EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR013-36488 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Intestine 
Coordinate
chr25:34410359-34411687 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ESR1MA0112.3chr25:34410831-34410848AGGGTCATCTGGACCTT-6.06
GSCMA0648.1chr25:34411141-34411151GGGGATTAGC-6.02
Lhx3MA0135.1chr25:34411420-34411433TAATTAATTATTT+6.71
Lhx3MA0135.1chr25:34411417-34411430GAATAATTAATTA-7.12
POU4F1MA0790.1chr25:34411421-34411435AATTAATTATTTAT-6.63
POU4F1MA0790.1chr25:34411415-34411429TTGAATAATTAATT+6.8
POU4F2MA0683.1chr25:34411419-34411435ATAATTAATTATTTAT-6.29
POU4F2MA0683.1chr25:34410545-34410561ATGAATAATCAATGAG+6.7
POU4F2MA0683.1chr25:34411415-34411431TTGAATAATTAATTAT+7
POU4F3MA0791.1chr25:34410545-34410561ATGAATAATCAATGAG+6.17
POU4F3MA0791.1chr25:34411419-34411435ATAATTAATTATTTAT-6.54
POU4F3MA0791.1chr25:34411415-34411431TTGAATAATTAATTAT+7.02
Enhancer Sequence
TTTTCCTACT ATCTATCTTA TTACAACTAA AAGCTGCATT ATAATAAGAA CAAAAGTCAT 60
ACAGTAATGA TGACACTGAA GTAATTTTAC GCCATTATTT TCGCTTTGTT TCTAAATCAC 120
TGTACAGCTT TAGTGGCTTT AGTGCGGCGA GGAAAGATAA ATAAGTTGAC AATCCCCGCC 180
CCTCTCATGA ATAATCAATG AGATACAAAT CTAACGCTTT TCTCCGGCCG TCCGGTCTAA 240
GCAGCAGCGC GTGTTTTTAA TTAAATAGTT TCTCCGTGCC GTGAGAACCC GAACTCGGAG 300
AGCTGCAGCA ATAAATACCA ATGTTTAAAC TTATTAAACA GATTTATTAT TAAAATTTCG 360
CTCCTCTTCC TTCCTCAGGG GAAATGTGCG TGCGAGTGGG TGTGTCGAGC GAGTTTAAAC 420
TTTAGGATGA GTTAAAGTTT GATGATGGCC GTGTGGACCC GCGCGGAGAA ACAGGGTCAT 480
CTGGACCTTC TGCTGAGCGA CCGCTGGGTC CGGGTGTCAG CGGAGCTCAC GCGGGACAAC 540
CTCACTCTCA CGGCGGAGGG AGAACCGGGC GGGCCCGCGG GTTACCCGGA GCACAATTCG 600
CATCTGAAAA ACGGCGTTTC CAATGGCAAC GAACAGAACC GGGATGTGTT TACGAATCGC 660
GTGCAATACG ACAACAGCCC GGGTCGCGTT AACGGGACCG GGTCGGACTC GGAGTCCAGC 720
GGTTACTGTG ACTCGGAGGG GGTACGCAGA GTTCGGATAG TCAAGCAGGA GTCCGGCGGA 780
CTGGGGATTA GCATTAAAGG GGGACGGGAG AACCGTATGC CTATCCTAAT ATCAAAGATC 840
TTCCCCGGTT TAGCTGCGGA TCAGAGTCGA GCTCTGCGTG TGGGCGACGC GATACTGTCC 900
GTCAACGGCA GCGACCTCCG CGACGCTACG CACGACGCGG CGGTGCAGGC GCTGAAGAAG 960
GCTGGGAAGG AGGTCACGCT GGAGGGTAAG TCAATCACTC GAGCCGCGGG GATTCAGTAG 1020
GCCTTTGTAG TTTACCGTTA ATCAAAACAA AGTTTTTTGA ATAATTAATT ATTTATGTGT 1080
TCATAATTTA CACGCCTAAA TAGAAACTTT GAGGTGTTTC AGGTTTTATT GTGTTGAGTT 1140
TTAACTGTTC ATGTTGTAAA CATTGGCTCA TTTGACATAT TAGATAATTC AGGTTTATAA 1200
GAGGTTTGGA AACCCCTTAC TGAAGTTATG AAACTTACAG ATGTGTGATG TGCATGACTG 1260
AAGGTTTTTT GTGGTAATAA GCAGATAACT TTTTTTTCTC TAATAGCAAT TTTCTCCAAA 1320
CACCAGGT 1328