EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR013-35100 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Intestine 
Coordinate
chr25:842821-844486 
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr25:844454-844471CGCATTAATTAAATATT+6.57
Alx1MA0854.1chr25:844018-844035TGAATTAATTAATTATT+7.27
Alx4MA0853.1chr25:844454-844471CGCATTAATTAAATATT+7.07
Lhx3MA0135.1chr25:844019-844032GAATTAATTAATT+6.29
Lhx3MA0135.1chr25:844023-844036TAATTAATTATTT+6.71
Lhx3MA0135.1chr25:844020-844033AATTAATTAATTA-6.78
POU4F1MA0790.1chr25:844036-844050ATAAATAATTAATC+6.05
POU4F1MA0790.1chr25:844024-844038AATTAATTATTTAT-6.63
POU4F2MA0683.1chr25:844022-844038TTAATTAATTATTTAT-6.65
POU4F3MA0791.1chr25:844022-844038TTAATTAATTATTTAT-6.78
POU6F1MA0628.1chr25:844021-844031ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr25:844021-844031ATTAATTAAT-6.02
SOX13MA1120.1chr25:842852-842863AAACAATGGCT+6.14
Enhancer Sequence
TTAGCAGGCA ATTAGCATAG AGTCTGTTAC CAAACAATGG CTTAACGCGG GGGTGATAAT 60
CTGAATGTGC CTTTCCTTAA GAAGGAGTAT GACTGAAAGC AGGCTCGTGA TCTCAGGCTC 120
CCAGAATGAA TTGTAAAGAG ATGACTACCC ACAAGCCCCC AGCCAGCGGC TTGCCGAGCT 180
CTTCCACAGC TGTGGGTTTA GTTAAAAATA GCTGCGGTTT GAGCAGGGCA TTAAGTGCGA 240
GATCCTCCTC CTAAAAGGCA CCGATTGTTC TCCGAGAAAT AATCTGATGT CTACACCGAA 300
CACACAAAGA GGACGGAAGT CAACATGCAG GACGAGCTCC AAGATATTTA CAGAACATGT 360
GAGGTGAAGC TGGTTACGGC TTGCATAAAT GCCAATTGAA GATTGGCTCT GTGCATGAAT 420
GGACTTTCAC ACGAAGCAGA GAGCAACAAA ATAAACACAT GAAGCTGATC TATCTGATCT 480
CTCTTTTTTG TTTGCCGGAA AAAGAAACCC GGGGGTGCCA GCACAGCCCT CTTGCCTGGG 540
TTTGCATGCA CTGCAGTGGG CTGAGCGTGT GACGGCCTGT GGTGAGGCTG GATCGGGCCT 600
GCAGCGGCTG GATTGCAGCG AGGTAAACAG ATGAATAAAA CATTGTGGTT TTGTGCAGGC 660
CTGACCTCGG TTAACACCAC GCTGTTTACA CACACACACA CACACAAGAG CAGTGTGTGT 720
AACGGAGAGG GGAGTGGCTC ACACAAAGCC GTTGAGCATG AAACAGATAT GCTCATGTTC 780
TCCTTTCAGC ACAATCAATG GACTGACTCA CAGAGTTCTT CTGTCTTGAC CCATTTACAG 840
ACCGCCGTCT GCTCTGATGC AAGCGTGCAA AGTGGAGCCC ACGAGGACAG ACATCACACA 900
GGGTTATCAA GGGCGTGCGG CGGTGTAGAT CTCGATTCAC ACTAAAGTAG AGCGGCACGA 960
TTCTGGCTAA AATGAGAATT AGGATTATGA TATGAAACCA AGTTTGTGGA CGCCATTATA 1020
CCGACACAGA TCACTCTGCC TATTCATGCC AGAGTCCTAC TGTAAAAGTG ATCGACAGGT 1080
GCTCATTTGT GTGTGTGTGT AACTTATCTT TATTTATTTA TGATTAGTTT ATGGGTAAAA 1140
CGAAGACCAT GCAGGTCAGC TAGTTGAAAT GGTGGGCTAC AAGTCATTTA TTAGTCATGA 1200
ATTAATTAAT TATTTATAAA TAATTAATCC ACCTCCGCCT TTGACGACGA TGCCATCGTC 1260
CATCGCGATG TTTTTACATT AGACATCGTT ACGATGCCAA ACTGGTCGAC ATCACCCAAC 1320
CGTATTTTTC ACAAGACTCA ACAATTTGTA AACACTCACT TCATCGGGCT TGCAACTCTC 1380
AGCACCGCCC ATGCTCATCA CAGCTAGCAA GCCGACCAAT CACAGAGCTC GCGTTATTCG 1440
TACTTGCGAC GTGTAGTTAC AATTTTCAGG TGTGCATTAA CTTTGGCGTC AGCATCAGCA 1500
AAGGCTATGC AAGCGAGAAG GCTGCACCAT AGTATAAATC AGACGTACAA GTCACAGAGA 1560
AAAAAAAAGT AATTTAATAT AAGATATATA GCACTATATG AAGATAAAAG TTCAACAACT 1620
AACATAAATC GCTCGCATTA ATTAAATATT AGCAACCGTG TTTAC 1665