EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR013-37662 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Intestine 
Coordinate
chr3:23040744-23041953 
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxo1MA0480.1chr3:23040847-23040858TGTAAACAGCA-6.14
Gfi1bMA0483.1chr3:23041624-23041635TGCTGAGATTT-6.32
HNF1AMA0046.2chr3:23041098-23041113AATTAATTATTAAAA+6.31
HNF4GMA0484.1chr3:23041318-23041333TGAACTTTGACCTCT-7.99
Hnf4aMA0114.3chr3:23041316-23041332TATGAACTTTGACCTC-7.05
Lhx3MA0135.1chr3:23041097-23041110AAATTAATTATTA+6.25
NR2C2MA0504.1chr3:23041318-23041333TGAACTTTGACCTCT-6.99
Nr2f6MA0677.1chr3:23041318-23041332TGAACTTTGACCTC-6.83
RXRBMA0855.1chr3:23041318-23041332TGAACTTTGACCTC-7.22
RXRGMA0856.1chr3:23041318-23041332TGAACTTTGACCTC-7.42
RxraMA0512.2chr3:23041318-23041332TGAACTTTGACCTC-7.38
SP2MA0516.2chr3:23041837-23041854CTGTGGGTGGGGCTTAT-6.43
ZNF143MA0088.2chr3:23041399-23041415TTCCCATCATGCCTTG+6.56
Enhancer Sequence
TCTAGTATAC CTAGAAAGAG CTTGATTAGC TGGTTCAGGT GTGTTTAATT GGGGTTGGAA 60
ATATAATATG CTGGACACCG TGGAGGTAAA GCGAGTTTGC CCCTGTAAAC AGCACCCCTT 120
CTGTTCAAAA CATGTATCGC GATTAATTCA ACATTTCAAG CAGTTTTAAT CGTCACATAT 180
TTAAATCGAT TTTCAACCGA CTCATGGTGA ATCGTTACAT CCCTAGCTCA CGGCGACCTG 240
AAGTTGATTC CCGGCTTAAG GTCCTTTGCC GACCCTTCCC CTCTCTTCTC CCAATACTTT 300
CCTGTCTGTA ACCTCCATTG TCCAATCCCT ATAGAAAGGT GAGAAAACCC TCAAAATTAA 360
TTATTAAAAT AAATAAATTT ACAAAAAAAC TATGCATAAA ATAAAAATTT CTGCTGCTAA 420
CTGATTGTTT CGGCAATCAG TTTATTGATT ACTGTTAACT GAGTGAAGGT AAAATGAACT 480
GGTGTATAAT GGAATGGTGT CAATGCACAT TTTTATGGAG AAAAAAAGCC ACCCAGGCCA 540
CTGTAGCAGC TGCCCACGTT GACCTTAAAG GGTATGAACT TTGACCTCTT CTTCTAGCAA 600
TTCCCACCCA CTCCTCTCTC CTTATTTTCC TCTTACCAGC CGTCTGATGG CCCTCTTCCC 660
ATCATGCCTT GTGCCTGGCT CTCACATGTG GCTGCTGAGA GGGATGAGGT TTACTCTATT 720
CTTCAGCTCT GGAGGAGAGG AGCGCTGCTT TAAGCGCAAA CAGATGTGTT TTGAAAATAG 780
AGGGAGGACA ACTCTTTATG CAGATGCTTG ATGGCATGGT AGTTATTCAG TATGTATATA 840
TGAGCTTATA TCTGTGTTTT GATGCTCTTT TAAAAGCACA TGCTGAGATT TAGACAGTCC 900
CTGAGCTCCA TATCCCATTA AGGAAAGGGA ATTGTAAACG CTAACTTTGT GTGGTTGAAA 960
CCTGCTATTG TCCGCCGCCT GTGAGCCTGG GCTTCAGCCA AGCGAGACGT GGCTACAGAG 1020
GGAACTGAGC CCAGAATATG CAGCTTCCTG TAAGGCTTCT GCTGCAGAGG GCTGGGTGGG 1080
GCTGTGGGCG GAGCTGTGGG TGGGGCTTAT TTCTAAATAG CCTGACAGAT GCTAAATCTC 1140
AGAGCAAGTA ACGTGACACA TTTAAACCAG TAACCTTTGC TCTGTCCATT TTTCTCTTTC 1200
CCCCTCTGT 1209