1chr3:52542567-52542578TAATTAAATTA+6.32
PROP1MA0715.1chr3:52542567-52542578TAATTAAATTA-6.62
Phox2bMA0681.1chr3:52542567-52542578TAATTAAATTA-6.62
Enhancer Sequence
AGGAGTATAA ACATTTTTTA AACAAAATAA AATATAAATA TAAATGAATA AATAAATAAA 60
AAATAAAATT AAATAAAAAT ATCTAAAATA AAATAAAATT TAAAAAATAC AAATTTAATA 120
CAAATTTTAA TTAAATTAAA GTAAAATTAA AAATTAAATT GAAAATAAAA GAAAGTAATA 180
AAAAATAAAA TAAATTAAAT TAAAATAAAG TTAGATGAAA TCTTACTGAG GCCAAAGGTT 240
ATGAAATTGT TAATTTATGT AACTTCACAC TCTAATTTTT CATGTAAATG AACCGACTCA 300
TTGTTTGTAA TACTGCGTTT TAAAAAGCAC AACTACGTCA AATCTAAATT CTGCCTTATT 360
GGCTCTCAAG TCAATAATAC ACAGAATTCT TATCATTTTA ACAGAATCGC ACTATCAAGA 420
GAGATTCAAG CGAAGGTTAT ATTTCTGACA AGTCCTCATC CAATGAAGCA ATGGACCAGC 480
TGAGCCCAGA AGCCAATGAG AGAGCAGGTA GGCGGGGTTT AAATGGTATT GACATTCAGT 540
ATCAGCTGGC TGCTTGCGCA AACATTTGCT CTGTGTTTCT GTGCCTTTGT CATTTCCTTC 600
CTGTTGTCAT AAGCAAAGCT GCCGGATGCT CTTACAAACG TTTTTTTTTG TAA 653