EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR013-32221 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Intestine 
Coordinate
chr23:25653187-25654180 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr23:25653443-25653464AGAATAAAAATGAAACAGAAC-6.19
LMX1BMA0703.2chr23:25653657-25653668TTAATTAAATT-6.32
LMX1BMA0703.2chr23:25653680-25653691TTAATTAAATT-6.32
Lhx3MA0135.1chr23:25653654-25653667TAATTAATTAAAT+6
PHOX2AMA0713.1chr23:25653658-25653669TAATTAAATTA-6.62
PHOX2AMA0713.1chr23:25653681-25653692TAATTAAATTA-6.62
PROP1MA0715.1chr23:25653658-25653669TAATTAAATTA+6.32
PROP1MA0715.1chr23:25653681-25653692TAATTAAATTA+6.32
PROP1MA0715.1chr23:25653658-25653669TAATTAAATTA-6.62
PROP1MA0715.1chr23:25653681-25653692TAATTAAATTA-6.62
Phox2bMA0681.1chr23:25653658-25653669TAATTAAATTA-6.62
Phox2bMA0681.1chr23:25653681-25653692TAATTAAATTA-6.62
Enhancer Sequence
CTACTAACAT TTATAAAAAC GCCTGCTGAA AACTTAATGT CCAAAATAAA AAGGGAATTA 60
ACCAGATTCG AACTTATCTA ATTTATTTTT CATAATATTT TTTAAGGATT ATAATAATAA 120
AAAAATTAAT AAAACAAAAA ATAAAATAGA ACAGAATACA ATAAAAATAA AATAGAATAT 180
AAAATAAAAC CAAATAGAAT AAAACATAAA ATAGAACAGA ATGAAATAAA ACAATCATAA 240
TAAAAAGGAA CAGAATAGAA TAAAAATGAA ACAGAACAGA ATACAATAAA AAATAAAATA 300
AAATAAAAAA TAAAATAGAA CAAAATAGAA TAAAAAATAA AATTAAATAC AGAACAGATT 360
AGACTAAAAA GAATAGAATA AAATATAAAT AAAATAGATT AAAATAAAAA ATAATTATAT 420
ATATATATAT ATATATATAT ATATATATAT ATATATATAT ATATATATAA TTAATTAAAT 480
TAAATAATGA AACTTAATTA AATTAACAAC AACAACAACA ATATTTATTT TTATTATTAT 540
TATTATTATT ATTTATTATT ATTATTATTA TAAAATTCCC ACATTCAACA ATGACATAGT 600
GTTCATTGTT AAAAAATATA TTCCTTTAAA TCCTGCATAA GCACCCATCT GGCTGCTAGT 660
GGAAAAGTGA ATCCGTGTTG GACATTCTTG TGTGCTCTGC TTAACAGCTG AAGCCTGAGC 720
TGAATGAGTC CAGGCTGCTG ACCCCATCTC ATCTCCAAAT CACACCACTG TCCGGAAATT 780
TCACAACCAT ACCAGGAGTG GATGTGTAGG CGAGATCTCT GAGTCACAGA CATCCAGCTG 840
GGGACCTGCA CCTCAACCAC TGTCCTGCAG AGATTCAAAG TCACAAACGC TGAGGGGGAT 900
TCAGACTGCT GATTTCCTCT CGACTGACTC GATCACTCTG AAATAAGAGG GTCCAGACTT 960
CCTGTAAAAC TTCTCTCAGA CAATAAGCTC TAT 993