EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR013-31199 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Intestine 
Coordinate
chr23:5148958-5149738 
TF binding sites/motifs
Number: 28             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr23:5148958-5148975TGAATTAATTAATTAAT-7.27
ArxMA0874.1chr23:5148974-5148991TTAATTAATTAATGAAA+6.05
ArxMA0874.1chr23:5148973-5148990ATTAATTAATTAATGAA-6.09
ArxMA0874.1chr23:5148958-5148975TGAATTAATTAATTAAT+6.7
Lhx3MA0135.1chr23:5148959-5148972GAATTAATTAATT-6.29
Lhx3MA0135.1chr23:5148975-5148988TAATTAATTAATG-6.46
Lhx3MA0135.1chr23:5148960-5148973AATTAATTAATTA+6.78
Lhx3MA0135.1chr23:5148964-5148977AATTAATTAATTA+6.78
Lhx3MA0135.1chr23:5148968-5148981AATTAATTAATTA+6.78
Lhx3MA0135.1chr23:5148972-5148985AATTAATTAATTA+6.78
Lhx3MA0135.1chr23:5148963-5148976TAATTAATTAATT-6.78
Lhx3MA0135.1chr23:5148967-5148980TAATTAATTAATT-6.78
Lhx3MA0135.1chr23:5148971-5148984TAATTAATTAATT-6.78
POU6F1MA0628.1chr23:5148961-5148971ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr23:5148965-5148975ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr23:5148969-5148979ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr23:5148973-5148983ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr23:5148977-5148987ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr23:5148961-5148971ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr23:5148965-5148975ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr23:5148969-5148979ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr23:5148973-5148983ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr23:5148977-5148987ATTAATTAAT-6.02
TEAD2MA1121.1chr23:5149716-5149729ACACATTCCAGCA-6.16
TWIST1MA1123.1chr23:5149341-5149354CTTCCAGATGTTT-6.22
ZBTB18MA0698.1chr23:5149341-5149354CTTCCAGATGTTT-6.46
ZNF24MA1124.1chr23:5148987-5149000GAAAGAATGAATG+6.15
ZNF24MA1124.1chr23:5148991-5149004GAATGAATGAATG+7.82
Enhancer Sequence
TGAATTAATT AATTAATTAA TTAATTAATG AAAGAATGAA TGAATGTGCG GAAATGTTTC 60
ACAAAGCCAG GCCAGAATCA GTTTATGGTA ACAAAGTGAT GTTAATTGGA GACAAAGCAG 120
CAAAAGATTG TCATCACTGA CCAGTTAGTT ATTGATTTAA GCAGGGATTA TTACTAAATA 180
ATTGTAAGTA ACAATATTAA CAACAGATTA GACAATAAAA TGTAAATGTG TTCTAAATTA 240
CACTTAGCCA AAAATGAGAA ACCATTGCAA TACCAACATT CTCACCCAGG CCAAATGTAA 300
TTTAGTGTAG AAAACCAACA CTCTTATCTT GTATGTGATT TGATCTTGAT GTTTTATTGA 360
CTGTACCGGC CAGATAAGGG CATCTTCCAG ATGTTTCTAA TCTCTGTTTG ATTTCAGGGA 420
ATTGTCTCAC AATGTCATCG AAGAGCTGCC AAGTTTTTAC CACTGCACTT CTCTTCAAGA 480
GATGTGAGTT CAGGCGTCTC TCTTTAGTGT AACACAGTAA CACGGCCCAT ATACTGTATC 540
TAAGATAACT GAATGGGCCC TAAATAACCC ACACTGAACT TGACAAATGA CAGTCATTAC 600
TGCATTAATC AATCAGTGTC CATATTTTGG AAGCTTTTAC ATGGTTTCTT GGTCAATGTC 660
TGCCATAGTA TGTGAATGTG TGTGATGCTG TAACACCAGC TTTTTGTTTT GACTCGACAG 720
AGGCCTGCAG CACAATCTGA TCAAACAGAT TGAGATGAAC ACATTCCAGC AGCTCGGCTC 780