EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR013-34979 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Intestine 
Coordinate
chr24:41406639-41407913 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr24:41407496-41407515AAGCGCCCCCTGCTGGCCT-7.12
CTCFLMA1102.1chr24:41407497-41407511AGCGCCCCCTGCTG-6.84
FOXC2MA0846.1chr24:41407683-41407695TAAGTAAATAAA+6.07
HOXD13MA0909.2chr24:41406811-41406822CGCAATAAAAC+6.32
HOXD9MA0913.2chr24:41406812-41406822GCAATAAAAC+6.02
IKZF1MA1508.1chr24:41407036-41407048AAAACAGGAAAT+6.11
Enhancer Sequence
TATTCCTTGT CTTTGTCTTG CAAAACAACC TTCAATTGCC CTCTTTTGTT TGCACTTTGA 60
TGCAACTATT GAAGGCAAAG CCCAGAAAGC ACACACACAG ACACACGTAC ACACACACAC 120
ACCTGCACTC ACCAGATGAT GATCTGGGAA TCCTGCACTT TTATGGCGAT CCCGCAATAA 180
AACAGCGGTG TGTTGAGGAT GTGGCTGTGC TGTTGCTCAT TCCTGGCATG TTCAGATGTG 240
CGCACGCTTC ACTCTGAGGA CCAGAACAGC TTCAGGATGG ACGTGGAGCT CCTGAGAGAA 300
CAGTACAGCT CCAGCAGAGA CACACACCGA CGACACACAC ACGTCGTCTG CTTCAGGAAC 360
GGTATGCCTT TATCATTACA CTAGTGTAGA AAAACAGAAA ACAGGAAATG CTCTCTCAGA 420
GTTCTGGAAC GGTTGTGTAC AAACACTGCT TTGGTTACAT TAATATAATG TTTGTTCACA 480
GTTGAGCTGT TTAATGTTTG TTGTTATTTA GAGTGTGCAG AGATCATTCA AATCAACAGT 540
CGTGATGTGT TTCGTGTATT GATAATAATG GAATGAACAG CAGCTTCACC ACACACCAGC 600
TATAGGTGGA GTGGAGAGAC AGTGATGGAG CCAACTCAGT GGATGGGGAG GGCATGATGA 660
GTAAGGGCTG ATGGAGGGAG TTTGGCCAGG ATATCAGGGT TACACCCCTA CTCTATACCA 720
GAATAGCCAT GAGATTAATA ATAACCACAG AGAGTCAGGA GCTCGGTTTA ACCTATCAGC 780
TGAAAGACGG CGCTCACTGA CAGTATAGAG TCCCCTTCAC TATACTGGGG CATTAGGACT 840
CACACGGACC ACAGGTTAAG CGCCCCCTGC TGGCCTCACT AACAACTAGC GACAGAGTAC 900
ATGTTTTAAT AACTGATTAT GGTTTATATT ATGTTGTGTG AGTCTGTGTT TTGATATGTA 960
TTTTCTATAA CTCTGTCCTA TGCTGCCTGT CTTGACCAGG ACTCCCTGAT TCTGTCTCTC 1020
AATGGGACTT AATTCTTGGT TAAATAAGTA AATAAATAAA TCAATGGAGG TGAATGAGAG 1080
TGTAAGTCTG AAGCCAAAAA TATTCCAAGA GTAAGCTCAA TAAGGCTGAC CTGCGTCTTA 1140
CTTCTGTCTC CAGCAGACTG CGGTGACGCG GAGATAAACG GCAGAGGTTT TCTGGATGTG 1200
GTTCCTTCTG TCCTGCGGAG CCAGGCTGTG TGTGTTCTGG ATGTTCCTCA CGAATCGTGT 1260
TCTTCAGATC TGGA 1274