EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR013-32143 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Intestine 
Coordinate
chr23:24440985-24441967 
TF binding sites/motifs
Number: 20             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ArxMA0874.1chr23:24441344-24441361TAAATTAATTAATTAAT-6.19
LMX1BMA0703.2chr23:24441505-24441516AATTTAATTAA+6.32
LMX1BMA0703.2chr23:24441360-24441371TTAATTAAATT-6.32
Lhx3MA0135.1chr23:24441349-24441362TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr23:24441353-24441366TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr23:24441346-24441359AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr23:24441350-24441363AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr23:24441354-24441367AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr23:24441345-24441358AAATTAATTAATT+6.92
Lhx3MA0135.1chr23:24441357-24441370TAATTAATTAAAT+6
PHOX2AMA0713.1chr23:24441361-24441372TAATTAAATTA-6.62
POU6F1MA0628.1chr23:24441347-24441357ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr23:24441351-24441361ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr23:24441355-24441365ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr23:24441347-24441357ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr23:24441351-24441361ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr23:24441355-24441365ATTAATTAAT-6.02
PROP1MA0715.1chr23:24441361-24441372TAATTAAATTA+6.32
PROP1MA0715.1chr23:24441361-24441372TAATTAAATTA-6.62
Phox2bMA0681.1chr23:24441361-24441372TAATTAAATTA-6.62
Enhancer Sequence
ATAAAAAGAA TCAAATAAAA GCCTCAAAAC CAAAAATAAA GATGAAATAA AATAGTTTAA 60
TATGTGTTCA ATACAGAAAA TAGCCCTTTG TATTTTTAGG TCTGAAATCT GTAGAACTAA 120
ATGTTCATTT CATAGGGTCA TTGAAAACTA ATGCAAAGTG CTAAAAAAAA TTATATATAG 180
AAAAAATAAA TAAACTAAAA TAGAAAAATT AAAATAAATA AAATAAATAA ACCAAAATAA 240
ATAAACTAAA ATAAAATAAT TAAAATAAAT AAATAAAATA ATAAAGAATG AATAAAATAA 300
ATAAAACTAA AATATATAAA TAAATAAAAT AAATAAATAA ATAAATAAAC TAAAATAAAT 360
AAATTAATTA ATTAATTAAT TAAATTAAAT TAAATTGAAA AATAAATACA TTTAGTTAAA 420
TAAGGTTAAA TAAATAAATA AAATAAAATA AAACAAAATA AAATAAAAAA AGTATTAATT 480
AAAGTTAATT AAATACAATA AATAAATAAT AAAATAAATA AATTTAATTA AATAAATGCA 540
ATTGAATAAA TCAAATAAAA TAAAATATGT CCACTTAAAT CAAAACCTTT TCACTTGCAT 600
TTACCTGGTG GGAGTGTTGA AAACTCCTGC TCAATGCTGT AGCTGCCCGG GCTTCCCTCT 660
GAGCTGAGAG CCTGAACTTT AAACAAGTAG ACGGTGGATG GAGAAAGATC TTTGATCTGA 720
GCCGAGTTCT TCTCAAGCAC CAGCACAGTG AAGGTAGTGA CCGTTCCACT GGCCTTTTCC 780
TCATCATTTT CCTGCAGACA CACCGAGGAA AACAGAGAAT AACAATGCCT CTGTTCTAGA 840
TGATGGAAAG TGAAATATCA GGGCTGAAAT GGATAGTGTT ACTGACCTTC TTGCGAAACA 900
TCAGCTCATA ACGCGTGGCC ACTGGTTTGG CGCGATGAGA AACAGACCAC TGAAGAGAAA 960
GGCTGGTCGG GCTGCTTTCC AC 982