EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR013-24869 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Intestine 
Coordinate
chr2:58139373-58140320 
TF binding sites/motifs
Number: 16             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
GBX1MA0889.1chr2:58139439-58139449GCTAATTAGT-6.02
HNF1AMA0046.2chr2:58139504-58139519TATTAATTATTAATT-6.17
HOXB3MA0903.1chr2:58139439-58139449GCTAATTAGT-6.02
LHX6MA0658.1chr2:58139439-58139449GCTAATTAGT-6.02
LMX1BMA0703.2chr2:58139513-58139524TTAATTAAATT-6.32
PHOX2AMA0713.1chr2:58139514-58139525TAATTAAATTA-6.62
POU1F1MA0784.1chr2:58139741-58139755AATATGCAAATAAA+6.34
POU2F1MA0785.1chr2:58139741-58139753AATATGCAAATA+6.37
POU2F2MA0507.1chr2:58139742-58139755ATATGCAAATAAA-6.98
POU3F3MA0788.1chr2:58139741-58139754AATATGCAAATAA+6.04
POU4F1MA0790.1chr2:58139504-58139518TATTAATTATTAAT-6.15
POU4F3MA0791.1chr2:58139505-58139521ATTAATTATTAATTAA+6.37
POU5F1MA1115.1chr2:58139742-58139753ATATGCAAATA+6.02
PROP1MA0715.1chr2:58139514-58139525TAATTAAATTA+6.32
PROP1MA0715.1chr2:58139514-58139525TAATTAAATTA-6.62
Phox2bMA0681.1chr2:58139514-58139525TAATTAAATTA-6.62
Enhancer Sequence
AAACACGCTT TTATTTAAAA AAATATTTTT TATTTTAATT TAACATGCAA CGTTATTTTG 60
GTTTTAGCTA ATTAGTGCTT ATAAACAGTT TTTGGTGTCA TGAGTTAAGT AGATATAAAT 120
GATTATACTA CTATTAATTA TTAATTAAAT TACTAACACA CTGAAAAGTG AAGTACGCAT 180
TTACTGTCCA TTTTTAGGTT ATTTAATTAC AATTGCTTAC AATGCAATTT CTTACAATAT 240
CATATCTCAT ACTTGCAAAT TATTTAGGAA CTAGTTCTGG TTCCGAAAAA GTGAAGTATT 300
AGATTTCTGC ATGTGTGAAC ATGACTTTTA AACCAGTTTA CAGCTGACAT ACCCTGCAGC 360
ATTACATAAA TATGCAAATA AACATCATAT GCATAACATA CTATTGTCAA AACGTCATAG 420
TTATTTAAAA AGAGCCACAG AACGCAACAG GATTATAGTG ATAAATCACT CAAAAATGAA 480
AAATCTGTCA GTATGTATAG TTCAAAACCT GTTTTTTTCT GTTAAACACA AAAGAAGATA 540
TTTTGAAGAA TGTTGGTATG CAGCAGCTAC TGACATTCAG GATATCTTTG CTTTTTCACA 600
GACTATGGAC GTGAATGTAA ATCTGGCATA CTTTAATAAA TCTTCTTTAG TGTTTAACAG 660
AAAATAAAGA ATTTACAAAT GATTGTAATT ACTTGAGGAA GACTTAAAGT GTGTTTTCAT 720
ATGTTGGTGA ACTGTCCCTT TAATAAAAAA TGGCGTTTCA TATACTTTAC ATTGAAATCA 780
TTACAAGAAA GCTTGAAGCT GAATAGTTTC CTCGACTCTG GTTATATATA AAGCACTTTT 840
AAAACTGCTG TAAACGGACA ACAATATTAA AGAAGACTAA AAACTAAATC AAAACAAACG 900
ACAGAGACTT TTAAAGGCAA CAAAAAAGCG AATGCGATAT TACGTTC 947