EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR013-27587 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Intestine 
Coordinate
chr21:5538878-5540433 
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
DMRT3MA0610.1chr21:5539598-5539609TTTGATACATT-6.02
IRF1MA0050.2chr21:5539238-5539259ATGGAGAAAATGAAAGCTAAA-6.24
IRF2MA0051.1chr21:5539242-5539260AGAAAATGAAAGCTAAAC+6.1
Lhx3MA0135.1chr21:5539772-5539785AGATAATTAATTT-6.64
Lhx3MA0135.1chr21:5540390-5540403TAATTAATTATTT+6.71
Lhx3MA0135.1chr21:5539775-5539788TAATTAATTTACC+6
Lhx3MA0135.1chr21:5540387-5540400GAATAATTAATTA-7.12
MAFFMA0495.3chr21:5539455-5539470TTGCTTAGTCAGCAC-6.74
MAFFMA0495.3chr21:5539455-5539470TTGCTTAGTCAGCAC+6.76
MAFGMA0659.1chr21:5539452-5539473TGTTTGCTTAGTCAGCACCAG-6.01
MAFKMA0496.2chr21:5539453-5539472GTTTGCTTAGTCAGCACCA-6.04
MAFKMA0496.2chr21:5539453-5539472GTTTGCTTAGTCAGCACCA+6.35
ZNF384MA1125.1chr21:5540342-5540354TTTTTTTTTAAA-7.22
Enhancer Sequence
TAGTTACTTT TTTAATTAAA CAAGGTTATT TCTTGGGATT TAAATAGATA ATTTAATCCA 60
TGAGTGTGTT TTGCTTGCTT TGATGTAACA TGTCAGCTCT GTTGTGTTAA ATGGTGCATT 120
GAAGATTGCT TTTACATCAT TGATTTAGTT TTGAAGCATT GGCATAGATG AAATTTGAGG 180
TGTTAAAATT TATTGTTTTT TTGATGTACC GCGATACAGA CATGAATAAT TTGGTATCGG 240
TTAAATAATA ATCATAACCG GTTAATATGT ACTGACGTCG TTTATCCATA TGCGTTATAT 300
GGCTCTTCTG AGTTTGCTGG ACAGTCTTTC ACTGACAGGG AAGTACATCA GAACCCAGCT 360
ATGGAGAAAA TGAAAGCTAA ACTCCCTCTC TGTGGCCCCT TTGACCTGCT GGCATGTTCA 420
TGATGTAACA TTTTATCTCC TCTCTCGGCT GTTATAGCAA TATAGTTACT TGTGAATCCA 480
GACACAAGAT GCAGAGCGAG TGTTCTCCAC CGTGTCGCCA TCTATAATAG ATCAGCTGAT 540
CACAGCGGCC GTTTAACATC AGCATTCATG TTACTGTTTG CTTAGTCAGC ACCAGAGCCG 600
CGCTGACTGT TAGAGCCAAT CACTTTTCTG TTGAATGCTC AAAAAGCATG CGGGATAATA 660
TTTACGTTTG TTTATTTGCT ATAAATGCTC CTGTTGTTTC ATGCATGTAC TTTAGTTTTG 720
TTTGATACAT TCAAAAAAGA GTTTTTATTT AAGCAGGTAA AACTAAAGGT ACAGTTGATT 780
TATCTAACTG CTTGTATTAA AGCAGTGGTC CTCAACCTGT TTATCACAGC AGACCGGTCA 840
ACACTTATAA TGTTCCTGCG GACCGGAGGT GTTTGGGTGT TCTGTGTTTG TCTGAGATAA 900
TTAATTTACC GAAATGTGTA TATTCCATAC AAGCTGAAGC TGAATGGTCA GTTGTTGTCA 960
CTCGACTCGC CGTGCACTTG TGGCATTCAT TCAACTGCGT GCATCTGGAA GGTGCGAGCG 1020
CGTTAAGCCT GCGATAACCC GTCATGTACA AAAGCCTCGT CTATTTCATG AGGTGTGCTC 1080
GCAGTTAGCA GAGGTCAGCA ACGCGGCGCA AATCGCTGCG CAAAACGCTT GCGCACACAG 1140
GCCGCTCACC TCCGCTGGAA ATGACGAACT TGATTGAACT CTAGAAAAGA CCCAATATGC 1200
AAACTGCCCC TAAAAGGCCG CTGTCATTTG CGATCTCCAG CAGTTGATCT TCTTCCACAG 1260
CCATTACCTG ATATGTTGAC ATATGGGTTG CAGATCCATT CCTTGGTAGT TCAGGGTCCT 1320
TTATTGGGTC TTTTCCCCTT AGCAAAGAAA CTTTCCAAAG ACGTCTGTTT CATACTCTTT 1380
TTGCTGCTTG TGGGTTAAAT TTGGGCACTC AAGTGACCGA GATTTAAGCC AGAAAATACA 1440
GTAATTTTTT TTCAAAATAA AAGATTTTTT TTTAAATTAA AGGTCATCAG ACTCAGATAA 1500
ATAAAACAGG AATAATTAAT TATTTCTTGT GCGGCCAGGT ACCAATTTAT CCATG 1555