EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR013-38705 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Intestine 
Coordinate
chr3:41428480-41429464 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxa2MA0047.2chr3:41429149-41429161TGTTTACATTGT+6.04
PRDM1MA0508.2chr3:41429205-41429215TCACTTTCAC+6.02
RORA(var.2)MA0072.1chr3:41429116-41429130CTTAATTAGGTCAA+6.37
RORCMA1151.1chr3:41429117-41429129TTAATTAGGTCA+6.14
Enhancer Sequence
TTCAAGCAGG AAGTGGTCTT ACTGATTGAG GTCTAAATGG TTAAACTTCG GCGAGGCTTA 60
AAGAAAGGGT TTAACCAAAA GTGAAAACTG GCAGCTTCTT GTACCCCAAA TATTTCTCTC 120
GTGTTTCTCT GTTAAGCACA GTAAGCTACA GAATGTCCAA TGTCGGAGCT TAAAAAACAG 180
CAGAAACCAT ACAAAAGCAT TATGATGCTG AGCATCTTCT CCACCATGGG TCTCAGACCT 240
CAGCCTTGGT TGTGTATAGC ATTCTAATAT GGTGTGTCTC TGCAAAGATT ATTTGTGTGT 300
GATTATGACA CATCAACTCA ATCAGATTAC ATTTATTTCC AAATTATCCC TTGTTGCCCA 360
TGAGCTTTAT GGACAACATT TGTTAGTGCA TGTTTTTCCA TTTGTGAGCC TTTTAGCACC 420
CGTTCTGTTT CTCCCAGGGC ATTTTGTAGT TTGCTAAATA ATAAAGAAAA GTGAGTAGTG 480
CATGTTTGAA ATTGCATGAG GGTGCTTTAA ATGATTTTCA TTATTGGGTT AAACTGTTCC 540
TTTAAGGAAG TAGCATTCTA TTGTTCTAAT GCAATGCATC CTATCTTGTT TTTAATCTGA 600
CAAAAGGGCT ATATTTAGTA TTCTCATCAA CACAGTCTTA ATTAGGTCAA ATGTAAGCTT 660
TGATCCTGGT GTTTACATTG TAAAAGTTTG TAAAATTTGT AAGTCCCCAC ATCAGCATTG 720
CTGTTTCACT TTCACACAAA ACAGCTTGGT GCAGTTCCTC TGAACTGTTA GCTGAAGGAG 780
CAGGGCTGCA GCTTATTGGC TGATGAGGTT TGTGGCTTTT TCTAAAATCG GTCTTCCGCT 840
GTCTTGGTTT TACTCTGCTC TTTAGCATAG CTAAAATCAC TCAAGCAGGG TCCCACAGGG 900
AAAGACAGCA GCGCAAAGCA GAGCTGAACA ACATGTAGCA GTAGCGCACG ATTTCACAGT 960
TCTTTGATGC TCAGTGAACT TGAA 984