EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR013-33602 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Intestine 
Coordinate
chr24:5950530-5951439 
TF binding sites/motifs
Number: 14             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXA1MA0148.4chr24:5951184-5951200TTTTGTTTATTTAATG-6.35
FOXC2MA0846.1chr24:5951185-5951197TTTGTTTATTTA-6.18
FOXD2MA0847.2chr24:5951186-5951199TTGTTTATTTAAT-6.06
FOXE1MA1487.1chr24:5951185-5951200TTTGTTTATTTAATG-7.56
GBX1MA0889.1chr24:5950864-5950874GCTAATTAGT-6.02
HNF4GMA0484.1chr24:5950826-5950841TGGACTTTGAACCTC-6.73
HOXB3MA0903.1chr24:5950864-5950874GCTAATTAGT-6.02
Hnf4aMA0114.3chr24:5950824-5950840TGTGGACTTTGAACCT-7.16
IRF1MA0050.2chr24:5951037-5951058ATTTAGTTTTGTTTTTATTTT+6.12
IRF1MA0050.2chr24:5951164-5951185ATTTTGTTTCATTTTTATTGT+6.16
LHX6MA0658.1chr24:5950864-5950874GCTAATTAGT-6.02
POU4F2MA0683.1chr24:5951117-5951133TTCATTTATTATTCGT-6.04
ZNF24MA1124.1chr24:5951111-5951124CATTCATTCATTT+7.34
ZNF24MA1124.1chr24:5951107-5951120TATTCATTCATTC+7.52
Enhancer Sequence
TAATCTAGTC AGCGGCCGCA GGAATGCAGA GGAGTTTTCA GATCATTTTA TTTTTACTAG 60
TTTGTTTAAC TTCCCTTTTC TGTTCAGGAA AAACATTGGG ATTCTTCGAG TTGGTGAATA 120
TTAAGTGCAC AGGATTTTGG TACTGTCAGA GTTTGATAAA TTAAGCCGTA TTTCTGTCAG 180
GAGGATTTTG CATTTCTGCT GATTTCACAG AGATCTAAAT GAACACCGCA TTTGTGCTTG 240
TTTGATGAGG TAAATCTGGA GCTGGTATAA AAGATTCAGT ACATGCTAAA TTCCTGTGGA 300
CTTTGAACCT CCACAAAAAA CTGATTGAAA ACCTGCTAAT TAGTCCATTA TTTAACTAAT 360
TATAGAAAAT CTCTATTTAT TTTTATTTTA TTTTATTGTT TGATTTTATT TTATTTGATT 420
TAGTTTTATT TTATTTAGAT TTGTTTTATT TTATTTATTT CATTTTAATT TTTTATTTAA 480
TTTTATTGTT TTATTTTATT TTATTTTATT TAGTTTTGTT TTTATTTTAT TTATTTCATT 540
TCATTGTTTT ATTTTTATTT GAATCAATCT ATTTATTTAT TCATTCATTC ATTTATTATT 600
CGTTTAATGT ACTATTTCTG GGTTTTTACA TTTTATTTTG TTTCATTTTT ATTGTTTTGT 660
TTATTTAATG TTTGATTATT CGATCAAGTG TTTATTTATT TATTTACATT TTGTTTGTTT 720
ATTTCTTTAT ACATAATTAT TTTTTATTAT GATTTGATTT TATGTACTTT TTTATTTTAA 780
TTATTTTTCT TAATATTTAT AAGACTTATT TTATAGTTAC TTATGTTTTT ATTGTTTTGA 840
GTATTTTTAA ATGTTTTTAA ATTTATTTTT CATCTTTGTA ATCTAAGTTT TATTTATAAT 900
CTTTATTTA 909