EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR013-38518 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Intestine 
Coordinate
chr3:38612250-38613511 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXB1MA0845.1chr3:38612367-38612378ATATTTACATA-6.62
FOXC1MA0032.2chr3:38612367-38612378ATATTTACATA-6.62
Foxj3MA0851.1chr3:38612547-38612564GGAAAATAAACAAACAC+7.18
RARAMA0729.1chr3:38613005-38613023AAGTTCCTAAGGTCATTT+6.2
SOX8MA0868.2chr3:38612288-38612298CCATTGTTCT-6.02
Enhancer Sequence
ATCATCATGA GAGGAAAGCA GATACCATAT GCTGCTCACC ATTGTTCTGA GAATGATTAC 60
AGAACTCTGG AAACTTGCAG CATTTGAAAA TGTTTTATCA TCTTGTTAAA TTAATTTATA 120
TTTACATACA GAAGGCGGTA GATATTTCAG AAGGTAAAAC ATGAACTTTC AGAGAAACTC 180
ATTGCTAACA ACATTAATCT TCGGCGTGCA ACTTCAAATG ATTATTTTCT TGAGCAAACA 240
TGTTTTAATT TGCTCGGCAC AAGTTTCCTT TTCTTGTTAC AGATGGAATG AATAAGGGGA 300
AAATAAACAA ACACAAAAAA CCTTTTATTT ATATTATCAA TCCATAGCTG TAGGAGTTAC 360
TGGCTACTGA CGTAAAACAT GAAGTAAAAT AAGGAAATAG GAACAGAAAT TTAATGCAAT 420
GCACACAAAG AAGTAAATGA AAGTTCCCAG GAAGTTATTA AATATCAATT GTCATGATTG 480
TTTTATGACG CATTATCTGG CACAAAAATC TCTCAATAAA AGACTCTGAC ACACATCTGA 540
GGTGTTGTTT TGATGTCAAC TTCTCAAAGT AGGACAAAAA ATAATCAAAT GTGTAAGTGG 600
CTGCTCAAGA TTACCATGTT CGAATATGTT TCTTGGTTCT AAGATATACT CAGGACGGTT 660
TTATGTGTGC CAATCATTCA TCGAAGAGAC AGGACACTGA GAACTGCAGT AAATCCTTTC 720
ACCTTTAATT AAAGCAGAAG AAGAAGAACA TGGCCAAGTT CCTAAGGTCA TTTTTAAATA 780
TTTCCCAAAT GATGTTTAAC AGAGCAAGGA AATTTTCACA GTATGTCTGA TAATACTTTT 840
TCTCCTAGAA AAAGTCTTAT TTGTTATAAT TTGGCTATAA TATAAACAGT TTTTAGTATT 900
TTTTTTAAAA ACCATGTTAA GGTCAAAATT ATTAGCCCCT TAAAGCTATT TTTCATAGTC 960
TACAGAACAA ACCATCGTTA TACAATAACT TGTCTAATTA CCCTAACCTG CCTAGTTAAC 1020
CTAATTAACC TAGGTAAGCC TTTAAATGTC ACTTTAAGCT GTATAGAAGA AGTTTCTTGA 1080
AAAATATCTA GTCAAATATT ATTTACTGTC ATCATGACAA AATTTTTTTA TAAAAATCAG 1140
AAGATAGAAG TTTAGAAATG TGTTAAAAAA ATCTTCTCTC CGTTAATCAG AAATTGGGGG 1200
AAAAAATAAA GGGGGCTAAT AATTCAGGAG GGCTTCAACT TCAACTGTAT AATCCCTTTG 1260
A 1261