EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR013-38573 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Intestine 
Coordinate
chr3:39524620-39525542 
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Lhx3MA0135.1chr3:39525349-39525362GAATTAATTATTT+6.22
Lhx3MA0135.1chr3:39525330-39525343TAATTAATTAACT+6.64
Lhx3MA0135.1chr3:39525327-39525340GAATAATTAATTA-7.12
PBX2MA1113.1chr3:39525463-39525475CCTGTCAATCAC-7.22
PBX3MA1114.1chr3:39525460-39525477CCACCTGTCAATCACTT-6.14
POU4F1MA0790.1chr3:39525325-39525339ATGAATAATTAATT+7.82
POU4F2MA0683.1chr3:39525325-39525341ATGAATAATTAATTAA+7.91
POU4F3MA0791.1chr3:39525325-39525341ATGAATAATTAATTAA+8
SOX10MA0442.2chr3:39525395-39525406GTCTTTGTTTT-6.14
Spz1MA0111.1chr3:39524749-39524760GCTGTTACCCT-6.62
Enhancer Sequence
GACAAAAACT TTGTTCAAGC GATCGTAAAA GTCAACTTTG TTGAATTAAT TTTGATAAAC 60
TCTACACACC TGGAGCTCTG ACTGCATGGG GCAAATTCTT TACCCTGCAG ACCAGGAAAC 120
GGCTGGTGTG CTGTTACCCT GCAGGAGACA CATCCTCAGT TGTGCCTCCC TGCAGCAGTG 180
AGTGGCTGTG CTGGACAGCT GTGTGTGCTG TCCACATCCA ACCCCTTTCT CTGAGCTCAA 240
TACAGGAAGA CAGAATTCCT CAACTCCCAG AGGCCTTTTA CTCTGCCCTG TGCTTAAAGG 300
AGGAAGCTGC ATATATTTCT CTCTTCACTT ACTACCCCCT GCCTCTTTTA ATACAGCTTA 360
AAAAGAATTT GATAGTATTC GTGAAGAAAG TCAAGCAGTG TCTTTTTATC ATTCATATGG 420
TTAAATTCTA AATATGAATT TGGTTTTGTG TCCTACATGT AAGTCTTTAG TCATCAGTTG 480
CATTGAATTA ATGCAATTGT CTGGAAATGG ATAATGTATG GGGTGCTTTA TAGTTTGAAA 540
TGGTCTGTTA ATGTCATAAA CAAAAAGAGA AAACCAGTAG AAGAAACGCT CGTGTGTTTT 600
GCATTACGGG TGGGCGATGT CGACCAATTT GGCATCGTAC GATGTCTAAT ATGAAACATT 660
GCGATGGACG ATGGCATCGT CGTCATAGGC AATGGTGAAT GAATTATGAA TAATTAATTA 720
ACTTGTGACG AATTAATTAT TTGTAGCTTA CCGTTTTAAC GACCTTACCT GCATGGTCTT 780
TGTTTTACCC ATAAACAAAT CATACAGTAA ATGAATAAAG ATAAGTTACA CACATAATTG 840
CCACCTGTCA ATCACTTTTT CCGCGGGACT CATGAATGGG CAGAGTGATC TGTGTCGTTA 900
CGATGGCGTC GGTAAAAAAA GG 922