EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR013-27219 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Intestine 
Coordinate
chr20:54300518-54302336 
TF binding sites/motifs
Number: 27             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Arid3bMA0601.1chr20:54300519-54300530ATATTAATTAA+6.62
Foxq1MA0040.1chr20:54302037-54302048TATTGTTTATT+6.62
HNF1AMA0046.2chr20:54301361-54301376AGTTAATGATTAAGT+6.26
HNF1AMA0046.2chr20:54301361-54301376AGTTAATGATTAAGT-6.3
Lhx3MA0135.1chr20:54300545-54300558TAATTAATTAAAC+6.19
Lhx3MA0135.1chr20:54300541-54300554TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr20:54300542-54300555AATTAATTAATTA-6.78
NR2F2MA1111.1chr20:54301734-54301745TTTGACCTTTG-6.62
Nr2f6MA0677.1chr20:54301736-54301750TGACCTTTGAGCTT-6.55
POU6F1MA0628.1chr20:54300521-54300531ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr20:54300543-54300553ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr20:54300521-54300531ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr20:54300543-54300553ATTAATTAAT-6.02
RFX1MA0509.2chr20:54301646-54301662GGTTGTCATGGAAACG+6.9
RFX1MA0509.2chr20:54301646-54301662GGTTGTCATGGAAACG-6.9
RFX2MA0600.2chr20:54301646-54301662GGTTGTCATGGAAACG+6.79
RFX2MA0600.2chr20:54301646-54301662GGTTGTCATGGAAACG-6.86
RFX3MA0798.1chr20:54301646-54301662GGTTGTCATGGAAACG+6.65
RFX3MA0798.1chr20:54301646-54301662GGTTGTCATGGAAACG-6.87
RFX4MA0799.1chr20:54301646-54301662GGTTGTCATGGAAACG+6.32
RFX4MA0799.1chr20:54301646-54301662GGTTGTCATGGAAACG-6.87
RFX5MA0510.2chr20:54301646-54301662GGTTGTCATGGAAACG+6.11
RFX5MA0510.2chr20:54301646-54301662GGTTGTCATGGAAACG-6.43
RXRBMA0855.1chr20:54301736-54301750TGACCTTTGAGCTT-6.06
RxraMA0512.2chr20:54301736-54301750TGACCTTTGAGCTT-6.04
ZNF24MA1124.1chr20:54302149-54302162AATTCATTCATTC+7.22
ZNF24MA1124.1chr20:54302153-54302166CATTCATTCATTT+7.34
Enhancer Sequence
TATATTAATT AATTCAATTT ATATAATTAA TTAATTAAAC TTTAATTATA ATGTCATTCA 60
TTCATATTCT TTTCGGCTTA GTCCCTTTAT TAATCTGGGT TTGCCACAGC GGAATGAATC 120
AACAACTTAT CCAGCTTATG TTCCATGCAG CGGATGCACT CTGAGCTGCA ACACAGTACT 180
GGGAAACACC CACACACTCT TAATGATAAT GTGAACTAAT ACAATAATAA TGTTTGTGTG 240
AGTGAGTGTT TTAGTTTGTG ATTGTGTGAC TGACTGACTG AGTGTATGTG TGTATGTTTG 300
TGAGAATGTG AGCGTGTGTT GAATGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTTAGT GTATGATTGT 360
GTGGGTGAGT GTGTGAGATT GGGTATATGT TAGTGTGTGA TTGTGTGTGT ATGTGATATT 420
GTATGACTGT GTGTACATGT GTGTGATTGA GTGAGTGACT GAGTGTTTGT GACAGAGTGA 480
GTGTGTTAGT GAATGATTGT GTGTGTGTGT GCGTGAGTGT GTTAGTGGTT GATTGTATGT 540
GTGTTTGTGT GAGCGAGAGA GTGTGTTGGT GTATGATTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT 600
GTGAGAGAGA GAGAGAGAGA GAGAGAGAGA GAGAGTGTGT TGGTGTTTGT GTGTGTGTGT 660
GTTTGCACGT GTGTGAATGT GTGTAAATGT ATGATTGTGT GTGTGTCTGA GAGAGTGTGT 720
GTTAGTGGTT GTGTATGTGT TATTGTATAA ATCAGGGTGC AGGTTAGTGA TTGTGTGTGT 780
GTGTGTGTGT GTTATTACAT GAGTCTCTCT CTGTGTGCGT GTCTCTGAGT GTGTGTATGT 840
GTTAGTTAAT GATTAAGTGT ATAACCGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT 900
GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT TAGTGATTGA GTGAGTGTGA 960
GTGTCTCCGC TCGGGGTCGT AAATGAAGGT AATCGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT 1020
GTGTGTGTGT GCTGTAGAGG CTGAACGGAG GCCGTGTCCT GATCATTTCC TCTGCCTGCC 1080
GTATTTTCCC TCCATCTATT TCCAAGATAA CAGGAAACTT CAGATGTAGG TTGTCATGGA 1140
AACGATGCGC TGGTTCGCTG CCGCTGCCTC TGAATGCGCA CGCAGATACA CTTGTTTCTC 1200
AGTGTTGGCG ACGGGCTTTG ACCTTTGAGC TTATCTTTTC TGCACTCCGG CTTGCAGCGC 1260
TCGCTTGATC GCGTCCTGAT ATGATAACAG CGAGTGTGGA GAGGAGACTG GACTCCACTG 1320
AGCATGTGCA GCACATATGA GCAGCTGTCT ATTGGTTATT CTTCATTTAT TTGGATTTTG 1380
CTTGATGTTG TGCTGTTGGT GCTTTGAAGA AAAAGGTCTT TTGTTGCTTG TTCAAACTAC 1440
TTATTTAAAA TGAGCTTAAT TCAATCTTGA TTTTTTTTAA ACAACTTAAT ATTTTTATGT 1500
TCAGTCCACT TACACTTGTT ATTGTTTATT ATTTTTATTA TTTATTGTAT CATTATCATT 1560
ATTAGCATCA TCGTTATTAT TTTTTATAAA TTTTATTATT ATTGTTTTTT AAAGTTATTT 1620
TATTTTATTG TAATTCATTC ATTCATTTTC TTTTTGGCTT AGTCCCTTTA TTAATCTGGG 1680
GTCGATACAG CGGAATGAAC CAACAACTTA TCCAACAGAT GTTTTACGCA GCAGATGACC 1740
CAGCCGTGGC TCAAACCAGC GACCTTCTTG CTGTAAGCCG AGCGTGTTAC CCACTGCGCT 1800
ACCTCGTCAC CCTTTTAT 1818