EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR013-31201 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Intestine 
Coordinate
chr23:5232933-5233776 
TF binding sites/motifs
Number: 16             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Arid3bMA0601.1chr23:5232966-5232977ATATTAATTAT+6.02
Foxj3MA0851.1chr23:5233494-5233511AAAAAATAAACAAAAAA+6.57
HLTFMA0109.1chr23:5233247-5233257AACCTTATAT+6.02
LMX1BMA0703.2chr23:5233390-5233401TTAATTAAAAT-6.62
Lhx3MA0135.1chr23:5233379-5233392TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr23:5233383-5233396TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr23:5233380-5233393AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr23:5233384-5233397AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr23:5233376-5233389GGATAATTAATTA-6.87
POU3F1MA0786.1chr23:5233237-5233249TAATTAACATAA-6.04
POU3F2MA0787.1chr23:5233237-5233249TAATTAACATAA-6.07
POU4F2MA0683.1chr23:5233374-5233390ATGGATAATTAATTAA+6.1
POU6F1MA0628.1chr23:5233381-5233391ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr23:5233385-5233395ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr23:5233381-5233391ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr23:5233385-5233395ATTAATTAAT-6.02
Enhancer Sequence
TCAGAGTGGC GTGATCCTTC AAAAATCACT CTAATATTAA TTATTATTAT TGGTATTTTT 60
TTAATATTGT TATTATTAAT GGCAATAGTA ATTAAACTAT AAAGTATATA ATGAAGCTAT 120
AATATTAAAG CAATAATTAC TGGATTAATA ATTTAATTTT AAACTATATA CAATAAGTAA 180
TAAACATTTT TTTAATAATT AAGTATTTAA TAGTTTTTTT ATTTAAATGC CGTCCTGATT 240
AACAGATTTT TTTAATGTCA ACAGACCAAA CCACTGTTGT ACAATGTTTT GCCTAATTAC 300
CTTATAATTA ACATAACCTT ATATATATAT ATATATATAT ATGTGTGTGT GTGTGTGTGT 360
GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT ATATTGCTAT GAGCAATCTG AAGGACATAT GATTCAACAA 420
AATTTATGTA TAAATGAATA AATGGATAAT TAATTAATTA ATTAAAATCC ATTGTGAAAA 480
CTAAAATAAG TCAAAATATT AGCGAAATCT ATAATAGCAT AATGACACTT AAACAAAAGC 540
TGCTGTCTTT GCTAAATGAC AAAAAAATAA ACAAAAAAAT GGGTAGATGG ATGGATGGAT 600
GGATGAATGG ATGGATGGAT GACACAGACA GACAGACAGA CAGACAGACA GACAGAAAGA 660
CAGACAGACA AGCAGACAGA TAAATAAGTA AATAAGCAGA GCATTTGGCT GTGATGCCGG 720
AAGACTGACT CTCTGATTTA TACTTCAGAT TAGTGTCTGT AAAGAACAGC AAGATTTTGA 780
CTTCTGGACT CTTGGACTTT GCCTGGTCTA CTGGTCACTG AAAGCAAACT GATACACAGA 840
GAT 843