EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR013-22919 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Intestine 
Coordinate
chr2:2896702-2897772 
TF binding sites/motifs
Number: 14             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr2:2897321-2897338TGCATTAATTAATTTAT+6.27
ArxMA0874.1chr2:2897321-2897338TGCATTAATTAATTTAT-6.99
ArxMA0874.1chr2:2897320-2897337GTGCATTAATTAATTTA+7.84
FOXA1MA0148.4chr2:2896773-2896789TTCTGTTTACTTAATG-6.58
FOXP1MA0481.2chr2:2896773-2896785TTCTGTTTACTT-7.22
FOXP2MA0593.1chr2:2896774-2896785TCTGTTTACTT-6.32
Gata4MA0482.1chr2:2896764-2896775TCTTATCTCTT+6.02
Gata4MA0482.1chr2:2897432-2897443TCTTATCTCTT+6.02
Lhx3MA0135.1chr2:2897323-2897336CATTAATTAATTT-6.54
Nkx3-2MA0122.3chr2:2897288-2897301ATAAACACTTAAG+6
Nr2f6MA0677.1chr2:2897030-2897044TAGGTCAAAGGTGA+6.11
POU6F1MA0628.1chr2:2897324-2897334ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr2:2897324-2897334ATTAATTAAT-6.02
RXRGMA0856.1chr2:2897030-2897044TAGGTCAAAGGTGA+6.03
Enhancer Sequence
CCCTTTGACT GAGTGCATGT TTTAAAAAGA GGACACCCTG GCTCTAAATC AAGAGAGTAA 60
ACTCTTATCT CTTCTGTTTA CTTAATGGAG ATTGGATCTG TTCCTCACTT AACAATTCTA 120
AATAATTGAC TATATGATGA TTTTAATGAA CCAAAACTGA AATGTAATGA AAATTACGTC 180
ATCATTTGCT TCTCTTTCTT CTGTTGAACA TAAAAGAAGA TGTTTCGAAG AATGTTGGAA 240
ACCAGTAACC ATTGACTTCC ATAGTAGGAA AAACAAACAC TATGGAAGTC AATGGTTTTT 300
ATTTTGTGTA CAATAGAATA AACTGAAATA GGTCAAAGGT GAGGAATGAT GACCGAATTT 360
TCATTTTTGC GTGAACTATC CCAGGTTACA ATGCGTTTAC TCACTTTTGA AGTCAATAAT 420
TGCTGTTAAA AGTGTGTTTA AAGTCTCTGT ATTGTACATA TTAATAACTA AAAAGTACAA 480
AATGTATCTT GTGAAAGGGT GCTTACAGGA TGTAAATGGT ACAGGTTTTC AGTTTCTTTG 540
AAATATCTTT AAATGTGTTT AATGGATGGA AGAAACAATA CGGTTTATAA ACACTTAAGG 600
GAGAGTAAAA ATGAGTATGT GCATTAATTA ATTTATTTAT TCATTTATTA AAATTTTAGG 660
GGTGAATTCC CTTTAATTGA GTGTATTTCT CAAAAAGGGA ACACCCTGGC TCTAAATCAA 720
GAGAGTAAAC TCTTATCTCT TCTGTTTTCT TATTTGAGAT CAGATCTGTT TGGAAATTGA 780
CCTCACTTAA CACTTCTGAA TAATTGACAT TTTGATGATT TTAATGAGCC AAAACTGAAA 840
CGTAATGAAA ATTATGTCAT CGTTTGCTTC TCTTTCCTCT GAAGAAGATG TTTTGAAGAA 900
TGTTGGAAAC TGGTAACCTC TGACTTCCTT AGTATTTGTA TTTCCTACTA TGGATGTAAA 960
TGGTTACAGG TTTTCAGTTT CTTTAAAATA TCTTCATTTG TGTCCAACAG ATGAAAGAAA 1020
CTTATTAGGT TTATAAGCAC TTAGAATTTT TTAAAAAGGG AACACCCTGG 1070