EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR013-38720 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Intestine 
Coordinate
chr3:41547494-41548890 
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
GFI1MA0038.2chr3:41548340-41548352TCAATCACTGCA+6.18
NFYAMA0060.3chr3:41548525-41548536GACCAATCAGA+6.14
NFYBMA0502.1chr3:41548520-41548535GCACGGACCAATCAG+6.87
Pou2f3MA0627.1chr3:41547710-41547726AGTCATTTGCATACAT-6.05
RARA(var.2)MA0730.1chr3:41548535-41548552AGGTCAGATTGGGGTCA+6.36
Rarb(var.2)MA0858.1chr3:41548535-41548552AGGTCAGATTGGGGTCA+6.45
ZNF384MA1125.1chr3:41547771-41547783TTTTTTTTTAAC-6.04
ZNF384MA1125.1chr3:41547768-41547780TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr3:41547769-41547781TTTTTTTTTTTA-6.37
ZNF384MA1125.1chr3:41547770-41547782TTTTTTTTTTAA-6.44
Enhancer Sequence
ATTGAAACTG GGTCAGTCCA GTTTTCAGAG TTTAATTCAT TTCAGTTTAG TTCATTTCAG 60
TTAAGTTTAA ATTTCACTTC TGAAAGTCCA AACACTGAGC AAATCCATCA ACGCACGGCT 120
TCACAAGTCC CAAACCAAGC AAGCCAATGT CGACAGTCAC GAGGAACAAA CTTCACCTAC 180
TGATATAGAT CTTTTGCTTT TACACCCATT TCTGCAAGTC ATTTGCATAC ATGCTTTTTT 240
TTTACTTTCT GATAAATGTC TTTATTTGTA TCAGTTTTTT TTTTTTAACA AAAGTTTGAA 300
ATGAAATAAG AATGAGTTAA AACGAAACTA TTCCTTTGAA CCAGCCAAAC AACATTTCTT 360
GGAAAAAACA GGAACATACA GCTGCATTTC AGGTTTCAAC ACAAGCGGTT TCCTACAGAG 420
AGAAAAATGA AAACACGGGC TGATGTGTCT GTTCTCAGTC ACCGTGGATC AGTAATCCAC 480
CAACAAAGCA AAGCAAAGCA CAGCTGCTGG ATCTGGCAGT TCAACACCAC TTAAACATCT 540
CCGCTCACCG CCGAGGAAGA CTTTACTGTC AGATATAACA AAGTGTGAGG TGAAAACAAT 600
CCCTGACAGA CTCGCCCGAG CTCCAGAAAA ACATTTGTTC ACATGAGCTT CTTACGAAAC 660
GGACTAAACG GAGAGACTAA TTAAGTTTTA GGTTTTGTCC TAAACATGTT TTCCTTCAAG 720
GCATTTGCCT CAGTTCCTTA TAGAGTCAAG GGTCGTGTGC ATTTAATTGG ATCTGGTTTG 780
TGTTTATTTG AAGAGGACTG TAGCGCCTGG GAAGTGAAGG GTTAAGGCCT CTGTACATGG 840
CCGTGCTCAA TCACTGCACA AATACCCATG GGCACAGTTT CCTCCGTTGT GCTGAAGTTG 900
TGGCCGTGGC GGAGCTTTTT CCCACACTCT CAACAGGCCA TCATGCGCAC ATTGAGCTCA 960
GATTGAGGGA GGAGGGAGAT TGGAACTTGA TTGGCCAATA AGCTTCAGTG TGTTTGGCTG 1020
TGTGTGGCAC GGACCAATCA GAGGTCAGAT TGGGGTCAGT TGACAATTCT CTGCTCTACT 1080
GCAGCTTCTG ACATCATACT TTATGTTCGG TGTATTTGCT ACACTGTTAA AGGTGAGTAG 1140
TTTCTTTAAG CGAAGAAAAC AATTGCCTTA AAAGCAACAA GTTGACTACT TAAAACAATG 1200
TAAGTGAACC TAATTGTAAC TTGGAACTTT TAAGTTGACT TAATTCTTTA TAAAAATGCT 1260
AATTTTACTT ACTCAACTTA TAGATTTTTA CTTTGTACTA AGCACTTGCA TAAGTAACAT 1320
TTTTGGCCAC AAAGTACACT GTAAAATCTT GATTAATTGA ACATTTGGAC TCAATTAAAA 1380
TTAATGAATG ATTATT 1396