EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR013-37327 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Intestine 
Coordinate
chr3:16674601-16676603 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXA1MA0148.4chr3:16676218-16676234AGTTGTTTACTTAAGA-6.54
FOXD2MA0847.2chr3:16676220-16676233TTGTTTACTTAAG-7.34
FOXE1MA1487.1chr3:16676219-16676234GTTGTTTACTTAAGA-6.56
HOXD10MA1506.1chr3:16674973-16674984GTTTTACGACT-6.02
HOXD12MA0873.1chr3:16674973-16674984GTTTTACGACT-6.32
KLF16MA0741.1chr3:16675833-16675844GCCCCGCCCCC+6.02
KLF5MA0599.1chr3:16675833-16675843GCCCCGCCCC+6.02
MTF1MA0863.1chr3:16675313-16675327TATGCACACGGCAC+7.47
SIX2MA1119.1chr3:16674718-16674734AGCTGAAACCTGATTA+6.66
SP1MA0079.4chr3:16675830-16675845AAAGCCCCGCCCCCA+6.51
SP2MA0516.2chr3:16675829-16675846GAAAGCCCCGCCCCCAA+6.27
SP4MA0685.1chr3:16675830-16675847AAAGCCCCGCCCCCAAC+6.44
Enhancer Sequence
GAACCACACT GTGAAAAACT ATTGGTTTTA CATTACTTTT TAGTTCATCG TTTCAATTTA 60
CATTAAACAA ACTGACTAGA AATATGAAGT TAAACTTTGT ATAACTAAAA TAAAATCAGC 120
TGAAACCTGA TTAGCTAATT AAAAGAAGTT AAAGTAGCAT TAAAAACATT TGTTGTCATG 180
ATTTTTTGTC ATACATTTCT TTACAGAACA GCCACCGCTT TAGAATCTCT TAATAGTGTG 240
TTTGTTAGCA TGAATTCTGC AGCAAAGTTG GAAAGAAATA AAAAAGGAAG GGGGAAAAAA 300
ATTATACAAG CTTTCTAAAA AGCCCAGATG TCGGCGGAGG CAGAAACACA CACTCAAAGT 360
CACATTCAGA GTGTTTTACG ACTCAATTTA AATACAGACG ACTGTTATAT TTCTGAAGTG 420
TATTTCTCAT TGGGGAAACC CCTGATGATT TTTTTCATAT GTGGCCCAGT TTTTATGTGG 480
AGCCGTTTAC CTTTGAACCC CGCCGTCTGG TTGAATGCCT CTACAAATGA GGTTTTTAGC 540
TGAAGGAACA TTATACTTGA AGGTTTTCCC TCTTCTGGGC TTCAGACGGG ACCCTGAGGA 600
GCAGGAGCGG AGCATGAGGG CTCTGTTTAG CTCCCTGTCA GAGTCTGCAC AGGAAATCTA 660
GGAAATTCCT GACAGAGATG CGGAAATCCA TCCGCTGTGC GGGGAGTTGT GTTATGCACA 720
CGGCACACAC ACACTTACAC ACACTCCAAC ACAAACACTT CTGTGTGAGG TGGGACGCGA 780
AGGCATAAGG GTATTTTGAA GGATTTTGCT ATTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG 840
TGTGTTGAAC AAAAAACTAA ACAAAAAGTA ATAAGGGAGT AAGAATATTA CCCCAGTAAA 900
TGTATTAAGT ACGTTACTTG TTTTTAATTT TACTTCAGCA CAAAAAGTAG TTGCTTTTTA 960
ATTAGTCAAG AAGTTAAAGT CCATGTGGAA TCAAAATATA CAATGTTTAT TTTGCGAGTC 1020
CACATTGTTA TTCTTTAGGT GAAGAAATAC TCTGCACGTT ATTCCACTGG TTTGTTTTGG 1080
TAATCTTCAA TCAAAGTCTG AGCATTTGCT TCCACGTTTG GAGTGGGTGG TTCATCTCTG 1140
ATGATGTCAG TTTGATTGAT TCAGTCACAG TATTGTTAAC GCCACCCCTC TTACTGTTAG 1200
TTTGCTATAA GGGAATGATG CGCAATAAGA AAGCCCCGCC CCCAACTCAA TATACTGTTT 1260
CAGCTGGACA TACAACAACA TACATGAATC AGTGAGTTGT TCATTAGACA CTCAGTCTGA 1320
ACAGATCAGC TGGATCAGTG AGTTGTTTAC TAGAGACTCA CTCTGAACAG ATCAGTTGAA 1380
TCAGAGATTT GGTAACTGGA GACTGACGTT GAACAACTCC CTTGAATCAG TAAGTTGTTG 1440
ACTAAAGACT CATTCTGAAC AGATCAGTTG AATGAATCGG TGAGTTAACT GAAGACTGGC 1500
TTTGAACAGA TCAGTTGAAC CAGTGAGTTG CCAACTGGAG TCTTGCTGTA AACAGATTTG 1560
TTGAATCAGT TAGTTGTTTA CTAAAGATTC ATTCTGAACA GATCAATTGA ATCAGTGAGT 1620
TGTTTACTTA AGAATCATTC TGAACACATC AAGTTGAATG AATCAGTGAG TTGTTAACTG 1680
AAGACTGGCT TTGAACAGAT CAGTTGAATC ACTGAGTTGT TCACTAAAGA CCCACTCTGA 1740
ACAGATCAGT TGAATCAGAG ATTTGGTAAC TGGAGACTGA CGTTGAACAA CTCCCTTGAA 1800
TCAGTAAGTT GTTGACTAAA GACTCATTCT GAACAGATCA GTTGAATGAA TCAGTGAGTT 1860
GTTAACTGAA GACTGGCTTT GAACAGATTA GCTGAATGAA TCAATGAGTT GTTAACTGAA 1920
GACTGGGTTT GAACAGATCA GTTGAACCAG TGAGTTGTTA ACTGGAGTCT TGCTGTAAAC 1980
AGATTTATTG AAACAGTTAG TT 2002