EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR013-38815 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Intestine 
Coordinate
chr3:44274603-44275977 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr3:44275581-44275598TGATTTAATTAATTATT+6.31
HNF1AMA0046.2chr3:44275341-44275356AGTTAATATTTAATC-6.03
LMX1BMA0703.2chr3:44275582-44275593GATTTAATTAA+6.02
Lhx3MA0135.1chr3:44275586-44275599TAATTAATTATTT+6.71
Lhx3MA0135.1chr3:44275583-44275596ATTTAATTAATTA-6
NR4A1MA1112.2chr3:44275415-44275425GTGACCTTTA-6.02
RarbMA0857.1chr3:44275416-44275432TGACCTTTAGAGCTTT-6.06
TEAD1MA0090.2chr3:44275165-44275175CACATTCCAT+6.02
TEAD4MA0809.1chr3:44275165-44275175CACATTCCAT+6.02
Enhancer Sequence
AAAAAATAGA CAAAATAACA TAACACATTA AAAACTAACT ATAAGACACA TTATTTACCT 60
TTTTGGTAAC ATTTTAGTAT TGGTTGGGTT TAATGAAGGA GGATGGGTGG GTCGGTCGAT 120
TAAACAGTCA GTCAGTCAGT TAGTCATTCA GTCAGTTGAC AGAAGGCTCG AATAGGACTC 180
GCGAGAGAAA TTTGAGATCT CAAAAAGCAT ACACAGCGGC CTCAGGTAAA TAAATGTACC 240
TCTTGGGACG TGTTTGGCAC TCTCCAGAAT TGTATATAGC AGCACGTTTT CAGAATGAGC 300
CTGATTTGGT TATATTATAT CTGGTTACAG TATGTCAAGT TGTCATGAAG ACAACTCAAA 360
CAATGTCACC TTTGCTTTTA ATATGACATA ACTGAGTAAA TGACACTTAA TGACAGTTGT 420
TATAAGCATA AATAAAATTT CATTTATGTC ATGTCATGAC TATAAAGGTT TTTCTTGTCA 480
GTCTCATGTA CAACCCCCTT CAAGTAAATT GTTCAAGATT GTAATCTATT ACTTTTAAAA 540
GTACACATTG AACTGCTGAA AACACATTCC ATCTGTTTGT TTCTAACACT AGAATCTTTT 600
ATGCAGATTT ACAAGGTAAA ACACTTGACT GACTTTATTC TTATCATCAC TTGCTCTGTT 660
GTTTGAGAAT AGCATTAACT GCTTCCCCTT AGTCCCTCAC TTAGTTGATA AATGCAGCGT 720
TGATGTGTAA ATGTGGGTAG TTAATATTTA ATCTAATGGA TTTCTGAATG GAATTTTACT 780
ATGAACTGCT TTTGCAGCTT AGTTTCTGTT AAGTGACCTT TAGAGCTTTC AAAGTTGGAA 840
CATCACTACA CAGTAAAAAA ATACTTTGTT TTAAAACAGC AATCTTATAC TTTAAAATAA 900
CAATCCACTT TTTTGTCAAT AAACTCCTTT AAGCTGCTTT AGTGGAAAGC ATGCACATTA 960
GAGGGCATCT TACAGGTGTG ATTTAATTAA TTATTTTTTT TTACGTACAC ATGTAGCTGA 1020
GATTTTCTTT TTTTCATTTA TATGCAAAAT AACAGGGTGA GCATTAAAAA AATAAACAGA 1080
TAATTAAGAA CAAGAAATAA TCATTAGCTG TGTTATGAGT TTATGTAGGA GTGGTTTGTA 1140
GGGCAAAACA GAAAGAAAGA GAGAGCAAAT GATGTGGGCT GTATTTATGG TGAGGTGTTG 1200
AGCAGCTCGG AATTATAGGC TTTGTTTGGA GACATATCCT GGGATTTGAT CATACGCTTG 1260
AAAAGGCAGG AGCAGAAATC CGCTTAGTGC TTGTGTGTGT GCATGTGATG TTTAACATGC 1320
TTTTACAAGA CATTCATCTG GACACATAAA TACCAGCACA CTTGCAGGCT ACAG 1374