EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR013-24960 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Intestine 
Coordinate
chr20:528961-530237 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CUX1MA0754.1chr20:530198-530208TAATCGATAA+6.02
CUX2MA0755.1chr20:530198-530208TAATCGATAA+6.02
IKZF1MA1508.1chr20:529485-529497ACTTCCTGTTTT-6.74
Nkx2-5(var.2)MA0503.1chr20:530094-530105AACCACTCAAG+6.32
Enhancer Sequence
AACCAGGCTC TTTCTTCATC ACGTGCATCT GTTGTTTGTT TGGGTTTGAA CATTCAAACT 60
CATATTTTGT GGATCTTTTC AGTCTGACAG ACTTCAATAT TGAAACAGGA ATGACAATAA 120
CAGGATTATA GCAGCATCCA ACACCCTAAC ATGCAGAAAG ACACTGCTGT GTGCTCTTCA 180
CACTTGCACT AACAAGCAAA CAAACATTGA TGCATCTAAA ACAGCATTTC TGGAAGAGGC 240
AACTTGATAT AATGGCTCCA ATTTGCTTAT TAATTTGACT TTCAATTACA AATTCTGTTT 300
ATTACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACACG CACCATTGTC TCTGTGGTTG 360
AGTGGAGGGC TCTGAGACGT GGCTGTGTGT ACGTGGCCAA TATAAACCCG AGACGAAGTG 420
AGTATGCCTG TTTTCCTAAA GTCTCCATTT CTGCTGCTGG TGAATGAAGA CCCGCTGCTG 480
CTCACATATG GACCACATTC CTTCACTCCA GGCAAACACA GTCCACTTCC TGTTTTAGTA 540
GGCCGGCCAC CCGGCGTAAC ACTGATACAC TTTCACTCGC TCTCTTGGGC TGAACGACAC 600
ACTCTTATTC GGCAAGGCCT TTTTATTTCT TAAAGGGACA GTTCAGCCAA AAAGGACAAT 660
TCTGCCCTCA TTTACTCGCG TGTTTCAGAG CTTTAGGACT TGCTTTCTTC TGTTGAACAC 720
GTAAGAAGAT ATTCAGAAAA ATGTTGGAAG CCTGTAACCA TTGACTTCCG TAGTATTTGT 780
TTTTCCTACT ATGGATGATT TCGGAGCTGG GTTGGGGCTG GAAGGGCATC CGCTGTGTAA 840
AACATATGCT CGAGTAGTTG GTGGTTCATT TCACTGTGGC GACCCCTGAT GAATAAAGAG 900
ACAAAGCCTG AGGAAAATGA ATGGAAGTCA ATGCAGTAAT TTTAATTTTT GGGTGAACTG 960
TCCCTTTAAG AAATCTGCAT GTGTAAATTC TCATAGCATC CCATGTGAAA CCTGTAACCA 1020
TTGACATAGT AGGAAAAACA AATCCTATGG AAGTCAATGG TTACAGGTTT CCAGCTTTCT 1080
TCAAAATTTC TTCTTTTGTG TTCCACTGAA GACATAAACT CATAAAGGTT TGGAACCACT 1140
CAAGGGTGAG TTAGTTTTGA TTTTGAAATG AACTGTCCTT TTAATAAATA TGCATGTGTA 1200
AATTCTGATA GTGTCTGATT TCATCGTCCA TCGTTCTTAA TCGATAATTC ACCCCCCAAA 1260
AAACTCACTA TTTACT 1276