EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR013-37040 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Intestine 
Coordinate
chr3:12295585-12296822 
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXA1MA0148.4chr3:12295967-12295983GTTTGTTTACTTAAGC-8.42
FOXC2MA0846.1chr3:12295968-12295980TTTGTTTACTTA-7.22
FOXD2MA0847.2chr3:12295969-12295982TTGTTTACTTAAG-7.34
FOXE1MA1487.1chr3:12295968-12295983TTTGTTTACTTAAGC-6.47
FOXP2MA0593.1chr3:12295968-12295979TTTGTTTACTT-6.62
Foxj3MA0851.1chr3:12295965-12295982ATGTTTGTTTACTTAAG-6.16
Rhox11MA0629.1chr3:12296196-12296213AAAATGCTGTAAAGCAA+6.31
SCRT2MA0744.1chr3:12295805-12295818AAGCAACAGGTTT+6.03
SCRT2MA0744.1chr3:12296004-12296017AAGCAACAGGTTT+6.03
SCRT2MA0744.1chr3:12296055-12296068AAGCAACAGGTTT+6.03
ZNF384MA1125.1chr3:12296141-12296153AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr3:12296139-12296151ATAAAAAAAAAA+6.27
ZNF384MA1125.1chr3:12296140-12296152TAAAAAAAAAAA+6.37
Enhancer Sequence
TTTACTCACT TTACTTAAGT CAGCTAATTG CTTTAAAAGC ATCAGATTTA CTCACTTTAT 60
TTAAGTAAGG TCAACTAATC GCTTTAAAAG CAGCAGGTTT ACTCACTTTA AGTAAAGTCC 120
ACTAACTGCT TTAAAATTAA CAGGTTTACT CACTTAAGTA AAGTAAACTA ACTGAGTTAA 180
AAGCAATAGT TAACTCACTT AAGTCAGCTA ATCGCTTTAA AAGCAACAGG TTTACTTACT 240
TTACTTAAGT GAAGTCAACT AATCACTTTA AAAGCCACAG GTTTACTCAT TTTACTTACT 300
TAAAGTCAGC TAATTGCTTT AAAAGCATCA GATTTACTCA CTTTATTTAA GTAAGGTCAA 360
CTAATCGCTT TAAAAGCAAC ATGTTTGTTT ACTTAAGCGA AGTCAACTAA TCGCTTTAAA 420
AGCAACAGGT TTACTCACTT TACTTAAGTA AAGTCAGCTA ATTGCTTTAA AAGCAACAGG 480
TTTACTCACT TTTTTTAAGT AAAGTCATCA AATCACTCTT TATAGGACCA AATTCTAAAA 540
CACTACAATA CTTCATAAAA AAAAAAAAGG AATTGTCAGT TTTTATTTCG TTATGACTAT 600
AAATGCACCA TAAAATGCTG TAAAGCAATG ATCTCCTGTT CTGGCATGAT CCGCTGCTAG 660
AATGCGCGTT TGACAGCAGT GGAGGCTGTG TGTGTGTGTG AGTGTATGTG GCAGATCAAG 720
ATCCTCGTGC CAGCTTTCCT CACTGTGTCA GAATAACATC CCTACGGTAT TTCCCTACTG 780
TTCTGTCCAA ACAACATCAT TCAGAACCAC TGGCCTTCAG CACACACACA TGCAAGACGC 840
GGCCAAGACA AACACACACG TCTAAAAGAC CAGCTCCTTG CGCAGGCTTT CTTAACCAGG 900
ATAGTGGACA CAGTACTTCT GCCTGTCTCT TCATATAAAC ACTGCTCGCA TTCACAGTTT 960
CGATTGCTCC CACTGAAACA AGCCTCTTAC CGTGAGTACT GCAGTTCACT ATGTAACTCA 1020
CAAAACTAAG TGTGTGCTAC CGACACTGAA AGATTAAACA AATCATGCAG ATAGTTGAGA 1080
GAAGTGTGCT GTTCATTTAG CAAGGAGTCG GGTATACTAG CGGCTGTGTC TATGAAAATA 1140
TGACCGAGGC TATGATAGTC ATAGCAACAC CCTACAGGAC CCTAGCAACA GAGTATGTTT 1200
TGCAAACACA AAATAATTAT ATTATAATAT TTTAAAA 1237