EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR013-31224 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Intestine 
Coordinate
chr23:5578482-5579820 
TF binding sites/motifs
Number: 41             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ATF2MA1465.1chr23:5579732-5579746ACATGACATCATAT+6.04
Alx4MA0853.1chr23:5579677-5579694CACATTAATTAATTAAT+6.3
FOXC2MA0846.1chr23:5579625-5579637TAAATAAACAAA+6.18
FOXP2MA0593.1chr23:5579638-5579649AAGTAAACAAA+6.62
Foxd3MA0041.1chr23:5579137-5579149AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr23:5579141-5579153AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr23:5579145-5579157AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr23:5579149-5579161AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr23:5579153-5579165AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr23:5579157-5579169AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr23:5579161-5579173AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr23:5579165-5579177AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr23:5579169-5579181AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr23:5579173-5579185AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr23:5579177-5579189AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr23:5579201-5579213AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr23:5579205-5579217AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr23:5579209-5579221AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr23:5579213-5579225AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr23:5579253-5579265AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr23:5579257-5579269AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr23:5579642-5579654AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr23:5579662-5579674AAACAAACAAAC-6.32
Foxj3MA0851.1chr23:5579623-5579640AATAAATAAACAAACAA+6.03
Foxj3MA0851.1chr23:5579635-5579652AACAAGTAAACAAACAA+6.92
GATA5MA0766.2chr23:5578728-5578738TCCTTATCTG-6.02
Gata1MA0035.3chr23:5578728-5578739TCCTTATCTGT+6.14
JUNMA0488.1chr23:5579734-5579747ATGACATCATATT-6.41
Lhx3MA0135.1chr23:5579690-5579703TAATTAATTAGTT+6.22
Lhx3MA0135.1chr23:5579679-5579692CATTAATTAATTA-6.46
Lhx3MA0135.1chr23:5579682-5579695TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr23:5579686-5579699TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr23:5579683-5579696AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr23:5579687-5579700AATTAATTAATTA-6.78
POU6F1MA0628.1chr23:5579680-5579690ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr23:5579684-5579694ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr23:5579688-5579698ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr23:5579680-5579690ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr23:5579684-5579694ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr23:5579688-5579698ATTAATTAAT-6.02
mix-aMA0621.1chr23:5579691-5579702AATTAATTAGT+6.62
Enhancer Sequence
TTGGGAGACA TTTTGAAGGT ATTTGTCAAA GCCTCAATGT TTTGCTTCAG GCATTTTTGA 60
CGATCGTGCT CTAAAATAGG CAACACACTT CTCCATGTAG GGCAGTGTTA GCAGGATCTT 120
GTCAAGTTGC CTGGTGAAAT AAAACACACT TAAAACCCAG AACAGCATTC AAATTCATCT 180
ATTCTCTCAA CCGGCCATTA AACCATCAGA GGGTTGAGCA TTACTTGCCC ATGCCTTAAA 240
ATGCCCTCCT TATCTGTAAC CCGATCCCAG GCAGCAGCTG CCGTCTACTT GTTGCCCTGT 300
TGTTCTTTGT GAAAGGGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTCTGT GTGTGTGTGC AAGAGGAGAG 360
TTGTTGATGA GCAAAAGCCT TTTCCCTGTT GACAAGCATT GCAGCTGTTT TTCCAAGTCT 420
CCGAGGAGAA GCGTCTCCTG TCTGAAGACC AGTCCAAAAA ACTCAGACTC AAATCTGCGA 480
ATCGCTCCTT AATGCTTATT TATACACTAA GATGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG 540
TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGGTTT TAAAGATTGT 600
TCTGTTACAG AAAGTTTGGT TGGTCTGATT TCTCATAAAA TATCTGGCTC ATTTAAAACA 660
AACAAACAAA CAAACAAACA AACAAACAAA CAAACAAACA AACAAACAAG CAAGCAAGCA 720
AACAAACAAA CAAACAAACA AACAAAAACA ACAATACATA AATAAATAAG CAAACAAACA 780
AACAAACAAA TAAGCAAGCA AGCAAATAAA TAAATAAATA AATAAATAAA TAAATAAGGG 840
CGTCACATGC ACATTGCGTA GCATGATGGC CTCATAGCAA GAAGGTCGTT GGTTGGGGTC 900
CGCATGGATT TCCTCTGGGT GCTTCAGTTT CACCCACAGT CCAAAAACAT GCGCTATAGG 960
TGAATTAAAT AAGTTAAATT GGCCGTAGTA TATGTTTATG AATGCAAGAA TGTATGGGTG 1020
TTTCCCAGTG TTGTTTGGGG CTGGAAGGGC ATCCGCTGAG TAAAAGATGT GCTGAATAAG 1080
TTGGCGATTC ATTCTGCTGT GGCGATCCCT AATTAATAAA AGGACTAACT AATATTAAAT 1140
AAATAAATAA ACAAACAAGT AAACAAACAA ACAAGCAAGC AAACAAACAA ACAGACACAT 1200
TAATTAATTA ATTAATTAGT TAATAACATC CCTGCAGGCA CAGGACATCA ACATGACATC 1260
ATATTGACGT TGTACCCCAA CATATCCCAA CGTCATGGGG ACATTAGATT TTGTTTGGAA 1320
ATGAAAATCG GGTTGATG 1338